长江上游犁头鳅遗传多样性研究

发布时间：2022-12-22 22:27

　　犁头鳅（Lepturichthys fimbriata）是一种底栖的小型鱼类,喜急流,产漂流性卵,主要分布在长江中上游干流及其支流。近年来,随着长江上游流域梯级水电站的建设运行,犁头鳅的适宜栖息地正逐渐被压缩,加上水域污染及过度捕捞,部分支流已很难发现犁头鳅的踪迹,其资源量面临下降的趋势。因此,本研究沿长江上游流域共采集7个种群的犁头鳅,利用微卫星和线粒体标记,在分子层面上探究长江上游犁头鳅的遗传多样性、遗传结构和种群历史动态,并提出保护建议。主要内容和结果如下:1.微卫星引物开发基于Illumina Novaseq 6000高通量测序技术开发犁头鳅多态性微卫星位点。高通量测序返回25180条可用微卫星序列,从中挑选出180对微卫星位点用于多态性筛选,最终获得22对扩增效果良好的微卫星多态性位点。22对多态性微卫星位点的等位基因数（NA）在9~30之间,观测杂合度（HO）范围在0.48~1.00之间,期望杂合度（HE）范围在0.70~0.98之间,多态性信息含量（PIC）为0.75~0.96,表明本研究开发的引物多态性较好。2.基于微卫星标记的遗传多样性研究从22对多态性微卫星位点中挑... 

【文章页数】：67 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 文献综述
    1.1 长江上游及鱼类概况
        1.1.1 长江上游自然环境特征
        1.1.2 长江上游鱼类多样性
        1.1.3 水电站建设对长江上游产漂流性卵鱼类的影响
    1.2 遗传多样性
        1.2.1 遗传多样性概念
        1.2.2 遗传多样性研究的意义
    1.3 遗传多样性研究中的分子标记
        1.3.1 线粒体DNA及其在鱼类种群遗传学研究中的应用
        1.3.2 微卫星标记及其在鱼类种群遗传学研究中的应用
    1.4 犁头鳅研究进展
        1.4.1 犁头鳅基础生物学研究
        1.4.2 犁头鳅遗传多样性研究
    1.5 本研究的目的及意义
第2章 基于微卫星标记的遗传多样性研究
    2.1 引言
    2.2 材料与方法
        2.2.1 实验材料
        2.2.2 实验仪器
        2.2.3 溶液配制
        2.2.4 研究方法
        2.2.5 数据分析
    2.3 结果
        2.3.1 微卫星位点组成
        2.3.2 多态性微卫星位点开发
        2.3.3 遗传多样性
        2.3.4 遗传结构
    2.4 讨论
        2.4.1 犁头鳅微卫星标记开发
        2.4.2 犁头鳅遗传多样性分析
        2.4.3 犁头鳅遗传结构分析
    2.5 保护建议
第3章 犁头鳅线粒体DNA遗传多样性研究
    3.1 引言
    3.2 材料与方法
        3.2.1 实验材料
        3.2.2 实验仪器
        3.2.3 研究方法
        3.2.4 数据分析
    3.3 结果
        3.3.1 序列变异及遗传多样性
        3.3.2 遗传结构
        3.3.3 种群历史
    3.4 讨论
        3.4.1 犁头鳅遗传多样性分析
        3.4.2 犁头鳅遗传结构分析
        3.4.3 犁头鳅种群历史分析
参考文献
附录
致谢
发表文章及科研实践活动


【参考文献】：
期刊论文
[1]大渡河乐山段鱼类群落结构特征研究[J]. 邓旭艳,王文君,方艳红,黄道明.  水生态学杂志. 2020(02)
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[3]三个地理种群的董氏须鳅遗传多样性及种群历史动态[J]. 陈浩,杨银盆,张慧,陈咏霞.  水生生物学报. 2019(05)
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博士论文
[1]石爬鮡复合种局域适应及物种形成的分子基础研究[D]. 李燕平.西南大学 2017
[2]长江上游保护区长薄鳅和红唇薄鳅种群生态及遗传结构比较研究[D]. 田辉伍.西南大学 2013
[3]鳅超科鱼类分子系统发育研究[D]. 唐琼英.华中农业大学 2005

硕士论文
[1]长江上游梯级水电开发对鱼类生物多样性影响的初探[D]. 李陈.华中科技大学 2012



本文编号：3724166