五种吸虫核糖体全序列的扩增与特征分析

发布时间：2017-12-18 16:36

  本文关键词：五种吸虫核糖体全序列的扩增与特征分析

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【摘要】：吸虫是一种呈世界性分布的,主要寄生于宿主肝胆管及小肠等部位的寄生虫,造成畜牧业巨大经济损失的同时,人兽共患寄生虫还对人类的健康造成严重的威胁,甚至危及生命。核糖体在细胞中广泛存在,在生命活动中起着重要的作用,也是蛋白质合成的重要场所,核糖体DNA为编码核糖体RNA的基因,由可转录的核糖体RNA和不可转录的间隔区组成,通过对核糖体序列的测定可以对物种进行鉴定,确定物种的分类地位,明确物种的多样性等。因此,本研究采用PCR等方法对人畜危害严重的土耳其斯坦裂体吸虫雌虫和雄虫、东方次睾吸虫、华支睾吸虫、曲领棘缘吸虫和圆圃棘口吸虫的核糖体全序列进行扩增,对5种吸虫核糖体全序列的结构特征及同源性进行分析,并以不同的标记基因构建吸虫的系统发生树。结果表明,5种吸虫核糖体全序列长度为8209~8917 bp,每种吸虫核糖体全序列的6段基因在长度上几乎无变化,仅有土耳其斯坦裂体吸虫雌虫、雄虫的IGS长度有轻微变化。通过比较发现5种虫体间5.8S同源性高达92.4~100%,进化速率较慢的18S和28S的同源性也分别高达89.7~99.8%和80.3~96.8%,而ITS1、ITS2和IGS同源性分别为56.4~94.8%、49.5~96.2%和34.2~94.1%。由此可见,在各段核糖体序列中,种内差异小,种间差异大。同时,我们还能得到6段核糖体序列的保守性排序为:5.8S18S28SITS1ITS2IGS。以不同标记基因构建的进化树,每个进化树并非完全与传统分类学相符,基于18S、28S构建的进化树,在科、目之间的进化关系与传统分类学不符;基于ITS1、IGS构建的进化树,在属之间的进化关系与传统分类学不符;基于ITS2构建的进化树,与传统分类学相符。可见18S、ITS1、ITS2、28S、IGS分别适合用于目及以上、科间、属间、目及以上、科之间的进化关系。同时,根据现有较少的IGS序列,我们能够推断IGS能够作为基因标记,对吸虫的进化关系进行探讨。本研究首次获得了5种吸虫30条虫体的核糖体全序列,并对其结构特征、同源性进行了分析,丰富了复殖吸虫的核糖体全序列的数据,确定了各段基因的保守性排序,采取不同核糖体基因构建吸虫的系统进化树结果表明,不同标记基因适合于不同的分类阶元。
【学位授予单位】：黑龙江八一农垦大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：S852.7

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本文编号：1304874