乳腺癌ceRNA生物信息学分析与SSP411基因功能验证
发布时间：2021-01-17 18:21
目的:随着对乳腺癌发病机制的进一步了解,有许多与乳腺癌相关的信号通路和治疗靶点被发现。本研究通过使用生物信息学分析以及实验验证发现竞争性内源RNA（ceRNA）网络与SSP411基因对于乳腺癌的发生和发展有影响。方法:1.从肿瘤基因组图谱（TCGA）数据库下载芯片数据,在R软件上分析得到差异的长链非编码RNA（lncRNA）,构建ceRNA网络并进行GO和KEGG的富集分析。通过考虑每个与预后相关的lncRNA的功效,在多变量Cox回归分析中拟合与预后相关lncRNA,构建风险评分模型。2.构建SSP411敲除载体,通过细胞转染将构建好的载体转入乳腺癌细胞SKBR3中,筛选获得SSP411敲除的稳定表达细胞株SKBR3-SSP411-/-,通过Real-time PCR及Western Blot等实验手段,根据基因表达结果、蛋白表达结果及细胞验证的实验结果来探究SSP411对于乳腺癌细胞SKBR3的影响。结果:1.本研究结果显示,有5个lncRNA与乳腺癌的预后相关。这五个lncRNA不仅在ceRNA网络中处于关键节点,而且与乳腺癌患者的总体预后生存也相关。2.成...
【文章来源】：桂林医学院广西壮族自治区
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
mRNA差异表达分析及KEGG富集分析
图 2 lncRNA 差异表达分析Figure 2 Differential expression of lncRNA热图显示，与正常组织相比，乳腺癌组织中有 106 种异常表达的 lncRNA。他们被认为是乳腺癌起始相关的。
图 3 乳腺癌患者 DEmiRNAs 的 Kaplan-Meier 曲线分析Figure 3 Kaplan-Meier curve analysis of DEMINAs in breast cancer patients（A）乳腺癌中has-mir-3200的Kaplan-Meier曲线分析。（B）乳腺癌中has-mir-1258的Kaplan-Meier曲线分析。（C）乳腺癌中 has-mir-183 的 Kaplan-Meier 曲线分析。(D) 乳腺癌中 has-mir-21 的
【参考文献】：
期刊论文
[1]Nanoparticle-linked antagonist for leptin signaling inhibition in breast cancer[J]. Tia Harmon,Adriana Harbuzariu,Viola Lanier,Crystal C Lipsey,Ward Kirlin,Lily Yang,Ruben R Gonzalez-Perez. World Journal of Clinical Oncology. 2017(01)
本文编号：2983370
【文章来源】：桂林医学院广西壮族自治区
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
mRNA差异表达分析及KEGG富集分析
图 2 lncRNA 差异表达分析Figure 2 Differential expression of lncRNA热图显示，与正常组织相比，乳腺癌组织中有 106 种异常表达的 lncRNA。他们被认为是乳腺癌起始相关的。
图 3 乳腺癌患者 DEmiRNAs 的 Kaplan-Meier 曲线分析Figure 3 Kaplan-Meier curve analysis of DEMINAs in breast cancer patients（A）乳腺癌中has-mir-3200的Kaplan-Meier曲线分析。（B）乳腺癌中has-mir-1258的Kaplan-Meier曲线分析。（C）乳腺癌中 has-mir-183 的 Kaplan-Meier 曲线分析。(D) 乳腺癌中 has-mir-21 的
【参考文献】：
期刊论文
[1]Nanoparticle-linked antagonist for leptin signaling inhibition in breast cancer[J]. Tia Harmon,Adriana Harbuzariu,Viola Lanier,Crystal C Lipsey,Ward Kirlin,Lily Yang,Ruben R Gonzalez-Perez. World Journal of Clinical Oncology. 2017(01)
本文编号：2983370
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/2983370.html
