茶树CsAAPs和CsLHTs亚家族基因的克隆与表达分析
发布时间：2021-01-24 06:43
茶树是重要的叶用经济作物,对氮素的需求量较大,因此了解氮素的吸收、转运及其分布规律对于提高茶叶产量、提升茶叶品质均有重要作用。氨基酸是茶叶的重要品质成分,也是茶树体内核酸、叶绿素、线粒体以及次生代谢等物质的氮素来源,参与植物体内的多种生理过程,氨基酸转运蛋白在这些过程中发挥着极其重要的作用。本研究对茶树氨基酸转运蛋白家族中的两个关键亚家族氨基酸通透酶（Amino acid permeases,AAPs）和赖氨酸组氨酸转运蛋白（Lysine-histidine transporters,LHTs）的基因进行克隆和生物信息学分析,并对这两个家族基因在不同品种、组织部位、氮素水平以及氮素处理时间下的表达模式进行探究,以期发现受氮素水平调控表达的重要的茶树氨基酸转运蛋白基因,为进一步研究茶树中氨基酸转运规律及氮高效品种选育提供研究基础。本研究主要结论如下:1.根据茶树转录组信息,克隆得到5个茶树CsAAPs亚家族基因,即CsAAP3、CsAAP4、CsAAP6、CsAAP7和CsAAP8,并将序列提交至NCBI数据库中。氨基酸序列比对结果表明5个CsAAPs基因的序列同源性较高,均含有9-10...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术线路图
图 2-1 茶树 CsAAPs 基因克隆电泳图Fig.2-1 The electrophoresis results of the clone of CsAAPs in tea plants注：A：CsAAP3，B：CsAAP4，C：CsAAP6，D：CsAAP7，E：CsAAP8Note: A: CsAAP3, B: CsAAP4, C: CsAAP6, D: CsAAP7, E: CsAAP8序，发现克隆得到的序列与转录组数据库中的 ORF 序列大小一致表 2-1 所示的 CsAAPs 序列功能预测的基本信息及 Blast 结果，将P3、CsAAP4、CsAAP6、CsAAP7 和 CsAAP8，并将序列提交至 N号分别为 CsAAP3（MK532959）、CsAAP4（MK532960）、CsAAP32962）和 CsAAP8（MK532963）。组（Wei. et al., 2018）中以“amino acid permease”为条件进行搜酸通透酶的序列，其中 63 条注释信息为 amino acid permease 7，ease 2，1 条注释信息为 amino acid permease 8，2 条注释信息为 ami族与 CSS 基因组序列（Wei et al., 2018）进行了比对验证，各基编 号 分 别 为 Scaffold3879:394084:396743 、 Scaffold4449:317697:219993、Scaffold694:1372452:1390756 和 Scaffold2943:104、CsAAP7 和 CsAAP8 比对到的序列片段长度分别为 1452、1467、及以上。同时发现在 CSS 基因组中，CsAAP6 序列比对上的片段
CsAAPs亲/疏水性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物吸收运转氨基酸的分子机制进展[J]. 陈展宇,陈天鹏,李慧杰,崔喜艳. 分子植物育种. 2017(12)
[2]植物氨基酸转运蛋白的研究进展[J]. 彭波,孙艳芳,庞瑞华,宋晓华,李慧龙,周棋赢,袁红雨,宋世枝. 热带作物学报. 2016(06)
[3]拟南芥AAP基因家族的生物信息学分析[J]. 范贝,刘明晓,李慧杰,张雪,王晓梅,崔喜艳. 生命的化学. 2016(03)
[4]拟南芥无机氮素转运蛋白及其磷酸化调控研究进展[J]. 张曦,林金星,单晓昳. 植物学报. 2016(01)
[5]松阳茶园土壤酸化状况及其改良措施[J]. 钱园凤,郑得林,周斌,张绍珊. 中国茶叶加工. 2015(02)
[6]高等植物氮素转运蛋白研究进展[J]. 马清,管超,夏曾润,王茜,王锁民. 兰州大学学报(自然科学版). 2015(02)
[7]逆境胁迫条件下脯氨酸对植物生长的影响[J]. 朱虹,祖元刚,王文杰,阎永庆. 东北林业大学学报. 2009(04)
[8]蛋白质磷酸化修饰的研究进展[J]. 姜铮,王芳,何湘,刘大伟,陈宣男,赵红庆,黄留玉,袁静. 生物技术通讯. 2009(02)
[9]外源GABA对NaCl胁迫下中间锦鸡儿幼苗乙烯生成的调控作用[J]. 史胜青,齐力旺,肖文发,李春秀,林萍,张守攻. 林业科学. 2008(09)
[10]信阳毛尖茶的化学成分[J]. 郭桂义,胡孔锋,袁丁. 食品科技. 2006(09)
硕士论文
[1]不同氮效率茶树品种氮素吸收利用相关基因表达模式探究[D]. 刘圆.中国农业科学院 2016
[2]γ-氨基丁酸对烟草乙烯合成基因及乙烯信号组分基因表达的调节[D]. 马兆武.中南民族大学 2009
[3]不同品种茶树氮素营养差异及其机制的研究[D]. 王新超.中国农业科学院 2003
本文编号：2996780
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术线路图
图 2-1 茶树 CsAAPs 基因克隆电泳图Fig.2-1 The electrophoresis results of the clone of CsAAPs in tea plants注：A：CsAAP3，B：CsAAP4，C：CsAAP6，D：CsAAP7，E：CsAAP8Note: A: CsAAP3, B: CsAAP4, C: CsAAP6, D: CsAAP7, E: CsAAP8序，发现克隆得到的序列与转录组数据库中的 ORF 序列大小一致表 2-1 所示的 CsAAPs 序列功能预测的基本信息及 Blast 结果，将P3、CsAAP4、CsAAP6、CsAAP7 和 CsAAP8，并将序列提交至 N号分别为 CsAAP3（MK532959）、CsAAP4（MK532960）、CsAAP32962）和 CsAAP8（MK532963）。组（Wei. et al., 2018）中以“amino acid permease”为条件进行搜酸通透酶的序列，其中 63 条注释信息为 amino acid permease 7，ease 2，1 条注释信息为 amino acid permease 8，2 条注释信息为 ami族与 CSS 基因组序列（Wei et al., 2018）进行了比对验证，各基编 号 分 别 为 Scaffold3879:394084:396743 、 Scaffold4449:317697:219993、Scaffold694:1372452:1390756 和 Scaffold2943:104、CsAAP7 和 CsAAP8 比对到的序列片段长度分别为 1452、1467、及以上。同时发现在 CSS 基因组中，CsAAP6 序列比对上的片段
CsAAPs亲/疏水性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物吸收运转氨基酸的分子机制进展[J]. 陈展宇,陈天鹏,李慧杰,崔喜艳. 分子植物育种. 2017(12)
[2]植物氨基酸转运蛋白的研究进展[J]. 彭波,孙艳芳,庞瑞华,宋晓华,李慧龙,周棋赢,袁红雨,宋世枝. 热带作物学报. 2016(06)
[3]拟南芥AAP基因家族的生物信息学分析[J]. 范贝,刘明晓,李慧杰,张雪,王晓梅,崔喜艳. 生命的化学. 2016(03)
[4]拟南芥无机氮素转运蛋白及其磷酸化调控研究进展[J]. 张曦,林金星,单晓昳. 植物学报. 2016(01)
[5]松阳茶园土壤酸化状况及其改良措施[J]. 钱园凤,郑得林,周斌,张绍珊. 中国茶叶加工. 2015(02)
[6]高等植物氮素转运蛋白研究进展[J]. 马清,管超,夏曾润,王茜,王锁民. 兰州大学学报(自然科学版). 2015(02)
[7]逆境胁迫条件下脯氨酸对植物生长的影响[J]. 朱虹,祖元刚,王文杰,阎永庆. 东北林业大学学报. 2009(04)
[8]蛋白质磷酸化修饰的研究进展[J]. 姜铮,王芳,何湘,刘大伟,陈宣男,赵红庆,黄留玉,袁静. 生物技术通讯. 2009(02)
[9]外源GABA对NaCl胁迫下中间锦鸡儿幼苗乙烯生成的调控作用[J]. 史胜青,齐力旺,肖文发,李春秀,林萍,张守攻. 林业科学. 2008(09)
[10]信阳毛尖茶的化学成分[J]. 郭桂义,胡孔锋,袁丁. 食品科技. 2006(09)
硕士论文
[1]不同氮效率茶树品种氮素吸收利用相关基因表达模式探究[D]. 刘圆.中国农业科学院 2016
[2]γ-氨基丁酸对烟草乙烯合成基因及乙烯信号组分基因表达的调节[D]. 马兆武.中南民族大学 2009
[3]不同品种茶树氮素营养差异及其机制的研究[D]. 王新超.中国农业科学院 2003
本文编号：2996780
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/2996780.html
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