OCT4通过紧密连接通路影响人毛囊间充质干细胞红系造血的机制研究
发布时间:2021-08-03 04:38
目的:检测细胞形态、大小、粘附性的改变,对不同细胞亚型的转录组进行测序,富集分析差异表达基因的功能,并分析OCT4下游靶基因的表达及功能,揭示人毛囊间充质干细胞(human hair follicle mesenchymal stem cell,hHFMSC)中形态与粘附、多潜能性和造血之间的关联,阐明OCT4重编程的hHFMSC中红细胞生成的可能分子机制,为体外生成红细胞的研究提供新的思路。方法:①在细胞培养过程中收集含有悬浮细胞的上层培养液并离心,以分离贴壁细胞与悬浮细胞,于相差显微镜及荧光显微镜下观察细胞形态。②利用流式细胞术检测细胞前向散射,比较细胞的相对大小;通过细胞分离实验和细胞粘附实验分别检测细胞-细胞、细胞-细胞外基质粘附力的相对大小。③用RNA测序技术分析各组细胞转录本的差异并筛选差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),同时结合文献筛查OCT4下游靶基因的表达情况。④通过GO功能富集及KEGG信号通路富集计算,分析DEG的生物功能,并根据KEGG数据库注释TJ信号通路中的DEG。⑤qPCR和Western blot验证TJ通...
【文章来源】:青岛大学山东省
【文章页数】:63 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
OCT4转导后hHFMSC的形态变化
实验结果151.2细胞体积检测当细胞融合达70%-80%,分别收集hHFMSC、hHFMSCOCT4-adherent和hHFMSCOCT4-floating,利用流式细胞术检测FSC,用于比较细胞相对大校数据显示(图1.2),hHFMSCOCT4-adherent的体积明显小于hHFMSC,而hHFMSCOCT4-floating相较于hHFMSCOCT4-adherent体积更小,与镜下观察到的细胞形态改变一致。表明OCT4过表达使细胞大小发生变化。图1.2OCT4转导后hHFMSC的体积变化流式细胞术检测FSC,比较细胞的相对体积大校(**,P0.01;***,P0.001)1.3细胞粘附性检测利用细胞分离实验和细胞粘附实验,检测各组细胞的粘附性差异(图1.3)。细胞分离实验中,hHFMSCOCT4-adherent的单细胞百分比为47.5%,高于hHFMSC(9.4%),而hHFMSCOCT4-floating的单细胞百分比为85%,明显高于hHFMSCOCT4-adherent与hHFMSC。在细胞粘附实验中,hHFMSC、hHFMSCOCT4-adherent和hHFMSCOCT4-floating在培养板底面上贴附的细胞百分比分别为70.9%、18.4%和2.3%,说明hHFMSCOCT4-floating与基质的贴附率显著低于hHFMSC及hHFMSCOCT4-adherent。以上结果表明,转导OCT4后细胞粘附性显著降低,并且与贴壁细胞相比,悬浮细胞的粘附性更低。
青岛大学硕士学位论文16图1.3OCT4转导后hHFMSC的粘附性变化细胞分离实验与细胞粘附实验分别检测细胞-细胞粘附性、细胞-细胞外基质粘附性。(*,P0.05;**,P0.01;***,P0.001;****,P0.0001)综上,转导OCT4使hHFMSC形态、大小及粘附性均发生显著变化,并以hHFMSCOCT4-floating的形态最接近圆形,体积相对最小,粘附性最低,证明单因子OCT4可能对hHFMSC的基因组进行了重编程,并改变细胞形态学及生长方式。2.转导OCT4改变hHFMSC的基因转录本2.1主成分分析为了探索OCT4如何影响hHFMSC的细胞形态及粘附性,以及这种改变是否在体外诱导hHFMSCOCT4生成红细胞过程中发挥作用,我们提取三组细胞的总RNA并进行转录组测序。首先,为验证各组内样本的相似度及组间样本的差异性,进行PCA分析,如PCA的二维分布图(图2.1A)及三维分布图所示(图2.1B),各组内三个细胞样本的距离相对较近,形成相对独立的群集,表明各组细胞样本具有良好的重复性;另一方面,各组样本之间的距离相对较远,表明其基因转录
本文编号:3318947
【文章来源】:青岛大学山东省
【文章页数】:63 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
OCT4转导后hHFMSC的形态变化
实验结果151.2细胞体积检测当细胞融合达70%-80%,分别收集hHFMSC、hHFMSCOCT4-adherent和hHFMSCOCT4-floating,利用流式细胞术检测FSC,用于比较细胞相对大校数据显示(图1.2),hHFMSCOCT4-adherent的体积明显小于hHFMSC,而hHFMSCOCT4-floating相较于hHFMSCOCT4-adherent体积更小,与镜下观察到的细胞形态改变一致。表明OCT4过表达使细胞大小发生变化。图1.2OCT4转导后hHFMSC的体积变化流式细胞术检测FSC,比较细胞的相对体积大校(**,P0.01;***,P0.001)1.3细胞粘附性检测利用细胞分离实验和细胞粘附实验,检测各组细胞的粘附性差异(图1.3)。细胞分离实验中,hHFMSCOCT4-adherent的单细胞百分比为47.5%,高于hHFMSC(9.4%),而hHFMSCOCT4-floating的单细胞百分比为85%,明显高于hHFMSCOCT4-adherent与hHFMSC。在细胞粘附实验中,hHFMSC、hHFMSCOCT4-adherent和hHFMSCOCT4-floating在培养板底面上贴附的细胞百分比分别为70.9%、18.4%和2.3%,说明hHFMSCOCT4-floating与基质的贴附率显著低于hHFMSC及hHFMSCOCT4-adherent。以上结果表明,转导OCT4后细胞粘附性显著降低,并且与贴壁细胞相比,悬浮细胞的粘附性更低。
青岛大学硕士学位论文16图1.3OCT4转导后hHFMSC的粘附性变化细胞分离实验与细胞粘附实验分别检测细胞-细胞粘附性、细胞-细胞外基质粘附性。(*,P0.05;**,P0.01;***,P0.001;****,P0.0001)综上,转导OCT4使hHFMSC形态、大小及粘附性均发生显著变化,并以hHFMSCOCT4-floating的形态最接近圆形,体积相对最小,粘附性最低,证明单因子OCT4可能对hHFMSC的基因组进行了重编程,并改变细胞形态学及生长方式。2.转导OCT4改变hHFMSC的基因转录本2.1主成分分析为了探索OCT4如何影响hHFMSC的细胞形态及粘附性,以及这种改变是否在体外诱导hHFMSCOCT4生成红细胞过程中发挥作用,我们提取三组细胞的总RNA并进行转录组测序。首先,为验证各组内样本的相似度及组间样本的差异性,进行PCA分析,如PCA的二维分布图(图2.1A)及三维分布图所示(图2.1B),各组内三个细胞样本的距离相对较近,形成相对独立的群集,表明各组细胞样本具有良好的重复性;另一方面,各组样本之间的距离相对较远,表明其基因转录
本文编号:3318947
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