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芸薹属物种(B.napus,B.rapa,B.oleracea)CAMTA4基因家族的鉴定与进化分析

发布时间:2022-12-18 09:58
  钙调蛋白在植物的生理代谢中起着重要作用,而钙调蛋白的转录翻译过程需要CAMTA的参与。为研究芸薹属植物中CAMTA4位点的分子进化,本研究利用生物信息学的方法,分析了甘蓝型油菜、白菜和甘蓝的CAMTA4家族核苷酸序列的基本特征和基因结构、蛋白序列的基本特征和功能域,以及它们的系统发生关系。结果显示,这3个物种的CAMTA4都具有CAMTA保守的结构域,且它们的进化符合禹氏三角理论和三倍化学说。本研究明确了甘蓝型油菜、白菜和甘蓝CAMTA4位点的进化历程,并且为研究芸薹属植物CAMTA的功能提供了生物信息学参考。 

【文章页数】:8 页

【文章目录】:
1 结果与分析
    1.1 芸薹属CAMTA4家族的鉴定
    1.2 芸薹属CAMTA4家族核苷酸序列的基本特征
    1.3 芸薹属CAMTA4家族氨基酸序列的基本特征
    1.4 芸薹属CAMTA4家族蛋白序列功能域分析
    1.5 芸薹属CAMTA4家族的染色体定位
    1.6 芸薹属CAMTA4家族的基因结构和系统发生关系
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 实验材料
    3.2 芸薹属CAMTA4家族的鉴定及序列基本特征分析
    3.3 芸薹属CAMTA4家族蛋白序列功能域分析及染色体定位
    3.4 芸薹属CAMTA4家族的基因结构及系统发生树的绘制
作者贡献


【参考文献】:
期刊论文
[1]芸薹属物种(B.napus,B.rapa,B.oleracea,B.juncea,B.nigra)MYB28家族的分子进化[J]. 陆俊杏,白辉扬,张涛.  分子植物育种. 2017(02)
[2]芸薹属物种基因组进化及比较基因组学研究进展[J]. 周灿,付东辉,周庆红.  基因组学与应用生物学. 2014(05)
[3]芸薹属物种(B.napus,B.oleracea,B.rapa)MAPK1家族的克隆、进化和表达特征[J]. 陆俊杏,卢坤,朱斌,彭茜,陆奇丰,曲存民,殷家明,李加纳,梁颖,柴友荣.  中国农业科学. 2013(16)
[4]逆境胁迫下ABA与钙信号转导途径之间的相互调控机制[J]. 孙芳,夏新莉,尹伟伦.  基因组学与应用生物学. 2009(02)



本文编号:3721849

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