东北地区中鼩鼱遗传多样性与分子系统地理学
发布时间：2021-10-29 06:01
本研究对我国东北地区3个种群（大兴安岭、小兴安岭和长白山山脉）的中鼩鼱（99个样本）Cyt b基因全序列进行分析,共获得81个单倍型。整体单倍型多态性为0.9940,显示东北地区中鼩鼱整体遗传多样性较高,3个种群的遗传多样性无明显差异。分子变异方差分析显示3个种群之间的分化占总分化的2.48%,种群内采样地的分化占总分化的0.34%,采样地内部遗传分化占总分化的97.19%。遗传分化结果显示中鼩鼱遗传分化与地理距离存在非正相关关系。结合GenBank下载欧亚其他地区中鼩鼱Cyt b基因全序列构建系统发生树,分化为3个分支:日本北海道分布的中鼩鼱构成1个小分支;韩国济州岛的中鼩鼱构成1个小分支;我国东北地区和其他欧亚大陆的中鼩鼱构成1个大分支,在这个大支上未显现进一步的遗传分化结构。中介网络分析也暗示除日本北海道和韩国济州岛外,欧亚大陆分布的中鼩鼱没有明显的地理系统分化,表现出遗传分化与地理关联性较弱。种群历史分析显示东北地区中鼩鼱经历过种群扩张。
【文章来源】：兽类学报. 2020,40(03)北大核心CSCD
【文章页数】：12 页
【部分图文】：
中鼩鼱的单倍型中介网络图(最短树的突变数为356).不同地理分布的样本单倍型用不同的颜色表示.单倍型间最大突变数量和中间突变节点(红色)被进一步描述
对我国东北地区中鼩鼱整体中性检测,Tajima’s D结果(D=-2.5596,P< 0.001)和Fu’s FS结果(Fs=-34.203,P< 0.001)均显示为显著性负值(表2),说明非中性进化显著,进一步说明东北地区中鼩鼱可能经历过数量急剧扩张。对3个种群(大兴安岭、小兴安岭和长白山山脉种群)分别进行Tajima’s D和Fu’s FS中性检测,两种检测结果都显示3个种群均为显著负值(表2),说明3种群存在历史扩张。采用错配分布方法对种群历史进行检验,我国东北地区整体样本序列的配对距离矩阵构建错配曲线是一个光滑单峰曲线(图4),进一步说明东北地区中鼩鼱经历了种群扩张。3 讨论
主要采用陷阱法,辅以铗捕法,在我国东北地区大兴安岭、小兴安岭和长白山山脉捕获中鼩鼱标本(地模标本),共采集99只,其中大兴安岭山脉呼中地区(北纬51°44′14″,东经123°40′44″)采集到25只(HZ1～HZ25)、塔河地区(北纬53°10′09″,东经124°44′44″)2只(TH1、TH2);小兴安岭山脉铁力地区(北纬46°59′6.68″,东经128°02′17.70″)18只(TL1～TL18)、南岔地区(北纬47°08′16.76″,东经129°17′1.14″)2只(NC1、NC2)、萝北地区(北纬45°50′07″,东经132°84′74″)9只(LB1～LB9);长白山山脉横道河子地区(北纬44°48′44″,东经129°02′04″)24只(HD1～HD24)、牡丹江地区(北纬44°48′48″,东经129°04′42″)8只(MD1～MD8)、凤凰山地区(北纬44°27′48″,东经128°12′40″)10只(FH1～FH10)和新宾地区(北纬41°36′15″,东经125°23′30″)1只(LN1),具体位置见图1。采集标本的后肢腿部肌肉组织,存放于牡丹江师范学院动植物标本馆冷冻。从GenBank下载了欧亚其他地区中鼩鼱Cyt b基因全序列,具体地理位置见图1,序列基本信息见表1。表1 GenBank下载的中鼩鼱基因Cyt b序列Table 1 Cyt b gene sequences of S. caecutiens downloaded from GenBank 地理区域Geographical distribution 样本采样地*Sampling location GenBank号GenBank number 样本号Sample number 朝鲜半岛 Korea 19 AB119190; AB119191 Korea 1; Korea 2 24 AB062727;AB062728;AB062729 Korea 3-Korea 5 30 AB062725 Korea 6 韩国济州岛 Korea: Cheju Island 31 AB062721; AB062722; AB062723; AB062724;JX192946; JX192947 Cheju 1-Cheju 6 日本北海道 Japan: Hokkaido 32 AB028561; AB028560 Hokkaido 1; Hokkaido 2 俄罗斯乌苏里地区 Russia: Ussuri 18 AB028554;AB062731 Ussuri 1; Ussuri 2 22 AB119183;AB119184 Ussuri 3; Ussuri 4 23 AB062730; AB028557 Ussuri 5; Ussuri 6 28 GU929336 Ussuri 7 俄罗斯纳戈尔诺 Russia: Nagorny 14 AB028548; AB119182;AB062733 Nagorny 1-Nagorny 3
本文编号：3464106
【文章来源】：兽类学报. 2020,40(03)北大核心CSCD
【文章页数】：12 页
【部分图文】：
中鼩鼱的单倍型中介网络图(最短树的突变数为356).不同地理分布的样本单倍型用不同的颜色表示.单倍型间最大突变数量和中间突变节点(红色)被进一步描述
对我国东北地区中鼩鼱整体中性检测,Tajima’s D结果(D=-2.5596,P< 0.001)和Fu’s FS结果(Fs=-34.203,P< 0.001)均显示为显著性负值(表2),说明非中性进化显著,进一步说明东北地区中鼩鼱可能经历过数量急剧扩张。对3个种群(大兴安岭、小兴安岭和长白山山脉种群)分别进行Tajima’s D和Fu’s FS中性检测,两种检测结果都显示3个种群均为显著负值(表2),说明3种群存在历史扩张。采用错配分布方法对种群历史进行检验,我国东北地区整体样本序列的配对距离矩阵构建错配曲线是一个光滑单峰曲线(图4),进一步说明东北地区中鼩鼱经历了种群扩张。3 讨论
主要采用陷阱法,辅以铗捕法,在我国东北地区大兴安岭、小兴安岭和长白山山脉捕获中鼩鼱标本(地模标本),共采集99只,其中大兴安岭山脉呼中地区(北纬51°44′14″,东经123°40′44″)采集到25只(HZ1～HZ25)、塔河地区(北纬53°10′09″,东经124°44′44″)2只(TH1、TH2);小兴安岭山脉铁力地区(北纬46°59′6.68″,东经128°02′17.70″)18只(TL1～TL18)、南岔地区(北纬47°08′16.76″,东经129°17′1.14″)2只(NC1、NC2)、萝北地区(北纬45°50′07″,东经132°84′74″)9只(LB1～LB9);长白山山脉横道河子地区(北纬44°48′44″,东经129°02′04″)24只(HD1～HD24)、牡丹江地区(北纬44°48′48″,东经129°04′42″)8只(MD1～MD8)、凤凰山地区(北纬44°27′48″,东经128°12′40″)10只(FH1～FH10)和新宾地区(北纬41°36′15″,东经125°23′30″)1只(LN1),具体位置见图1。采集标本的后肢腿部肌肉组织,存放于牡丹江师范学院动植物标本馆冷冻。从GenBank下载了欧亚其他地区中鼩鼱Cyt b基因全序列,具体地理位置见图1,序列基本信息见表1。表1 GenBank下载的中鼩鼱基因Cyt b序列Table 1 Cyt b gene sequences of S. caecutiens downloaded from GenBank 地理区域Geographical distribution 样本采样地*Sampling location GenBank号GenBank number 样本号Sample number 朝鲜半岛 Korea 19 AB119190; AB119191 Korea 1; Korea 2 24 AB062727;AB062728;AB062729 Korea 3-Korea 5 30 AB062725 Korea 6 韩国济州岛 Korea: Cheju Island 31 AB062721; AB062722; AB062723; AB062724;JX192946; JX192947 Cheju 1-Cheju 6 日本北海道 Japan: Hokkaido 32 AB028561; AB028560 Hokkaido 1; Hokkaido 2 俄罗斯乌苏里地区 Russia: Ussuri 18 AB028554;AB062731 Ussuri 1; Ussuri 2 22 AB119183;AB119184 Ussuri 3; Ussuri 4 23 AB062730; AB028557 Ussuri 5; Ussuri 6 28 GU929336 Ussuri 7 俄罗斯纳戈尔诺 Russia: Nagorny 14 AB028548; AB119182;AB062733 Nagorny 1-Nagorny 3
本文编号：3464106
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