巴戟天MoDXR基因及其启动子的克隆与分析
发布时间:2021-05-11 16:14
从巴戟天中克隆MEP途径中的1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶基因MoDXR及其启动子序列,并进行生物信息学分析、启动子区顺式作用元件分析,以及进行原核表达分析。根据巴戟天转录组中DXR基因原始序列和NCBI-ORFfinder分析,设计特异性引物,并进行RT-PCR扩增和生物信息学分析;采用染色体步移克隆MoDXR基因的5′端启动子序列;通过亚细胞定位分析MoDXR基因在细胞中的位置;构建原核表达载体pET-28a-MoDXR,导入BL21(DE3)表达感受态细胞后,在IPTG诱导下表达。从巴戟天中克隆的MoDXR基因,其cDNA全长2 015 bp,预测的阅读框大小为1 425 bp,编码474个氨基酸,分子质量为51.27 kDa; BlastP序列比对分析表明MoDXR基因与其他植物的DXR基因具有高度同源性,如:咖啡树DXR (CaDXR)、萝芙木DXR (RvDXR);系统进化发育树分析显示,巴戟天MoDXR蛋白与小粒咖啡和栀子的DXR蛋白聚为一类,其亲缘关系最近;由亚细胞定位可知MoDXR基因所编码的蛋白定位于叶绿体上; MoDXR基因5′端启动子序列长度为1 493...
【文章来源】:药学学报. 2020,55(02)北大核心CSCD
【文章页数】:10 页
【文章目录】:
材料与方法
结果与分析
1 巴戟天MoDXR基因克隆
2 巴戟天MoDXR生物信息学分析
3 巴戟天MoDXR基因启动子区顺式作用元件分析
4 MoDXR亚细胞定位分析
5 巴戟天MoDXR蛋白原核表达分析
6 巴戟天MoDXR基因相对表达量分析
讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]茜草转录组分析及其蒽醌类化合物合成相关基因的挖掘[J]. 彭亮,张岗,颜永刚,孙涛,王媚,李洁,罗露,曹福麟,胡本祥,杨冰月. 中草药. 2018(08)
[2]茜草科植物环烯醚萜类化合物的研究进展[J]. 廖铁松,闵建新,潘玲玲,吴亚芬,万娜,刘宏栋,李斌. 中草药. 2018(06)
[3]地黄RgDXR基因的克隆及表达分析[J]. 朱畇昊,董诚明,俎梦航,李攀登,赵乐. 植物生理学报. 2017(04)
[4]香樟1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶基因CcDXR1的克隆和表达分析[J]. 郑汉,荆礼,姚娜,杨青山,彭华胜,申业,黄璐琦. 药学学报. 2016(09)
[5]基于CRISPR/Cas9技术的烟草NtDXR基因敲除及功能分析[J]. 聂梦云,高军平,罗培,陈晓乐,易小慧,王根洪,夏庆友. 烟草科技. 2016(06)
[6]滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶基因GrDXR的克隆、序列分析与原核表达[J]. 张晓东,赵静,李彩霞,李涛,王元忠. 中草药. 2014(16)
[7]高良姜1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶cDNA克隆与表达调控[J]. 张春荣,杨全,陈虎彪,庞玉新,唐晓敏,程轩轩,吴文雅,陈诗敏. 中国中药杂志. 2012(21)
本文编号:3181711
【文章来源】:药学学报. 2020,55(02)北大核心CSCD
【文章页数】:10 页
【文章目录】:
材料与方法
结果与分析
1 巴戟天MoDXR基因克隆
2 巴戟天MoDXR生物信息学分析
3 巴戟天MoDXR基因启动子区顺式作用元件分析
4 MoDXR亚细胞定位分析
5 巴戟天MoDXR蛋白原核表达分析
6 巴戟天MoDXR基因相对表达量分析
讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]茜草转录组分析及其蒽醌类化合物合成相关基因的挖掘[J]. 彭亮,张岗,颜永刚,孙涛,王媚,李洁,罗露,曹福麟,胡本祥,杨冰月. 中草药. 2018(08)
[2]茜草科植物环烯醚萜类化合物的研究进展[J]. 廖铁松,闵建新,潘玲玲,吴亚芬,万娜,刘宏栋,李斌. 中草药. 2018(06)
[3]地黄RgDXR基因的克隆及表达分析[J]. 朱畇昊,董诚明,俎梦航,李攀登,赵乐. 植物生理学报. 2017(04)
[4]香樟1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶基因CcDXR1的克隆和表达分析[J]. 郑汉,荆礼,姚娜,杨青山,彭华胜,申业,黄璐琦. 药学学报. 2016(09)
[5]基于CRISPR/Cas9技术的烟草NtDXR基因敲除及功能分析[J]. 聂梦云,高军平,罗培,陈晓乐,易小慧,王根洪,夏庆友. 烟草科技. 2016(06)
[6]滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶基因GrDXR的克隆、序列分析与原核表达[J]. 张晓东,赵静,李彩霞,李涛,王元忠. 中草药. 2014(16)
[7]高良姜1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶cDNA克隆与表达调控[J]. 张春荣,杨全,陈虎彪,庞玉新,唐晓敏,程轩轩,吴文雅,陈诗敏. 中国中药杂志. 2012(21)
本文编号:3181711
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