转录组分析揭示BAM1/2与SPL调控拟南芥花药发育的功能关系及调控网络
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【部分图文】:
图1bam1/bam2/bam1bam2突变体花药中差异基因比较和生物学过程分析
为了进一步研究BAM1和BAM2调控下游基因时功能的冗余和独特性,我们将这1353个差异基因在3种突变体中的表达模式进行k-means聚类分析,将聚类而成的7组分别命名为G1~G7(图1(c)).G1组的111个基因在bam1、bam2、bam1bam2突变体中表达水平均和野生....
图2G1~G7组中花粉发育、脂质转运、转录、蛋白质泛素化和细胞壁组建相关基因的表达变化
G2组中的基因显著富集在对于胁迫和刺激的响应,包括抗干旱、抗病,毒素代谢、响应ABA等,另外也有一些基因显著参与了细胞壁组建过程,包括果胶裂解酶、果胶甲基酯酶、木葡聚糖水解酶、糖基水解酶等(图2(d)).2.3BAM1/2相关转录组和SPL相关转录组的比较分析
图3bam1bam2和spl突变体花药中差异基因比较和生物学过程分析
为了研究SPL和BAM1/2调控的生物学过程,我们将SPL和BAM1/2共同调控的下游基因、SPL特异调控基因、以及BAM1/2特异调控基因3个基因类群分别进行功能富集,发现SPL和BAM1/2共同调控的下游基因主要富集在花粉外壁发育、花粉发育、脂质转运和细胞壁组建过程,SPL特....
图4SPL特异调控基因在spl突变体花药中的表达变化
在SPL特异调控基因中,虽然没有花粉发育过程的显著富集,但值得注意的是,有56个花粉相关基因的表达水平特异地在spl中显著变化(图4(a)).WUS和KNU基因调控花原基的发育[16],AP3、SEP2、AG作为B基因调控雄蕊原基的发育[1],这表明除调控花药孢原细胞分化之外,S....
本文编号:3895227
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