长江中下游地区水体中盔形溞的遗传多样性和微进化研究

发布时间：2024-10-03 06:51

　　长江中下游地区是我国富营养化湖泊分布的主要区域,不同湖泊水环境的差异可能导致水体中枝角类的遗传多样性发生变化。盔形溞（Daphnia galeata）作为溞属枝角类中的重要类群之一,在长江中下游地区分布广泛,常被用作模式生物。本文以盔形溞（D.galeata）为研究对象,以16S rDNA和CO I基因作为分子标记,将两种基因序列拼接,研究了长江中下游地区7个湖泊中盔形溞种群的遗传多样性及遗传分化。以巢湖为例,分析了长江中下游湖泊不同沉积层（A:1-3 cm,B:4-6 cm,C:7-9 cm,D:≥10 cm）中盔形溞遗传多样性的变化特征。主要研究结果如下:1.将16S rDNA和CO I基因序列拼接后,在7个盔形溞种群的152个个体中,共检测到变异位点54个,单倍型33个。单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性（π）指数分别为0.69和0.37%。种群内单倍型多样性和核苷酸多样性的变异范围分别是0.34～0.84和0.05%⁰.55%。7个盔形溞种群的遗传分化系数Fst为0.05。中性检验结果显示,长江中下游地区水体中盔形溞种群在历史上经历了瓶颈效应。AMOVA分析...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1溞属种类的生活史特点（引自吕凯[34]

分布图1溞属种类的生活史特点（引自吕凯[34]）Figure1LifehistorycharacteristicsofDaphniaspec

图2基于16SrDNA、COI基因及两者拼接构建的盔形溞单倍型网络图（A：16SrDNA基因序列，B：COI基因序列，C：16SrDNA和COI拼接序列

图2基于16SrDNA、COI基因及两者拼接构建的盔形溞单倍型网络图（A：16SrDNA基因序列，B：COI基因序列，C：16SrDNA和COI拼接序列。圆圈中不同的颜色代表不同湖泊的种群）Figure2Haplotypenetworkbas....

图3基于16SrDNA和COI基因序列组合的7个长江中下游湖泊中盔形溞种群单倍型的频率及地理分布

在位于长江下游的TH种群中也有发现（图3）。图2基于16SrDNA、COI基因及两者拼接构建的盔形溞单倍型网络图（A：16SrDNA基因序列，B：COI基因序列，C：16SrDNA和COI拼接序列。圆圈中不同的颜色代表不同湖泊的种群）Figure....

图4基于盔形溞16SrDNA基因序列构建的N-J系统进化树（不同的颜色代表不同种群）

图4基于盔形溞16SrDNA基因序列构建的N-J系统进化树（不同的颜色代表不同种群）Figure4Phylogenetictreeconstructedby16SrDNAgenesequenceofD.galeata.Differentco....

本文编号：4006884