茉莉花MK基因及启动子克隆与表达分析
发布时间:2024-05-10 03:07
甲羟戊酸激酶在植物萜类化合物合成中具有重要作用。本研究以茉莉花转录组测序数据为基础,利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,从双瓣茉莉花中获得甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase, MK)基因,命名为JsMK (GenBank登录号为MH311040)。测序结果显示JsMK全长cDNA为1 608 bp,包含开放阅读框(ORF) 1 164 bp,编码387个氨基酸。生物信息学分析结果表明该基因编码的蛋白可能定位于细胞质中,为非亲水性稳定蛋白,含有与其他MK蛋白所共有的3个保守区,以及GHMP家族特有的N端保守区和C端保守区。Blast比对和系统进化树分析结果表明,JsMK蛋白与野生油橄榄、长春花等多种植物的MK蛋白同源性较高。采用染色体步移技术(Genenome walking technique)扩增MK基因5’端上游调控序列,获得709 bp启动子序列,PlantCare分析表明该序列含有大量基本顺式作用元件TATAbox、CAATbox,还存在生长素(IAA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)等激素响应激素及多个光响应顺式调控元件。利用实时荧光定量PC...
【文章页数】:8 页
【文章目录】:
1 结果与分析
1.1 JsMK克隆及序列分析
1.2 JsMK蛋白理化性质分析
1.3 JsMK的同源比对分析
1.4 启动子序列分析
1.5 不同激素处理对JsMK基因表达水平的影响
2 讨论
3 材料与方法
3.1 试验材料
3.2 RNA提取及cDNA的合成
3.3 JsMK基因克隆
3.4 启动子的分离
3.5 生物信息学分析
3.6 JsMK实时荧光定量表达
作者贡献
本文编号:3968649
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1 结果与分析
1.1 JsMK克隆及序列分析
1.2 JsMK蛋白理化性质分析
1.3 JsMK的同源比对分析
1.4 启动子序列分析
1.5 不同激素处理对JsMK基因表达水平的影响
2 讨论
3 材料与方法
3.1 试验材料
3.2 RNA提取及cDNA的合成
3.3 JsMK基因克隆
3.4 启动子的分离
3.5 生物信息学分析
3.6 JsMK实时荧光定量表达
作者贡献
本文编号:3968649
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