病毒宏基因组学研究进展

发布时间：2024-05-09 21:00

　　病毒宏基因组学是一种新的病毒组学研究手段,随着高通量测序技术的飞速发展,人们能够从环境中快速发现、鉴定病毒基因组的组成并研究其特征。在过去的十年里,研究者们运用病毒宏基因组学发现了许多新型病毒,增强了人们对不同环境中病毒组成、分布和多样性的了解。因此,病毒宏基因组学已成为清晰描绘各种特殊环境中病毒图谱、了解自然界中病毒分布动态的有效工具。本文主要从病毒宏基因组的概念、样品前处理和病毒总基因组提取方法、测序技术以及病毒宏基因组的应用和发展前景方面进行概述。

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【部分图文】：

图3鸭肠道真核病毒相关序列的分类学分布[35]

病毒宏基因组的出现为一些高传染性和高致死性疾病提供了研究的可行性，利用与病毒宏基因组结合开发的新技术还可以对病毒进行实时监测，为人类未来战胜这些疾病奠定基础。此外，肠道中病毒是最丰富、最为多样的生物，其对肠道微生物菌群的调节起到关键作用。病毒宏基因组学方法也可以对这些肠道中的病毒....

图1病毒宏基因组和其他微生物宏基因组样品处理流程

环境中样品DNA的质量直接关系到病毒宏基因组分析的结果[11]。在开展病毒宏基因组分析时样品的选择和处理非常重要，应该选择病毒含量相对丰富且容易处理的样品。对于含水样品，可以选用切向流过滤(tangentialflowfiltration,TFF)，例如古氏病毒科(一种古细菌....

图2纳帕海病毒在科水平注释结果统计图

海洋具有极为丰富的病毒资源，病毒宏基因组的出现为海洋病毒基因组的研究带来了便捷，将人们对病毒的视野延伸到了以往无法探测的未知领域，对病毒的海洋生态作用有了更深入的了解。海洋表层中的病毒表现出丰富的多样性，海水中病毒颗粒含量约为107cells/mL，这些病毒在其宿主的发育、进化....

图1-1病毒宏基因组学研究主要技术路线示意图

中国农业科学院硕士学位论文第一章绪论5主要用于病毒检测及新病毒的发现、病毒组的鉴定和病毒准种的构建等。1.3.2病毒组研究进展图1-1病毒宏基因组学研究主要技术路线示意图Fig.1-1Diagrammaticrepresentationofmainstepsofaviralmet....

本文编号：3968544