镉胁迫下鬼针草的转录组分析及SSR分子标记开发

发布时间：2021-04-10 06:17

　　鬼针草（Bidens bipinnata L.）是一种典型的Cd超富集植物,对Cd具有很强的富集能力,并且其还是一种重要的药用植物,药用历史悠远,功效甚多。但因生存环境的差异使其在形态上产生诸多变异。属内不同种类鬼针草之间单从外形上很难区分,严重影响几类主要药用鬼针草属植物的用药安全。通过转录组测序,比较镉诱导与正常条件下地下根部组织转录组的基因表达差异。同时基于转录组,利用转录组的数据,进行开发简单重复序列（simple sequence repeat,SSR）标记,从而用于区分鬼针草属的不同植物,对解决鬼针草属植物难以区分的问题具有指导意义。本研究利用IlluminaHiSeq TM 2000高通量测序平台,对镉胁迫条件下鬼针草的根部组织进行转录组测序。利用Trinity软件对鬼针草转录组数据进行组装,共得到120 122条unigenes。将其与GO（Gene Ontology）、KO（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes Ontology）、KOG（lusters of Karyotic Orthologous Groups）、NR（R... 

【文章来源】：沈阳师范大学辽宁省

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

文库构建原理

图 2 信息分析流程图Figure 2 Flow chart of information analysis针对混合 RNA 样品中的每一种构建 cDNA 文库后，并在 Illumina HiSeq TM 2000

七大数据库的注释图


本文编号：3129123