基于5个免疫基因序列的金线鲃属鱼类分子系统发育和选择压力分析
发布时间：2021-01-02 18:49
金线鲃属（Sinocyclocheilus）隶属于鲤形目（Cypriniformes）鲤科（Cyprinidae）鲃亚科（Barbinae）,是中国特有属鱼类。该属鱼类与洞穴联系密切,分化强烈,物种数多。基于形态学和不同分子标记对金线鲃属鱼类系统发育的研究还存在一定的争议,因此金线鲃属鱼类的系统发育关系并没有完全解决。同时,大量研究表明,天然免疫基因通过启动模式识别受体和干扰素等细胞因子对外界病原体进行识别以及参与免疫应答过程,在生物进化历程中,免疫基因会受到环境的选择作用,受到正选择压力的基因可使物种或个体更具繁殖和生存上的优势。目前尚未见金线鲃属鱼类免疫基因选择压力的相关研究,因此基于免疫基因序列对金线鲃属鱼类进行选择压力分析有利于了解金线鲃属鱼类的适应性进化问题。本研究通过PCR直接测序法一共获得了16种金线鲃属鱼类IFIH1、NOD1基因的编码区部分序列（有效长度327bp、174bp）、22种金线鲃属鱼类IRF-2、TLR4的基因编码区部分序列（有效长度123bp、450bp）、23种金线鲃属鱼类TLR7基因的编码区部分序列（有效长度504bp）。通过分析它们的合并数据集对所...
【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１麻花金线耙形态学左侧Ｃ引自刘涛）??
金线鈀的很多性状也表现出与洞穴生活的高度适应性。金线鈀洞穴种与环境的高度适应??性具体表现在体表色素的缺失、眼睛的退化、头部形态变化和体鱗的变化等形态学方面，??因而金线鈀地表种与洞穴种在形态特征上存在明显差异，以图１－１地表种麻花金线鈀??（ｉＳ＇．ｆｆｊａｃｉ／ｔｏｗｓ）和图１－２洞穴种鹰嗓角金线（Ｘａｇｗ／Ｚｚｏｒｗｅｓ）鱼巴为例。??图１－１麻花金线耙形态学左侧Ｃ引自刘涛）??麻花金线鈀形态特征简介：体侧扁，头背部无明显隆起，但背部稍隆起；头侧扁，??３??
早期的金线鈀系统发育主要基于形态学，单乡红等研宄结果证明金线鈀鱼类为一个??单源群，小眼金线鈀类群是金线鈀首先分化出的类群，大鱗金线鈀类群和抚仙金线鈀类??群为姐妹群并且在小眼金线鈀之后才分化出（图１－３）?［４Ｇ］。??Ｐ???ｍ??－?ｒｆｆｆｌ?卜大鱗金载类群????１１?Ａ?Ｓｉｍｋｊｉｉｏｃｈｉ＇ｉｌｕｓ??＿?Ｌ?■?４ｉ－＋｜?觀金＿＿?伽咖＿??丨?ｎ?ｎ??Ｂ?／Ｖ，ｉ／／／ｒ（ｗ／ｉ＞ｓｕｂｇｅｉｉ，?ｎｏｖ??图１－３金线鈀属的系统发育图（引自单乡红等）??王大忠等研宄结果证明，金线鈀鱼类为一个单源群，与四须鈀亲缘关系较近（图??１－４?），与裂腹鱼有相似的染色体倍性［４｜１。??５??
【参考文献】：
期刊论文
[1]云南金线鲃属一新种——版纳金线鲃[J]. 李维贤,李春青,陈泓宇. 吉首大学学报(自然科学版). 2019(01)
[2]康乐黄鸡TLR7基因多态性及血清INF-γ水平相关性研究[J]. 王文浩,胡琳玉,彭秋玲,赖人豪,程钰. 黑龙江畜牧兽医. 2018(17)
[3]鸡TLR3、TLR4和TLR21单核苷酸多态性的生物信息分析[J]. 张健,郝文文,刘路,张传生,王亚琪,张欢欢,耿立英,李祥龙. 中国家禽. 2018(08)
[4]NOD1 rs2075819A>G和rs2075820G>A遗传变异与肺癌发病的关系[J]. 董静,杨振邦,刘冲,刘睿,张雪梅,张志. 山东医药. 2018(13)
[5]基于线粒体16S rRNA、COX1和Cytb基因探讨11种小丑鱼的系统发育关系[J]. 何丽斌,陈芳,朱志煌,马敏宁,张河长,吴孙龙,周宸. 福建农业学报. 2018(03)
[6]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 张媛媛,宋理平. 河北渔业. 2018(02)
[7]鱼类免疫应答机制研究进展[J]. 白姗姗,贾智英,石连玉. 水产学杂志. 2017(04)
[8]云南金线鲃属鱼类一新种——文山金线鲃[J]. 杨洪福,李春青,陈艳艳,李维贤. 云南大学学报(自然科学版). 2017(03)
[9]绵羊Toll样受体7基因多态性分析[J]. 梁田,杨霞,张勋,肖媛媛,陈新凯,宋佳玮,盛金良. 江苏农业科学. 2017(08)
[10]云南省洞穴盲金线鲃一新种——额凸盲金线鲃[J]. 杨洪福,李春青,李维贤. 吉首大学学报(自然科学版). 2017(02)
硕士论文
[1]赤眼鳟Toll样受体7和9基因的克隆与表达[D]. 金生振.湖南农业大学 2017
[2]草鱼TLR基因鉴定及三个TLR基因免疫功能初步研究[D]. 黄文吉.上海海洋大学 2017
[3]草鱼IRF-2下调IFN、PKR、PKZ转录的分子机制[D]. 谷美慧.南昌大学 2015
[4]食肉目TLR1,2和4基因的分子进化初步研究[D]. 刘伟.四川农业大学 2014
[5]滇池金线鲃三个免疫相关基因的克隆鉴定与免疫应答研究[D]. 纪森林.昆明理工大学 2014
[6]鱼类TLR9及TfR基因的分子进化分析[D]. 朱志煌.浙江海洋学院 2014
[7]中国汉族人群中IFIH1基因多态性与1型糖尿病的相关性研究[D]. 杨慧.南京医科大学 2011
[8]鸡TLR4和Mx基因遗传变异及其表达规律分析[D]. 刘艳.扬州大学 2011
[9]鸡TLR7基因SNP筛选及遗传多态性分析[D]. 毛兴家.湖南农业大学 2009
本文编号：2953444
【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１麻花金线耙形态学左侧Ｃ引自刘涛）??
金线鈀的很多性状也表现出与洞穴生活的高度适应性。金线鈀洞穴种与环境的高度适应??性具体表现在体表色素的缺失、眼睛的退化、头部形态变化和体鱗的变化等形态学方面，??因而金线鈀地表种与洞穴种在形态特征上存在明显差异，以图１－１地表种麻花金线鈀??（ｉＳ＇．ｆｆｊａｃｉ／ｔｏｗｓ）和图１－２洞穴种鹰嗓角金线（Ｘａｇｗ／Ｚｚｏｒｗｅｓ）鱼巴为例。??图１－１麻花金线耙形态学左侧Ｃ引自刘涛）??麻花金线鈀形态特征简介：体侧扁，头背部无明显隆起，但背部稍隆起；头侧扁，??３??
早期的金线鈀系统发育主要基于形态学，单乡红等研宄结果证明金线鈀鱼类为一个??单源群，小眼金线鈀类群是金线鈀首先分化出的类群，大鱗金线鈀类群和抚仙金线鈀类??群为姐妹群并且在小眼金线鈀之后才分化出（图１－３）?［４Ｇ］。??Ｐ???ｍ??－?ｒｆｆｆｌ?卜大鱗金载类群????１１?Ａ?Ｓｉｍｋｊｉｉｏｃｈｉ＇ｉｌｕｓ??＿?Ｌ?■?４ｉ－＋｜?觀金＿＿?伽咖＿??丨?ｎ?ｎ??Ｂ?／Ｖ，ｉ／／／ｒ（ｗ／ｉ＞ｓｕｂｇｅｉｉ，?ｎｏｖ??图１－３金线鈀属的系统发育图（引自单乡红等）??王大忠等研宄结果证明，金线鈀鱼类为一个单源群，与四须鈀亲缘关系较近（图??１－４?），与裂腹鱼有相似的染色体倍性［４｜１。??５??
【参考文献】：
期刊论文
[1]云南金线鲃属一新种——版纳金线鲃[J]. 李维贤,李春青,陈泓宇. 吉首大学学报(自然科学版). 2019(01)
[2]康乐黄鸡TLR7基因多态性及血清INF-γ水平相关性研究[J]. 王文浩,胡琳玉,彭秋玲,赖人豪,程钰. 黑龙江畜牧兽医. 2018(17)
[3]鸡TLR3、TLR4和TLR21单核苷酸多态性的生物信息分析[J]. 张健,郝文文,刘路,张传生,王亚琪,张欢欢,耿立英,李祥龙. 中国家禽. 2018(08)
[4]NOD1 rs2075819A>G和rs2075820G>A遗传变异与肺癌发病的关系[J]. 董静,杨振邦,刘冲,刘睿,张雪梅,张志. 山东医药. 2018(13)
[5]基于线粒体16S rRNA、COX1和Cytb基因探讨11种小丑鱼的系统发育关系[J]. 何丽斌,陈芳,朱志煌,马敏宁,张河长,吴孙龙,周宸. 福建农业学报. 2018(03)
[6]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 张媛媛,宋理平. 河北渔业. 2018(02)
[7]鱼类免疫应答机制研究进展[J]. 白姗姗,贾智英,石连玉. 水产学杂志. 2017(04)
[8]云南金线鲃属鱼类一新种——文山金线鲃[J]. 杨洪福,李春青,陈艳艳,李维贤. 云南大学学报(自然科学版). 2017(03)
[9]绵羊Toll样受体7基因多态性分析[J]. 梁田,杨霞,张勋,肖媛媛,陈新凯,宋佳玮,盛金良. 江苏农业科学. 2017(08)
[10]云南省洞穴盲金线鲃一新种——额凸盲金线鲃[J]. 杨洪福,李春青,李维贤. 吉首大学学报(自然科学版). 2017(02)
硕士论文
[1]赤眼鳟Toll样受体7和9基因的克隆与表达[D]. 金生振.湖南农业大学 2017
[2]草鱼TLR基因鉴定及三个TLR基因免疫功能初步研究[D]. 黄文吉.上海海洋大学 2017
[3]草鱼IRF-2下调IFN、PKR、PKZ转录的分子机制[D]. 谷美慧.南昌大学 2015
[4]食肉目TLR1,2和4基因的分子进化初步研究[D]. 刘伟.四川农业大学 2014
[5]滇池金线鲃三个免疫相关基因的克隆鉴定与免疫应答研究[D]. 纪森林.昆明理工大学 2014
[6]鱼类TLR9及TfR基因的分子进化分析[D]. 朱志煌.浙江海洋学院 2014
[7]中国汉族人群中IFIH1基因多态性与1型糖尿病的相关性研究[D]. 杨慧.南京医科大学 2011
[8]鸡TLR4和Mx基因遗传变异及其表达规律分析[D]. 刘艳.扬州大学 2011
[9]鸡TLR7基因SNP筛选及遗传多态性分析[D]. 毛兴家.湖南农业大学 2009
本文编号：2953444
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