大肠杆菌sRNA EsrE的转录调控研究
发布时间：2021-10-13 03:23
大肠杆菌sRNA EsrE可以维持细胞在有氧条件下的正常生长,固体平板上的生长形态以及对不同抗生素的敏感性等多种表型,并且参与辅酶Q8的合成。实验室前期对于esrE基因的转录调控进行了初步的探索,识别多个顺式调控元件,并在此基础上筛选得到54种潜在的转录调控因子,本研究主体内容是验证潜在转录调控因子对EsrE调控功能并明确其调控机制。研究中首先完善了实验室前期构建的双质粒报告基因（lacZ）系统,并利用该系统逐一验证了潜在转录调控因子的调控功能,研究结果表明FabZ与RpoH可以调控EsrE的转录。FabZ为脂肪酸生物合成中的β-羟酰-ACP脱水酶,双质粒系统表明其可下调EsrE的转录,进一步的凝胶阻滞实验分析发现,其不能直接和EsrE启动子区域的DNA片段结合,即其不具有DNA结合活性,故关于FabZ如何精确调控EsrE的转录还有待研究。RpoH为RNA聚合酶的σ亚基,双质粒系统的实验结果表明RpoH能上调EsrE的转录,而凝胶阻滞实验分析发现,该蛋白在RNA聚合酶核心酶的协同作用下能直接和EsrE启动子区域的DNA片段结合,即RpoH能以RNA聚合酶σ亚基形式启动EsrE的转录。基...
【文章来源】：华东理工大学上海市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．２?ｈＷ■／推测功能示意图ｌ１７ｌ??Ｆｉｇ．?１．２?ｐｒｏｐｏｓｅｄ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｕｂｉＪ?ｌｏｃｕｓ１１７１????ｕｈｉＪ?６０６?ｂｐ????
ｓｓ?ＩＩ）相互作用来发挥调控功能［气然而大肠杆菌体内ＲＮＡ聚合酶频繁“奔??波”于各转录调控因子之间，启动不同基因的转录，所以为提髙两者的作用效率，两者??蛋白－蛋白相互作用力通常相对微弱，另外，可以通过提高靶基因启动子周围转录调控??因子的浓度促进转录调控因子与ＲＮＡ聚合酶的结合。除此之外，大约２０－３０种转录调??控因子直接结合ＲＮＡ聚合酶（ｃｌａｓｓ?ＩＩＩ和ｃｌａｓｓ?ＩＶ）。这种转录调控因子通常与ｐ或者Ｐ’??亚基结合，即使在延伸过程中也可以控制ｍＲＮＡ的衰减、延伸和终止（图１．４）。??＜〇％２ＳＳ？?１；??Ｆ？ｄ?ｆａｃｔｏｒ＊?ｊ￡＇?．??梅Ｂ■■费＆??Ｃｏｒ？?？ｎｚｙｍ＊?Ｍｏ＊ｏｗ？ｙｍ？?＊？?ｒ?ｆＫｔ〇??—ｉＷｆｆｉｌ?ＩＭ．Ｍ—ｍｉｗ??图１．４大肠杆菌ＲＮＡ聚合酶的功能分化??Ｆｉｇ．?１．４?Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ?ｏｉＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ?ｃｏｌｉ?ＲＮＡ?ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ??ＤＮＡ结合型转录调控因子一般由两个结构域组成，一是功能域，另一是ＤＮＡ结合??域。在原核生物中，ＨＴＨ?（ｈｅｌｉｘ－ｔｕｍ－ｈｅｌｉｘ）结构是调控因子ＤＮＡ结合域中最常见的形??式。??根据作用效果的不同，转录调控因子一般分为转录激活因子和转录抑制因子。其中，??对于转录抑制因子而言，当细胞中诱导物不存在时，其可以与调控序列结合，使周围的??启动子不能启动基因转录；当存在诱导物，诱导物与抑制因子结合，使其从靶ＤＮＡ区??域脱离，启动子的转录活性恢复。相比之下，转录激活因子需要效应配体的参与才能完??
华东理工大学硕士学位论文?第７页??Ａ１７８－２０１?Ｕ４５Ｐ??［ｒｐｏＨｌ６２）??Ｄ１７９Ｇ?、?Ｗ２４４Ｒ、?Ｕ２７０Ｒ??（ｒｐｏＨＩＩＩ）?｛ｔｐｏＨｉｅｎ?（ｒｐｏＨ１￥３）??Ｆ１３８Ｌ?Ｌ１６１Ｐ?＼?Ｒ２４３Ｃ?＼?Ｌ２Ｔ８Ｗ??０ｐｏＨ１７＾｛ｒｐｏＨ１Ｂ２）?（ｒｐｏＨ１７４）?（ｒｐｔ＾１１２）??ｉ?■ｉｘＷＫ／ｉ?ｐｓＡ＾Ｆ＾ｖｓｎ??１．２?２．１?２．２?２．３?２．４?￣Ｔ￣?３．１?３．２?４．１?４．２??ＲｐｏＨ?ｂｏｘ??图１．５?ａ３２的保守区域示意图??Ｆｉｇ．?１．５?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ?ｒｅｇｉｏｎｓ?ｏｆ?ａ３２??１．３．１?ａ３２转录调控??基因ｒｐｏ／／的调控是非常复杂的，包括三个层面：转录、翻译及翻译后修饰［３２，３３］。??从转录水平而言，ｒｐｏ／／编码基因上游５种启动子（Ｐｌ，Ｐ３－Ｐ６）可以被不同的ｃｒ识别并??受到多种操纵子的调控（图１．６），其中Ｐ４和Ｐ５由ａ７Ｇ转录，Ｐ３和Ｐ６可以结合ａ２４和ａ５４，??然而Ｐ１可以根据生长期选择ａ７Ｑ或ａｓ介导转录［３４＾］，另外，Ｐ６启动子对代谢产物敏感且??其转录依赖于胞内ｃＡＭＰ的水平和ＣＲＰ催化剂［３７ｌｃＡＭＰ－ＣＲＰ与ＣｙｔＲ抗催化剂形成复??合结构从而掩盖Ｐ３、Ｐ４和Ｐ５［４１］。同样地，涉及起始染色体ＤＮＡ复制的ＤＮＡ结合蛋??白ＤｎａＡ，通过抑制Ｐ３和Ｐ４的转录参与调控的转录（图１．６）?［４２］。这些效应因子??和转录调控因子响应各种环境信号和状况，调控ｒｐｏ／／的转录，并且在压力反应中有广??泛的适用性。??（ｃ＾Ｒ）??
【参考文献】：
期刊论文
[1]大肠杆菌yigP基因转录调控序列的鉴定[J]. 汪屹,叶江,张惠展. 微生物学报. 2012(05)
[2]Fat poetry: a kingdom for PPARγ[J]. Silvia I Anghel,Walter Wahli. Cell Research. 2007(06)
本文编号：3433860
【文章来源】：华东理工大学上海市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．２?ｈＷ■／推测功能示意图ｌ１７ｌ??Ｆｉｇ．?１．２?ｐｒｏｐｏｓｅｄ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｕｂｉＪ?ｌｏｃｕｓ１１７１????ｕｈｉＪ?６０６?ｂｐ????
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华东理工大学硕士学位论文?第７页??Ａ１７８－２０１?Ｕ４５Ｐ??［ｒｐｏＨｌ６２）??Ｄ１７９Ｇ?、?Ｗ２４４Ｒ、?Ｕ２７０Ｒ??（ｒｐｏＨＩＩＩ）?｛ｔｐｏＨｉｅｎ?（ｒｐｏＨ１￥３）??Ｆ１３８Ｌ?Ｌ１６１Ｐ?＼?Ｒ２４３Ｃ?＼?Ｌ２Ｔ８Ｗ??０ｐｏＨ１７＾｛ｒｐｏＨ１Ｂ２）?（ｒｐｏＨ１７４）?（ｒｐｔ＾１１２）??ｉ?■ｉｘＷＫ／ｉ?ｐｓＡ＾Ｆ＾ｖｓｎ??１．２?２．１?２．２?２．３?２．４?￣Ｔ￣?３．１?３．２?４．１?４．２??ＲｐｏＨ?ｂｏｘ??图１．５?ａ３２的保守区域示意图??Ｆｉｇ．?１．５?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ?ｒｅｇｉｏｎｓ?ｏｆ?ａ３２??１．３．１?ａ３２转录调控??基因ｒｐｏ／／的调控是非常复杂的，包括三个层面：转录、翻译及翻译后修饰［３２，３３］。??从转录水平而言，ｒｐｏ／／编码基因上游５种启动子（Ｐｌ，Ｐ３－Ｐ６）可以被不同的ｃｒ识别并??受到多种操纵子的调控（图１．６），其中Ｐ４和Ｐ５由ａ７Ｇ转录，Ｐ３和Ｐ６可以结合ａ２４和ａ５４，??然而Ｐ１可以根据生长期选择ａ７Ｑ或ａｓ介导转录［３４＾］，另外，Ｐ６启动子对代谢产物敏感且??其转录依赖于胞内ｃＡＭＰ的水平和ＣＲＰ催化剂［３７ｌｃＡＭＰ－ＣＲＰ与ＣｙｔＲ抗催化剂形成复??合结构从而掩盖Ｐ３、Ｐ４和Ｐ５［４１］。同样地，涉及起始染色体ＤＮＡ复制的ＤＮＡ结合蛋??白ＤｎａＡ，通过抑制Ｐ３和Ｐ４的转录参与调控的转录（图１．６）?［４２］。这些效应因子??和转录调控因子响应各种环境信号和状况，调控ｒｐｏ／／的转录，并且在压力反应中有广??泛的适用性。??（ｃ＾Ｒ）??
【参考文献】：
期刊论文
[1]大肠杆菌yigP基因转录调控序列的鉴定[J]. 汪屹,叶江,张惠展. 微生物学报. 2012(05)
[2]Fat poetry: a kingdom for PPARγ[J]. Silvia I Anghel,Walter Wahli. Cell Research. 2007(06)
本文编号：3433860
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3433860.html
