川续断目代表性类群叶绿体基因组变异和进化研究
发布时间：2021-11-21 09:43
川续断目（Dipsacales）是被子植物的一个重要分支,多为木本植物,主要包含两个科,49个属,约1,090个物种,主要分布在北半球,以及南半球的部分地区。忍冬属（Lonicera）是川续断目下忍冬科（Caprifoliaceae）的主要组成类群,约含200个物种,包含大量的园艺观赏性植物和药用植物。目前对于川续断目及忍冬属物种的研究主要集中在生态领域及中药领域。同时,对其物种进化关系的研究主要是利用一些分子标记序列及形态学证据,并未从基因组学水平上对其物种之间的进化关系进行解释。叶绿体基因组具有长度小,单亲遗传,核苷酸替换率低,基因和基因组结构简单保守等特点,是研究物种系统进化的重要分子工具。本研究测序组装了十个川续断目物种的叶绿体全基因组序列,并从Genbank中下载七种该目物种叶绿体基因组数据,运用生物信息学方法对其进行比较基因组学分析,同时利用不同数据集及不同软件构建该目的系统进化关系。本研究的主要内容及结果如下:1.十四个川续断目物种叶绿体基因组结构变异及系统进化分析组装和注释叶绿体基因组序列结果表明,川续断目物种叶绿体基因组是一个四部分环状DNA分子;六个五福花科物种叶绿...
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：94 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
六个五福花科和八个忍冬科物种叶绿体基因组图谱
图 2 叶绿体基因组重复序列分析（A）六个五福花科物种重复序列数目的直方图分布（B）八个忍冬科物种物种重复序列数目的直方图分布（C）六个五福花科物种重复序列不同分布的数目统计（D）八个忍冬科物种重复序列不同分布的数目统计（E）六个五福花科物种重复类型总数目饼图（F）八个忍冬科物种重复类型总数目饼图。Figure 2. Maps obtained by repeat sequence analyses.(A) Histogram showing the number of repeats in the sixAdoxaceae chloroplast genomes. (B) Histogramshowing the number of repeats in the eight Caprifoliaceae chloroplast genomes. (C) Compositions ofthe repeats in sixAdoxaceae species. (D) Compositions of the repeats in sixAdoxaceae species. (E) Piechart showing the numbers of the three repeat types inAdoxaceae. (F) Pie chart showing the numbers ofthe three repeat types in Caprifoliaceae.
20图 3 十四种川续断目物种叶绿体基因组 LSC, SSC, IR 边界比较Figure3. Comparison of the border positions of LSC, SSC, and IR regions in thechloroplast genomes in six Adoxaceae species and eight Caprifoliaceae species.3.1.4 序列变异分析多个全叶绿体基因组序列的比较给我们提供了比较序列变异情况的机会。首先，
【参考文献】：
期刊论文
[1]蕨类植物叶绿体rps4基因的适应性进化分析[J]. 张丽君,陈洁,王艇. 植物研究. 2010(01)
[2]蓝靛果绿枝扦插繁殖技术的研究[J]. 林淑玲,杨利民,乔国平. 吉林农业大学学报. 2003(04)
[3]金银花中一个新的裂环环烯醚萜苷(英文)[J]. 李会军,李萍,王闽川,叶文才. 中国天然药物. 2003(03)
本文编号：3509266
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：94 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
六个五福花科和八个忍冬科物种叶绿体基因组图谱
图 2 叶绿体基因组重复序列分析（A）六个五福花科物种重复序列数目的直方图分布（B）八个忍冬科物种物种重复序列数目的直方图分布（C）六个五福花科物种重复序列不同分布的数目统计（D）八个忍冬科物种重复序列不同分布的数目统计（E）六个五福花科物种重复类型总数目饼图（F）八个忍冬科物种重复类型总数目饼图。Figure 2. Maps obtained by repeat sequence analyses.(A) Histogram showing the number of repeats in the sixAdoxaceae chloroplast genomes. (B) Histogramshowing the number of repeats in the eight Caprifoliaceae chloroplast genomes. (C) Compositions ofthe repeats in sixAdoxaceae species. (D) Compositions of the repeats in sixAdoxaceae species. (E) Piechart showing the numbers of the three repeat types inAdoxaceae. (F) Pie chart showing the numbers ofthe three repeat types in Caprifoliaceae.
20图 3 十四种川续断目物种叶绿体基因组 LSC, SSC, IR 边界比较Figure3. Comparison of the border positions of LSC, SSC, and IR regions in thechloroplast genomes in six Adoxaceae species and eight Caprifoliaceae species.3.1.4 序列变异分析多个全叶绿体基因组序列的比较给我们提供了比较序列变异情况的机会。首先，
【参考文献】：
期刊论文
[1]蕨类植物叶绿体rps4基因的适应性进化分析[J]. 张丽君,陈洁,王艇. 植物研究. 2010(01)
[2]蓝靛果绿枝扦插繁殖技术的研究[J]. 林淑玲,杨利民,乔国平. 吉林农业大学学报. 2003(04)
[3]金银花中一个新的裂环环烯醚萜苷(英文)[J]. 李会军,李萍,王闽川,叶文才. 中国天然药物. 2003(03)
本文编号：3509266
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3509266.html
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