一种新的蜱病毒MIV-2的发现及不同蜱种感染率调查研究
发布时间：2021-09-29 11:33
蜱是一种可以传播多种病原体的节肢动物,虫媒病毒（arboviruses）包括蜱传病毒（Tick-borne viruses,TBVs）,它们在自然界中通过媒介蜱和宿主动物之间循环而持续存在。分子生物学技术的发展日新月异,不断发现新蜱传病毒。负链RNA病毒宿主范围广泛,包括植物、节肢动物、哺乳动物等,因此既会对人类造成疾病又能对畜牧业和农业造成损失。近年来,科学家们发现了很多新的负链RNA病毒,但由于未能获得其分离株进而缺乏进一步的研究。本研究选取2018年我国黑龙江省五个采集点采集的游离全沟硬蜱77只,提取核酸后基于第二代测序技术,探索荆楚病毒目（Jingchuvirales）与单股负链RNA病毒目（Mononegavirales）的新蜱传病毒并分析进化地位。检测出了Ixodes persulcatus mononegavirales-like virus HLJ、Ixodes persulcatus chuvirus HLJ、Ixodes persulcatus dimarhabdovirus HLJ三种新病毒。发现Ixodes persulcatus mononegavirales...
【文章来源】：军事科学院北京市
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
018年黑龙江全沟硬蜱采集点
军事科学院硕士学位论文第14页图1.2琼脂糖凝胶电泳检测结果图2.3上机测序质量分析结果测序完成后，本次测序RNA样本Barcode编号分别为1-9，共生成72Gb的数据，ISPLoading为69%，说明此次上机69%的芯片得到覆盖。2.4序列结果分析我们采集的全沟硬蜱RNA样本共建立了9个RNA文库，总共生成了72Gb的数据。通过对产生数据进行组装、质量过滤、去除宿主基因、比对、验证，对其中存在的Jingchuvirales与Mononegavirales进行筛选，我们共发现了3种新病毒，分别暂命名为Ixodespersulcatusmononegavirales-likevirusHLJ、IxodespersulcatuschuvirusHLJ、IxodespersulcatusdimarhabdovirusHLJ，基因组长度分别为10865、10365、11440个核苷酸，且预测均可编码4个orf。
军事科学院硕士学位论文 2.5 病毒进化分析 通过基于对 RdRp 蛋白进行进化分析，通过结果可以发现，不同亚枝上形成了不同的病毒群，发现 Ixodes persulcatus mononegavirales-like virus HLJ 属于未分类的 Mononegavirales，与中国黑龙江省报道的 Deer tick mononegavirales virus 病毒关系更为密切。Ixodes persulcatus chuvirus HLJ 属于 Jingchuvirales，与 Hubei chuvirus-like virus 3 、 Wuhan Mosquito 8 亲缘关系最近。 Ixodes persulcatus dimarhabdovirus HLJ 属于弹状病毒科，有意思的是，属于 Jingchuvirales 的 Ixodes persulcatus chuvirus HLJ 在进化树中位于 Mononegavirales 之间。
【参考文献】：
期刊论文
[1]新疆中哈边境地区分离到远东型和西伯利亚型蜱传脑炎病毒[J]. 张桂林,孙响,刘然,郑重,刘晓明,伊小平. 中国人兽共患病学报. 2017(04)
本文编号：3413635
【文章来源】：军事科学院北京市
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
018年黑龙江全沟硬蜱采集点
军事科学院硕士学位论文第14页图1.2琼脂糖凝胶电泳检测结果图2.3上机测序质量分析结果测序完成后，本次测序RNA样本Barcode编号分别为1-9，共生成72Gb的数据，ISPLoading为69%，说明此次上机69%的芯片得到覆盖。2.4序列结果分析我们采集的全沟硬蜱RNA样本共建立了9个RNA文库，总共生成了72Gb的数据。通过对产生数据进行组装、质量过滤、去除宿主基因、比对、验证，对其中存在的Jingchuvirales与Mononegavirales进行筛选，我们共发现了3种新病毒，分别暂命名为Ixodespersulcatusmononegavirales-likevirusHLJ、IxodespersulcatuschuvirusHLJ、IxodespersulcatusdimarhabdovirusHLJ，基因组长度分别为10865、10365、11440个核苷酸，且预测均可编码4个orf。
军事科学院硕士学位论文 2.5 病毒进化分析 通过基于对 RdRp 蛋白进行进化分析，通过结果可以发现，不同亚枝上形成了不同的病毒群，发现 Ixodes persulcatus mononegavirales-like virus HLJ 属于未分类的 Mononegavirales，与中国黑龙江省报道的 Deer tick mononegavirales virus 病毒关系更为密切。Ixodes persulcatus chuvirus HLJ 属于 Jingchuvirales，与 Hubei chuvirus-like virus 3 、 Wuhan Mosquito 8 亲缘关系最近。 Ixodes persulcatus dimarhabdovirus HLJ 属于弹状病毒科，有意思的是，属于 Jingchuvirales 的 Ixodes persulcatus chuvirus HLJ 在进化树中位于 Mononegavirales 之间。
【参考文献】：
期刊论文
[1]新疆中哈边境地区分离到远东型和西伯利亚型蜱传脑炎病毒[J]. 张桂林,孙响,刘然,郑重,刘晓明,伊小平. 中国人兽共患病学报. 2017(04)
本文编号：3413635
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