荸荠CCoAOMT基因的克隆与表达分析

发布时间：2021-09-24 15:32

　　咖啡酰辅酶-A-O-甲基转移酶（CCoAOMT）是植物木质素合成的关键酶之一。为探明CCoAOMT在荸荠木质素单体合成过程中的作用,本研究利用RACE技术在荸荠球茎中克隆CCoAOMT基因的全长序列,并对其在不同组织和鲜切荸荠贮藏过程中的表达进行分析。结果表明,克隆得到荸荠CCoAOMT基因cDNA全长1 302 bp,将此基因命名为CwCCoAOMT,其GenBank登录号为MG719240。该序列包含一个786 bp的最大开放阅读框,可编码261个氨基酸,其DNA中包含4个内含子和5个外显子。该蛋白的分子量为29.17kD,理论等点为5.21。CCoAOMT蛋白二级结构中α-螺旋占37.55%,无规则卷曲占35.63%,延伸链占19.16%,β-折叠结构占7.66%。序列比对和系统进化树分析表明,Cw CCoAOMT蛋白与其它植物CCoAOMT蛋白序列相似度较高,其中与慈竹的亲缘关系最近。通过各组织表达特性分析发现,CwCCoAOMT在荸荠皮中的表达最高,在荸荠肉中的表达最低。在鲜切荸荠贮藏过程中CwCCoAOMT的表达呈快速上升趋势,而水杨酸处理能显著抑制CwCCoAOMT表达上... 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(20)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 克隆获得荸荠CCo AOMT基因
    1.2 Cw CCo AOMT基因的生物信息学分析
    1.3 Cw CCo AOMT组织特异性表达分析
    1.4 Cw CCo AOMT在鲜切荸荠贮藏过程中的表达分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 试验材料
    3.2 总RNA提取
    3.3 基因克隆
    3.4 基因生物信息学分析
    3.5 基因表达分析
作者贡献


【参考文献】：
期刊论文
[1]热处理对抑制鲜切马蹄褐变效果的研究[J]. 宋慕波,帅良,陈振林,蔡文,段振华,方方.  食品科技. 2017(05)
[2]桂花查尔酮异构酶OfCHI基因的克隆与表达分析[J]. 张水明,涂佳丽,阿不都热扎克·依沙克,李川微,户倩,陈磊,董丽丽.  西北植物学报. 2016(09)
[3]酚类物质代谢与鲜切茭白褐变和木质化的关系研究[J]. 罗海波,陈伟,王晓晴,叶美玲,冯晓娥,王春芳.  食品科技. 2015(06)
[4]‘砀山酥梨’果实CCoAOMT基因的克隆与表达分析[J]. 王丹阳,高付永,孙炜,芮伟康,Khanizadeh Shahrokh,张绍铃,陶书田.  南京农业大学学报. 2015(01)
[5]柚CCoAOMT基因的克隆与超表达载体构建[J]. 徐玉,潘腾飞,潘东明.  中国农学通报. 2014(25)
[6]赤桉CCoAOMT亚家族的基因克隆及可变剪接分析[J]. 谷振军,章怀云,张党权,谢耀坚,何含杰,陈丽莉,彭宽,刘果,杨丹.  林业科学. 2014(05)
[7]木质素合成关键酶咖啡酰辅酶A氧甲基转移酶的研究进展[J]. 王华美,于延冲,付春祥,周功克,高欢欢.  基因组学与应用生物学. 2014(02)
[8]‘琯溪蜜柚’贮藏期间汁胞粒化与木质素代谢的关系[J]. 潘腾飞,朱学亮,潘东明,郭志雄,佘文琴,陈桂信.  果树学报. 2013(02)
[9]慈竹CCoAOMT基因的克隆及生物信息学分析[J]. 吴晓宇,胡尚连,曹颖,卢学琴,任鹏,周美娟,李晓瑞.  南京林业大学学报(自然科学版). 2012(03)
[10]外源SA对甜菜幼苗细胞壁HRGP和木质素含量的影响[J]. 陈贵华,张少英.  作物杂志. 2012(02)



本文编号：3408002