北极熊与ABC棕熊双向的基因交流

发布时间：2024-04-08 20:26

　　北极熊是生活在北冰洋附近的海上哺乳动物,主要以环斑豹为食,适应北极终年寒冷的气候。棕熊是与北极熊有较近遗传关系的另一个物种,它们在分布范围、行态、行为以及生理都有着明显的不同。基因交流是通过杂交或者回交将等位基因从一个物种流向另一个分离物种的基因库中。基因交流广泛存在于哺乳动物中,对于物种的进化与适应起着重要的作用,比如犬属物种之间的基因交流产生新的物种,促进犬属的进化;牛属之间的基因交流对于它们适应高原环境以及驯化起着关键作用。而北极熊与ABC棕熊(生活在阿拉斯加Admiralty,Baranof和Chichagof三个岛屿的一种棕熊)在之前的研究中都存在着基因交流,然而对于它们之间基因交流的方向以及基因交流对于它们适应当地环境却没有很好的研究。北极熊与棕熊是在更新世分化的两个物种,在更新世存在多次冰期与间冰期的交替,它们是如何适应气候的变化以及在分离后存在一系列的混合对适应是否有影响?基于这样的背景,我们通过gphocs分析群体历史并通过PCAdmix、Dxy、rIBD等方法寻找到8个区域长度大于100 kb的基因交流的区域,从群体历史的分析以及对基因交流区域构建系统发育树,我们发...

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【部分图文】：

图３．１北极熊与棕熊的分歧时间??

８１．５２％。所有数据的深度都大于１４Ｘ?（附表）。经过严格的过滤条件，总的４３??个个体一共鉴定得到约７２．１４Ｍ的ＳＮＰ位点。??３．?２北极熊与棕熊的分歧时间与迁移率??通过Ｇ－ＰｈｏＣＳ对北极熊与ＡＢＣ棕熊进行群体历史分析，由于北极熊与棕??熊这两个物种就以往的研究来看，....

图３．?３?ＰＣＡｄｍｉｘ获得７个基因交流区域??１５??

１Ａ?２Ａ?３Ａ?４Ａ?５Ａ?６Ａ?７Ａ?８Ａ?９Ａ??ｈａｐｌｏｔｙｐｅ??图３．?２?ＡＢＣ棕熊所含祖先比例??ｓｃａｆｆｏｌｄ?１１?ｓｃａｆｆｏｌｄ?１９??圍圍???ｓ

图３．?２?ＡＢＣ棕熊所含祖先比例??ｓｃａｆｆｏｌｄ?１１?ｓｃａｆｆｏｌｄ?１９??圍圍???ｓｃａｆｆｏｌｄ２０?????

?ｓｃａｆｆｏｌｄ?１８７??圍關??图３．?３?ＰＣＡｄｍｉｘ获得７个基因交流区域??１５??

图３．?７?ＡＢＣ栋熊到北极熊基因交流区域的系统发育树??３．?６?ＡＢＣ棕熊两条单倍型不同的祖先比例??除了上述提到的北极熊与棕熊的双向基因流以外，我们还发现ＡＢＣ棕熊的??

ｓｃａｆｆｏｌｄ８３?ｓｃａｆｆｏｌｄ?１８７??图３．?６北极熊到ＡＢＣ棕熊基因交流区域的系统发育树??１９??

本文编号：3948767