Tc1/mariner转座子挖掘、高活性成员鉴定及其在增强子捕获中的应用
发布时间：2021-07-23 00:35
随着越来越多生物基因组测序工作的完成,科学界对转座子在生命科学的重要性的理解和认识也逐渐加深。已有研究表明转座子在生物界分布广泛,对基因和基因组进化发挥重要作用,并可能影响物种分化和品种（品系）形成。另外由于转座特性,一些DNA转座子被成功开发成遗传操作工具,如SB,PB和Tol2等,在转基因、基因治疗和功能基因组学研究领域中得到广泛应用,并取得重要进展。其中,Tc1/mariner超家族是一类广泛分布的DNA转座子。到目前为止,已经鉴定到了 10多个具有天然活性的Tc1/mariner转座子,但只有人工分子重构的SB转座子得到广泛应用。本研究对斑马鱼基因组的Tc1/mariner超家族进行了系统挖掘和高活性成员应用评估,并对Tc1/mariner超家族中的DD41D/VS家族的分布和传播等进化特性进行了系统研究,主要包括以下研究内容:1.重头挖掘了斑马鱼基因组中的Tc1/mariner转座子,并进行了系统分类、插入年龄分析、转座酶结构域预测等研究;2.DD41D/VS转座子家族的分布、插入年龄分析、横向传播规律等研究;3.ZB转座子在哺乳动物中的转座活性和特性分析;4.ZB转座子在斑...
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：178 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
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【参考文献】：
期刊论文
[1]PDCD5基因与非小细胞肺癌的研究进展[J]. 刘永蕊,刘静蕾,唐国栋,王艳. 中国肿瘤. 2015(04)
硕士论文
[1]赤拟谷盗Latrophilin-like受体的鉴定及功能初探[D]. 刘幸.南京师范大学 2013
本文编号：3298224
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：178 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－１真核生物中转座子的分类［２］??Ｆｉｇｕｒｅ?１－１?Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ?ｔｒａｎｓｐｏｓａｂｌｅ?ｅｌｅｍｅｎｔｓ??图注：弓Ｉ?自?Ｔｅｎ?ｔｈｉｎｇ?
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Ｅ２?ｓ＝３?＋??Ｉｒｉｃｈｏｐｉｅｒａ?ＳＳＳＨ?＾－２?＋??Ａｒａｃｈｎｉｄａ?［?Ｍｅｓｏｓｔｉｇｍａｔａ?ｓ＾ｌ?＋??ＭａｘｉｌＪｏｐｏｄａ?［＿?Ｓｉｐｉｉｏｎｏｓｔｏｊｕａｔｏｉｄａ?ｓ＝ｌ?＋??Ｄｅｃａｐｏｄａ?ＨｊＨｊ?ｓ＝ｌ?＋??ＬＭａｈｃｏｓｔｉ－ａｃａ?＿＿?ｇｇ?ｓ＝ｌ?＋??０?Ｌ?Ａｍｐｈｉｐｏｄａ?ｓ＝ｌ?＋??＾?Ｃ?Ｂｉｖａｌｖｉａ?Ｏｓｔｒｅｉｄａ?ｓ＊ｌ?＋??Ｐｌａｎｔａｅ?［?Ｌａｍｉａｌｅｓ?ｍ?Ｓ＝１?＋??图２－１真核生物中ＫＳ转座子的物种分布。??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ｓｐｅｃｉｅｓ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ＶＳ?ｔｒａｎｓｐｏｓｏｎｓ?ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ?ｉｎ?ｅｕｋａｒｙｏｔｅｓ．??注：列出了从植物界到动物界的不同目（ｏｒｄｅｒ）中包含ＫＳ的１７１个物种数。就催化结构域而言，??ＫＳ有两种不同的结构类型，包括ＤＤ４０Ｄ和ＤＤ４１Ｄ。存在编码这两个不同结构域的以“＋”表示。??Ｎｏｔｅ：?Ｔｈｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｓｐｅｃｉｅｓ?（ｓ）?ｔｈａｔ?ｃｏｎｔａｉｎ?ＶＳ?ｅｌｅｍｅｎｔｓ?ｉｓ?ｐｒｅｓｅｎｔｅｄ?ｆｏｒ?ｅａｃｈ?ｏｒｄｅｒ?ｉｎ?１７１?ｄｉｖｅｒｓｅ??ｓｐｅｃｉｅｓ?ｒａｎｇｉｎｇ?ｆｒｏｍ?ｔｈｅ?ｐｌａｎｔ?ｔｏ?ａｎｉｍａｌ?ｋｉｎｇｄｏｍｓ．?Ｔｈｅｒｅ?ａｒｅ?ｔｗｏ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｔｙｐｅｓ?ｏｆ?ＶＳｓ?ｉｎ?ｔｅｒｍｓ?ｏｆ??ｃａｔａｌｙｔｉｃ?ｄｏｍａｉｎｓ，?ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ?ＤＤ４０Ｄ?ａｎｄ?ＤＤ４１Ｄ．?Ｔｈｅ?ｐｒｅｓｅｎｃｅ?ｏｆ?ＶＳ?ｅｌｅｍｅｎｔｓ?ｃｏｄｉｎｇ?ｔｈｅｓ
【参考文献】：
期刊论文
[1]PDCD5基因与非小细胞肺癌的研究进展[J]. 刘永蕊,刘静蕾,唐国栋,王艳. 中国肿瘤. 2015(04)
硕士论文
[1]赤拟谷盗Latrophilin-like受体的鉴定及功能初探[D]. 刘幸.南京师范大学 2013
本文编号：3298224
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