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穿山甲新型瘟病毒与Colti病毒的鉴定及基因组特征研究

发布时间:2021-10-22 01:52
  野生动物非法贸易是全球最严重的暴利犯罪活动之一,不但严重破坏生物多样性及生态环境,同时走私运输也是新发和再发传染病重要的传播途径,严重威胁人类社会的公共卫生安全。虽然存在极大的生物安全风险,但是这类非法走私的野生动物所携带病原体的相关研究却极其有限。穿山甲是全球被走私数量最多的哺乳动物,是全球野生动物非法贸易的代表性物种。由于一些传统的“食补”观念及中医药材的需求,我国是大部分穿山甲走私的目的地。伴随着穿山甲的非法走私运输,其携带的病原体也会随之输入我国。在2018年7月-8月期间,浙江省金华市野生动物保护站救助了四只穿山甲(3只马来穿山甲,1只中华穿山甲)。这四只穿山甲在被救助后不久均出现了拒食等表现不一的临床症状。在野生动物保护站工作人员的悉心照顾和对症治疗下,其中1只中华穿山甲病情逐渐好转。然而剩余的3只马来穿山甲治疗效果不佳,并在救助后的半个月时间相继死去。为了查找引起这四只穿山甲疾病的病原体,我们对这四只穿山甲的样本进行了核酸(RNA)提取和转录组文库构建。通过宏转录组测序、生物信息分析并结合反转录PCR(RT-PCR)的方法,在两只死亡的马来穿山甲(分布编号为1-Dongy... 

【文章来源】:中国疾病预防控制中心北京市

【文章页数】:77 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

穿山甲新型瘟病毒与Colti病毒的鉴定及基因组特征研究


图4-2.2-Lishui穿山甲胸片检查结果,在左肺中观察到大面积阴影

穿山甲,病理,箭头


?穿山甲新型瘟病毒与Colti病毒的鉴定及基因组特征研究???1-Dongyang?2-Lishui??,i?*B,??“丨■??如爨??图4-3?死亡穿山甲l-Dongyang和2-Lishui的组织病理分析结果(><200)。出血(绿色??箭头);坏死(蓝色箭头)?,细胞核固缩(黄色箭头);胶原纤维变性(黑色箭头)。??Figure?4-3.?Pathologic?changes?of?dead?pangolins?1?-Dongyang?and?2-Lishui.?Bleeding?(green??arrows);?Necrosis?(blue?arrows);?Pyknotic?nucleus?(yellow?arrows);?Collagen?fiber?degeneration??(black?arrows).??24??

基因组,片段,密码子


CWP??CTFV?AAGGGCUGCUGUUGACGGUGUUGGCCU??KGCC?*?R?CWP??EYAV?AAGGGUUGUUGU?UGACGGUGUUGGCCU??RGCC?*?R?GWP??TFRV?CGAGGCUGUUGUUGACGGGGUUGGCCU??RGCC?*?R?CWP??TarTV?AGAGGGUGUUGU?UGACGGUGUUGGCCU??KllNfW?RGCC?*?RCWP??AGAGGAUGCUGU?UGACGGUGUUGGCCU??图4-7.?LSPV基因组特征。(a)使用Weblogo分析和可视化LSPV基因组片段中5’和??3’末端保守的10个核苷酸序列。(b)?LSPV和己知的Colti病毒片段9中间的终止密码子??周围的序列信息。??Figure?4-7.?Characteristics?of?the?LSPV?genome,?(a)?Sequence?conservation?of?the?55-?and??3’-terminal?10?nucleotides?in?genomic?segments?of?the?LSPV?genome?were?analyzed?and??visualized?using?Weblogo.?(b)?Sequence?information?around?the?stop?codon?of?segment?VP9?of??LSPV?and?known?coltivirus.??35??


本文编号:3450148

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