黔灵山公园猕猴（Macaca mulatta）种群遗传学研究

发布时间：2020-04-11 04:54

【摘要】：黔灵山公园是贵阳市内一个典型的“城市岛屿”,黔灵山公园猕猴(Macaca mulatta)种群是已被隔离了60年的,由1958年从贵阳市防疫站和贵阳医学院逃逸到黔灵山公园内的6-8只猕猴形成的小种群发展而来,1985年猕猴种群数量为30只,上个世纪80年代末开始进行人工投喂猴群食物,在此之后黔灵山公园猕猴种群数量快速增长。2017年野外调查结果显示,黔灵山公园猕猴种群数量达1123只。近30年来,虽然黔灵山公园猕猴种群数量得到明显的恢复,但是其遗传背景,以及种群遗传多样性的状况没有相关研究进行过准确评估。因此,本研究旨在对黔灵山公园猕猴种群的遗传多样性、遗传结构、种群动态等内容进行探讨。得到主要结果:1)本研究根据自从2011年9月开始对黔灵山公园猕猴种群进行长期观察的数据发现,目前黔灵山公园现存猕猴种群数量为1123只,分为6个小群。从80年代末黔灵山公园内开始人工投食后,共记录到人工投食的食物种类29种,各猴群的日均投食总量超过20kg,已基本能够满足猴群的生存需要。2)采集108号新鲜粪便样品,成功扩增出了104份线粒体控制区(D-loop区)的特异性产物,基于线粒体控制区分子标记水平,检测黔灵山公园猕猴种群遗传多样性及遗传结构发现:黔灵山公园猕猴种群单倍型多样性(h)为0.614,核苷酸多样性(pi)为0.02617,遗传多样性处于中等水平;104个猕猴个体共检测到7个单倍型,其中单倍型3是最先形成的单倍型;基于马尔科夫链的蒙特卡洛方法,贝叶斯系统分析结果显示104个黔灵山公园猕猴个体在遗传上聚为3个支系,这与从Genebank上下载的来自中国267条猕猴的线粒体D-loop区序列和104黔灵山公园猕猴序列共同构建的ML系统发育树结果一致,表明黔灵山公园猕猴种群的遗传背景极可能来自3个地理单元;分子方差分析(AMOVA)和在Structure群体遗传结构分析显示黔灵山公园猕猴现存种群的遗传结构稳定,没有出现遗传分化现象,各群体间存在一定程度的基因交流现象,基因流值在(0.91458-6.66900)之间。3)本研究成功筛选出6个高多态性(PIC0.5)微卫星位点,基于微卫星分子标记水平对黔灵山公园现存猕猴种群遗传学检测显示:6对微卫星引物在108个猕猴个体中共检测到77个等位基因,平均种群观察杂合度值为0.644,遗传多样性处于中等水平;黔灵山公园猕猴一直生活在黔灵山公园“城市岛屿”生境中,整个种群存在低到中度的近亲交配现象,这极可能是由于长达60余年的隔离,导致无外来个体的迁入,同时也缺乏扩散机会和途径;而且弥猴的社会结构是一夫多妻的婚配制度,猴王优先具有交配权,导致其它雄猴交配机会少。现存有效种群数量为177,满足保护生物学中哺乳动物较高概率的中期或长期存活目标。
【图文】：

黔灵山公园猕猴人类喂食图

3.1 研究对象及样品采集3.1.1 研究对象贵阳市黔灵山公园内半野生猕猴种群3.1.2 样品采集从 2017 年 10 月开始采样工作，，一个星期连续三天采样，每天观察午 8 点开始到下午 18 点结束，粪便采集时间主要集中在早上 9 点到 1115 点到 18 点，因为这段时间是人工投食高峰期，投食后 1-2 小时内猕便行为，特别是在激烈的打斗后。为了避免重复采样，一天只尾随采集的粪便样品，并区分粪便的颜色、大小、形状，两份样品相距少于 1.5一个体的粪便，不采集。投食人会选择在平缓的空地进行投食，方便观排便情况，采集的样品均为排出体外 2 小时以内的新鲜猕猴粪便（图 2
【学位授予单位】：贵州师范大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：Q953

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本文编号：2623179