基于计算模拟与光谱法研究细胞色素CYP2C9与双酚A的相互作用

发布时间：2024-03-05 06:11

　　基于分子对接、分子动力学模拟、紫外吸收光谱法、荧光光谱法与红外光谱法,研究了细胞色素CYP2C9与双酚A (BPA)之间的相互作用。分子对接研究表明,对接位点位于Thr364附近的空腔,结合能为-7. 51 kcal/mol;分子动力学模拟观察了10 ns内蛋白的整体构象变化,发现Thr364也是BPA与CYP2C9发生相互作用时的结合位点。光谱学研究发现CYP2C9与双酚A结合发生荧光增强现象,并且它们间的相互作用力主要为疏水作用力;二级结构中β-转角、无规则卷曲与β-折叠等也发生明显变化;随着底物浓度增加紫外吸收峰有明显上升且伴随红移。模拟计算与光谱检测均表明CYP2C9与BPA间存在较强的相互作用。

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【部分图文】：

图1BPA与CYP2C9的分子对接结果图

使用分子动力学模拟技术可以研究BPA与CYP2C9发生相互作用时的动力学情况，并进一步验证对接结果的准确性，对小分子BPA与CYP2C9蛋白进行10ns的分子动力学模拟。通过对BPA与CYP2C9相互作用过程的均方根偏差(RMSD)、均方根波动(RMSF)与回旋半径(Rg)进行....

图2游离态CYP2C9与复合物BPA-CYP2C9的RMSF(A),RMSD(B),Rg(C)

图1BPA与CYP2C9的分子对接结果图2.3双酚A与CYP2C9作用的荧光光谱与结合常数

图3310K下BPA与CYP2C9相互作用的荧光光谱图

其中△F=F-F0，△F∞=F∞-F0式中，F0为CYP2C9的初始荧光强度;F为BPA与CYP2C9溶液发生相互作用后的荧光强度;△F∞为BPA与CYP2C9溶液相互作用饱和时的值;K为BPA与CYP2C9的结合常数;Q为BPA的浓度。以1/△F对1/Q绘图。经计算分析得结合常....

图4BPA与CYP2C9相互作用的紫外吸收光谱图

紫外吸收光谱可用于检测配体小分子是否与蛋白质形成复合物，其变化值可以反应蛋白质二级结构的变化[13]。如图4所示，可以判断BPA与CYP2C9的复合物存在2个吸收峰，第1个位于210nm附近，第2个峰位于250～260nm之间，随着BPA浓度的上升，吸收峰值不断上升且存在红移....

本文编号：3919806