苯酚胁迫下多刺裸腹溞实时定量PCR内参基因的筛选

发布时间：2021-04-21 23:08

　　为研究苯酚胁迫下多刺裸腹溞（Moina macrocopa）相关基因的表达情况,筛选用于实时定量PCR分析的最佳内参基因。利用内参基因表达的cycle threshold（Ct值）非参数检验、GeNorm、NormFinder和BestKeeper四种方法对β-actin、16S rRNA和12S rRNA进行分析,筛选出苯酚胁迫下多刺裸腹溞表达相对稳定的内参基因。结果显示,从Ct值初步判定不同浓度苯酚胁迫后,多刺裸腹溞体内β-actin、16S rRNA和12S rRNA均可稳定表达,且稳定性顺序为:16S rRNA>12S rRNA>β-actin,从GeNorm软件分析显示内参基因的稳定性顺序为:16S rRNA=β-actin>12S rRNA, NormFinder和Bestkeeper分析显示的稳定性顺序均为:16S rRNA>β-actin>12S rRNA。基于以上四种方法对三个候选内参基因的筛选,确定了16S rRNA作为多刺裸腹溞实时定量PCR的最佳内参基因,有助于提高qRT-PCR分析的准确性,为进一步研究苯酚胁迫多刺裸腹溞后目的基因... 

【文章来源】：水生生物学报. 2020,44(01)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验动物
    1.2 实验方法
2 结果
    2.1 总RNA质量检测和内参基因目的片段的扩增
    2.2 实时定量PCR分析
    2.3 内参基因表达的稳定性分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]大白菜-结球甘蓝易位系实时荧光定量PCR内参基因的筛选[J]. 崔菲菲,孟川,王彦华,赵建军,陈雪平,申书兴,顾爱侠.  华北农学报. 2018(05)
[2]RNA质量对内参基因选择和qRT-PCR结果评价的影响[J]. 霍雪萍,张琳萍,赵向绒,刘勤社,王海芳.  生物技术通讯. 2018(03)
[3]菲律宾蛤仔不同发育时期及成体不同组织中内参基因筛选[J]. 牟政强,闫路路,王化敏,霍忠明,闫喜武.  水产学报. 2018(05)
[4]猪IGF1、EGFR、EGF、β-actin基因荧光定量PCR标准曲线的建立[J]. 徐环叶,曹玲芝,刘博,陈立功,孟利佳,崔欢,库尔瓦尼古丽·伊明江,董世山.  河北农业大学学报. 2017(05)
[5]藜科植物藜和灰绿藜实时荧光定量PCR内参基因的选择[J]. 刘艳霞,兰欣欣,曹婧,张晶华,兰海燕.  广西植物. 2016(12)
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[8]溴氰菊酯对多刺裸腹溞急性毒性及解毒代谢的影响[J]. 彭方,王茜,王兰.  水生生物学报. 2013(03)
[9]植物实时荧光定量PCR内参基因的选择[J]. 胡瑞波,范成明,傅永福.  中国农业科技导报. 2009(06)
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硕士论文
[1]枝角类衰老相关蛋白基因和表皮蛋白基因的克隆及表达分析[D]. 刘阿静.华东师范大学 2014
[2]拟穴青蟹免疫相关基因的克隆及内参基因的适用性分析[D]. 房娅博.上海海洋大学 2013
[3]蚤状溞生殖转化相关功能基因Chk1和Hsp90的克隆与表达分析[D]. 邹秀.宁波大学 2013



本文编号：3152665