基于基因组学及蛋白酶特性的瑞士乳杆菌差异性分析
发布时间：2021-08-08 05:58
瑞士乳杆菌是广泛应用于发酵乳制品生产的一种乳酸菌。在众多的乳酸菌中,瑞士乳杆菌因其优良的蛋白水解能力而受到关注。研究表明瑞士乳杆菌的蛋白水解特性存在差异性,但是瑞士乳杆菌的基因型与表型之间的相关性仍有待进一步研究。本文以中国四川、云南、青海等地区采集的曲拉、发酵牦牛乳、乳扇、泡菜等传统发酵食品及粪便样品为对象,对样品中的瑞士乳杆菌进行分离、纯化、鉴定和保藏。对分离出的38株瑞士乳杆菌进行基因草图测序,同时结合NCBI公布全基因组测序的12株瑞士乳杆菌基因序列进行包括核心基因与泛基因分析、功能注释等比较基因组学的研究,结果表明瑞士乳杆菌的基因组具有差异性,菌株具有794个同源基因,各自含有6196个特有基因。基于同源基因的系统发育树构建,发现瑞士乳杆菌存在地区聚类的趋势,青海西宁与四川阿坝的菌株明显聚集在不同的进化分支。此外,瑞士乳杆菌的泛基因呈现开放型,仍存在基因水平转移的可能。同源蛋白簇（COG）功能注释结果表明不同瑞士乳杆菌的氨基酸转运与代谢的基因数量存在较大差异。对瑞士乳杆菌蛋白水解基因的预测结果表明菌株编码胞壁蛋白酶（CEP）的基因存在很大差异,而编码肽酶...
【文章来源】：江南大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
瑞士乳杆菌的蛋白水解系统
这些酶由 7 个功能结构域组成（图1-2）。从蛋白质 N 末端开始，CEP 包括前体结构域（PP）、催化结构域（PR）、插入结构域（I）、结构域 A、结构域 B、螺旋结构域（H）和亲水结构域（W）[39]。而瑞士乳杆菌和保加利亚乳杆菌在蛋白质的 C 末端不存在锚定结构域（AN）[41]。迄今已对多种乳酸菌的 CEP 进行了表征，包括保加利亚乳杆菌的 PrtB[45]，干酪乳杆菌和乳酸乳球菌的 PrtP[46-48]，嗜热链球菌的 PrtS[49]，鼠李糖和植物乳杆菌的 PrtR[50]以及瑞士乳杆菌的 PrtH[41]。大多数乳酸菌仅有一个 CEP，但在瑞士乳杆菌中已发现了四种不同的 PrtH 旁系同源基因（PrtH1，PrtH2
江南大学硕士学位论文基因组学分析统发育树分析 50 株瑞士乳杆菌的直系同源构建系统发育树，结果如图 3-1 所示。由图 株瑞士乳杆菌可分为四个进化分支，其中，V-GZTR-132-M1 独占一个分6-6 和 R0052 为一个进化分支，其余的 47 株瑞士乳杆菌共分为两个进化分离的菌株中，DYNDL25-2 与分离自瑞士干酪、常用作奶酪发酵剂的 DPC更为接近[10, 105]，而M2-10-R2M10、DYNDL68M7等12株瑞士乳杆菌与CN更接近，该菌株常用作商用发酵剂，能在牛乳发酵过程中产生生物活性肽
【参考文献】：
期刊论文
[1]脱脂乳水解度对乳酸菌生长代谢特性的影响[J]. 沈桂奇,顾瑞霞,黄玉军,陈霞,陈大卫. 食品科技. 2018(04)
[2]瑞士乳杆菌的益生功能及应用研究进展[J]. 徐煜,刘振民,游春苹. 食品工业科技. 2017(08)
[3]保加利亚乳杆菌水解酪蛋白能力及产物分析[J]. 毛雪,龚雅莉,张国芳,赵裕才,刘丽波,刘扬,王婷婷,王婧莹,段春颖,李春. 现代食品科技. 2016(11)
[4]培养条件对保加利亚乳杆菌蛋白水解体系关键酶基因表达的影响（英文）[J]. Jun-cai HOU,Fei LIU,Da-xi REN,Wei-wei HAN,Yue-ou DU. Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2015(04)
[5]细菌泛基因组学的研究[J]. 庄绪冉,朱泳璋. 上海交通大学学报(医学版). 2012(11)
[6]制作云南乳扇用酸乳清中乳杆菌的多样性分析[J]. 剧柠,张家超,孙志宏,刘文俊,靳烨,张和平,孙天松. 食品与生物技术学报. 2010(05)
[7]植物乳杆菌ST-Ⅲ蛋白酶活性的研究[J]. 陈帅,郭本恒,吴正钧,王荫榆. 乳业科学与技术. 2009(05)
[8]云南传统乳制品——乳扇、乳饼的加工[J]. 韩卫明. 养殖技术顾问. 2004(07)
硕士论文
[1]适用于活性乳酸菌饮料生产瑞士乳杆菌的筛选及其代谢组学研究[D]. 马玉珠.内蒙古农业大学 2017
本文编号：3329372
【文章来源】：江南大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
瑞士乳杆菌的蛋白水解系统
这些酶由 7 个功能结构域组成（图1-2）。从蛋白质 N 末端开始，CEP 包括前体结构域（PP）、催化结构域（PR）、插入结构域（I）、结构域 A、结构域 B、螺旋结构域（H）和亲水结构域（W）[39]。而瑞士乳杆菌和保加利亚乳杆菌在蛋白质的 C 末端不存在锚定结构域（AN）[41]。迄今已对多种乳酸菌的 CEP 进行了表征，包括保加利亚乳杆菌的 PrtB[45]，干酪乳杆菌和乳酸乳球菌的 PrtP[46-48]，嗜热链球菌的 PrtS[49]，鼠李糖和植物乳杆菌的 PrtR[50]以及瑞士乳杆菌的 PrtH[41]。大多数乳酸菌仅有一个 CEP，但在瑞士乳杆菌中已发现了四种不同的 PrtH 旁系同源基因（PrtH1，PrtH2
江南大学硕士学位论文基因组学分析统发育树分析 50 株瑞士乳杆菌的直系同源构建系统发育树，结果如图 3-1 所示。由图 株瑞士乳杆菌可分为四个进化分支，其中，V-GZTR-132-M1 独占一个分6-6 和 R0052 为一个进化分支，其余的 47 株瑞士乳杆菌共分为两个进化分离的菌株中，DYNDL25-2 与分离自瑞士干酪、常用作奶酪发酵剂的 DPC更为接近[10, 105]，而M2-10-R2M10、DYNDL68M7等12株瑞士乳杆菌与CN更接近，该菌株常用作商用发酵剂，能在牛乳发酵过程中产生生物活性肽
【参考文献】：
期刊论文
[1]脱脂乳水解度对乳酸菌生长代谢特性的影响[J]. 沈桂奇,顾瑞霞,黄玉军,陈霞,陈大卫. 食品科技. 2018(04)
[2]瑞士乳杆菌的益生功能及应用研究进展[J]. 徐煜,刘振民,游春苹. 食品工业科技. 2017(08)
[3]保加利亚乳杆菌水解酪蛋白能力及产物分析[J]. 毛雪,龚雅莉,张国芳,赵裕才,刘丽波,刘扬,王婷婷,王婧莹,段春颖,李春. 现代食品科技. 2016(11)
[4]培养条件对保加利亚乳杆菌蛋白水解体系关键酶基因表达的影响（英文）[J]. Jun-cai HOU,Fei LIU,Da-xi REN,Wei-wei HAN,Yue-ou DU. Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2015(04)
[5]细菌泛基因组学的研究[J]. 庄绪冉,朱泳璋. 上海交通大学学报(医学版). 2012(11)
[6]制作云南乳扇用酸乳清中乳杆菌的多样性分析[J]. 剧柠,张家超,孙志宏,刘文俊,靳烨,张和平,孙天松. 食品与生物技术学报. 2010(05)
[7]植物乳杆菌ST-Ⅲ蛋白酶活性的研究[J]. 陈帅,郭本恒,吴正钧,王荫榆. 乳业科学与技术. 2009(05)
[8]云南传统乳制品——乳扇、乳饼的加工[J]. 韩卫明. 养殖技术顾问. 2004(07)
硕士论文
[1]适用于活性乳酸菌饮料生产瑞士乳杆菌的筛选及其代谢组学研究[D]. 马玉珠.内蒙古农业大学 2017
本文编号：3329372
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3329372.html
