红花檵木两个查尔酮合成酶的克隆及生物信息学分析

发布时间：2021-08-11 18:44

　　为了研究红花檵木花青苷生物合成的分子机制,克隆了红花檵木两个查尔酮合成酶LcCHSs基因,并对克隆的两个基因进行了生物信息学分析。利用RT-PCR技术,克隆得到红花檵木LcCHS1和LcCHS2基因,其中LcCHS1的开放阅读框（ORF）为1 170 bp,编码389个氨基酸,LcCHS2的ORF为1 182 bp,编码393个氨基酸。两个LcCHSs的氨基酸序列与来源于茶树（Camellia sinensis）、葡萄（Vitis vinifera）、拟南芥（Arabidopsis thaliana）、烟草（Nicotiana tabacum）等植物CHSs的氨基酸序列一致性超过83%,且两个LcCHSs的氨基酸序列中参与CHS酶类催化的3个残基（Cys164、His303和Asn336）和两段CHS酶类重要序列（"RLMMYQQGCFAGGTVLR"和"GVLFGFGPGL"）均严格保守,表明CHS在进化功能上的保守性。三级结构预测表明两个LcCHSs都能形成同源二聚体,且两个LcCHSs蛋白的空间结构非常相似。 

【文章来源】：湖南工业大学学报. 2020,34(06)

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

LcCHS1和LcCHS2基因的PCR扩增图

LcCHSs基因的核苷酸序列及其推导氨基酸序列

图2 LcCHSs基因的核苷酸序列及其推导氨基酸序列对LcCHS1和LcCHS2基因的ORFs序列进行分析表明,LcCHS1的ORF全长为1 170 bp,编码389个氨基酸(图2a);LcCHS2的ORF全长为1 182 bp,编码393个氨基酸(图2b)。

【参考文献】：
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本文编号：3336691