血管紧张素转化酶抑制剂与牛血清白蛋白的相互作用的研究

发布时间：2017-05-01 04:00

  本文关键词：血管紧张素转化酶抑制剂与牛血清白蛋白的相互作用的研究，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：运用光谱法分别研究了四种血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)与牛血清白蛋白(Bovine Serum Albumin,BSA)的相互作用机制,并用计算机模拟技术对相互作用机制进行微观的预测和解释。前者能了解并表征ACEIs与BSA的作用的关键参数,后者在分子水平上探讨四种ACEIs与BSA的结合作用力及其立体空间构象等,预测相互作用的本质。首先,利用荧光光谱法(Fluorescence Spectroscopy)成功研究了ACEIs与BSA的猝灭机制(Quenching Mechanism)、结合常数(Binding Constant),结合位点数(Number Of Binding Site,n),结合位点(Binding Site),热力学常数(Thermodynamic Constant),作用力类型(Binding Force)等参数。最后根据大量实验数据分别计算了四种ACEIs与BSA结合过程的驱动力,研究结果显示:ACEIs与BSA的结合过程均为低温自发并放热的焓驱动过程。随后,采用同步荧光光谱法(Synchronous Fluorescence Spectroscopy)、圆二色谱法(Circular Dichroism,CD)以及红外光谱法(Infrared Spectroscopy,IR)共同研究四种ACEIs与BSA结合对BSA的二级结构的影响,从不同的角度相互佐证。结果显示ACEIs与BSA结合后,BSA的二级结构均发生了微小改变。最后,运用Gaussian 03W(Gaussian Inc.,Wallingford,USA)对ACEIs分子结构进行优化,生成能量最小的立体构型并用频率验证优化结果的正确性。运用NAMD在水和离子环境中优化BSA晶体结构,生成在水环境中能量更低的结构,更贴近实验的水环境。最后利用对接软件AutoDock 4.2(The Scripps Research Institute,USA)将优化好的ACEIs分子和BSA分子分别进行模拟计算。得以从分子角度预测ACEIs与BSA的相互作用的力与形态。研究结果显示:ACEIs均结合在BSA的Site I位点,主要作用力是氢键和范德华力,与实验数据一致。
【关键词】：血管紧张素转化酶抑制剂 BSA 构象变化 分子模拟
【学位授予单位】：浙江工业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R969.2
【目录】：

• 摘要4-6
• ABSTRACT6-10
• 第一章 绪论10-21
• 1.1 高血压及其治疗药物10-13
• 1.1.1 赖诺普利11
• 1.1.2 依那普利11-12
• 1.1.3 喹那普利12-13
• 1.1.4 雷米普利13
• 1.2 血清蛋白的简介13-17
• 1.2.1 人血清白蛋白结构14-15
• 1.2.2 牛血清白蛋白结构15
• 1.2.3 人血清白蛋白与牛血清白蛋白比较15-17
• 1.3 计算机模拟技术在药物与蛋白质相互作用研究中的应用17-19
• 1.4 研究意义19
• 1.5 本论文的设计思想19-21
• 第二章 血管紧张素转化酶抑制剂与牛血清白蛋白研究21-42
• 2.1 前言21
• 2.2 实验部分21-23
• 2.2.1 试剂和仪器21-22
• 2.2.2 牛血清白蛋白溶液和药物溶液的配制22
• 2.2.3 荧光光谱22
• 2.2.4 紫外-可见光谱22
• 2.2.5 同步荧光光谱22-23
• 2.2.6 圆二色光谱23
• 2.2.7 红外光谱23
• 2.3 结果与讨论23-41
• 2.3.1 药物对牛血清白蛋白的荧光猝灭分析23-24
• 2.3.2 药物猝灭牛血清白蛋白荧光的猝灭机理24-27
• 2.3.3 结合常数以及结合位点数27-30
• 2.3.4 结合位点确定30-33
• 2.3.5 药物与牛血清白蛋白结合的热力学参数和作用力类型33-34
• 2.3.6 牛血清白蛋白构象变化研究34-41
• 2.4 本章小结41-42
• 第三章 计算机分子模拟42-58
• 3.1 分子模拟软件简介42-43
• 3.1.1 Gaussian简介42
• 3.1.2 NAMD简介42
• 3.1.3 Autodock简介42-43
• 3.2 实验部分43-44
• 3.2.1 药物分子构象优化43
• 3.2.2 牛血清白蛋白结构优化43
• 3.2.3 药物与牛血白清蛋白对接43-44
• 3.3 结果与讨论44-57
• 3.3.1 药物结构优化结果44-49
• 3.3.2 牛血清白蛋白分子优化结果49
• 3.3.3 药物与牛血清白蛋白分子对接结果49-57
• 3.4 本章小结57-58
• 第四章 结论与展望58-60
• 4.1 结论58-59
• 4.2 展望59-60
• 第五章 参考文献60-66
• 致谢66-67
• 攻读学位期间发表的学术论文目录67

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