黑水虻抗菌肽的克隆及其生物信息学分析

发布时间：2024-05-17 01:03

　　为了开发新型昆虫抗菌肽资源,以黑水虻幼虫为研究对象,采用RT-PCR技术从黑水虻幼虫总RNA中扩增到一个新型抗菌肽基因DLP-5,并利用在线生物软件和工具分析了抗菌肽DLP-5的生物信息学特征。结果表明,DLP-5由40个氨基酸残基组成,分子量为4 226.83 u,等电点为7.87,具有两亲性特征,其中N端为疏水性,C端为亲水性,具有3个磷酸化位点,无糖基化位点、信号肽序列和跨膜区。DLP-5的三级结构包含1个N端的loop区、1个α螺旋和1对反向平行β折叠,构成了防御素类抗菌肽典型的"环-螺旋-折叠"结构,说明DLP-5是一个新型的防御素类抗菌肽,可通过与微生物膜相互作用发挥其抗菌活性。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验方法
        1.2.1 黑水虻抗菌肽基因的克隆
        1.2.2 黑水虻抗菌肽基因的生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 黑水虻抗菌肽基因的克隆
    2.2 抗菌肽DLP-5的理化性质
    2.3 抗菌肽DLP-5的跨膜区和信号肽分析
    2.4 抗菌肽DLP-5的疏水性分析
    2.5 抗菌肽DLP-5的糖基化位点和磷酸化位点分析
    2.6 抗菌肽DLP-5的高级结构预测
3 讨论



本文编号：3975161