变形假单胞菌吡咯喹啉醌合成基因簇的克隆与分析

发布时间：2023-03-19 12:52

　　从变形假单胞菌JUIM01中克隆到吡咯喹啉醌(PQQ)合成基因簇,阐明了其基因组成和生物学信息。根据已报道的假单胞菌的基因组进行简并引物设计,采用LA-PCR技术克隆变形假单胞菌的PQQ合成基因簇,对克隆的基因片段进行测序并使用生物信息学方法进行综合分析。结果表明:克隆到的基因片段全长为11 659 bp,其中包括pqqF、pqqA、pqqB、pqqC、pqqD、pqqE、pqqM、pqqH和pqqI共9个基因,编码PQQ生物合成的前体短肽PqqA和合成途径的相关酶;这些基因与荧光假单胞菌Pf0-1的PQQ合成基因簇的基因组成类似,相应基因的序列一致性达41%～94%。本研究中首次从变形假单胞菌中克隆到PQQ合成基因簇,并对其进行生物信息学分析,为变形假单胞菌的PQQ生物合成途径和胞内再生机制的研究奠定了基础,进而为提高2KGA的生产强度提供了理论支撑。

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料
        1.1.1 菌株和质粒
        1.1.2 培养基
        1.1.3 主要工具酶和试剂
    1.2 实验方法
        1.2.1 基因组DNA的提取
        1.2.2 PCR引物的设计与合成
        1.2.3目的基因片段的扩增
        1.2.4 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 PQQ合成基因簇的克隆与重组质粒的构建
    2.2 PQQ合成基因簇的基因组成
    2.3 PQQ合成基因簇的非编码序列分析
    2.4 PQQ合成基因簇中各基因的生物信息学分析
3 结语



本文编号：3765280