四川23个桑树主栽品种分子标记的鉴定及其土壤微生物多样性的研究

发布时间：2018-03-30 00:21

本文选题：桑树种质资源　切入点：分子标记　出处：《西华师范大学》2017年硕士论文

【摘要】：目前,我国主要是按照桑树树叶或花的形态特征来对桑树的进行分类,这些分类结果并没有为建立以遗传物质为基础的分类系统提供更确切的依据,而桑树通过自然杂交所产生的许多过渡类型又很难仅根据形态指标进行整理、鉴定和归类。本研究利用分子标记技术从分子水平分析四川蚕区23个主栽桑树品种的遗传多样性,以期科学、合理地利用四川蚕区桑树品种资源。本研究采用ISSR、SRAP及SCAR三种分子标记对这23个主栽桑树品种的亲缘关系聚类,结果表明:ISSR分子标记扩增所得条带利用分析软件进行分析,将这23个桑树品种聚类为两大类;SRAP分子标记扩增所得条带利用分析软件进行分析,将这23个桑树品种聚类为四个大类;其中SRAP分子标记扩增所得的在23个桑树品种均出现的条带测序并对测序结果采用分析软件对其聚类,可将23个桑树品种聚类为两大类。而这三种聚类结果并不一致,这表明,这三种分类方法并不能随意选择一个,他们都有各自的优劣,这可能与桑树异花授粉,且在人工培育过程中造成了很多的突变种有关,因此,在以后的分类工作中可根据自己的目的与要求进行选择。SCAR分子标记一直以来都是从RAPD分子标记转化而来,而本次研究期望能够通过对SRAP分子标记进行转化,而得到能对这23个桑树品种进行聚类分析的SCAR分子标记,但是,此次研究未能成功找到能够将这23个桑树品种进行明显区分及聚类的SCAR分子标记,在以后的研究中可以从更多的SRAP分子标记中进行筛选,以期获得目的SCAR分子标记,以对这23个桑树品种进行稳定且明确的聚类。土壤微生物,作为土壤非常重要的一部分,主要在土壤有机质的降解、物质的转化以及微生物与植物之间能量的传递等方面具有重要作用。在土壤微生物与环境之间的相互关系中,土壤微生物功能的多样性主要是通过不同菌种间不同的生理生命活动来体现的。因此,在评价人为或自然因素引起土壤变化时可将微生物多样性作为一个重要的指标。鉴于土壤微生物对生态系统的这些影响,研究桑树土壤下的根际微生物对桑树的生长、发育以及相互之间的关系变得非常有意义。本研究利用土壤理化性质的研究及高通量测序这三种方法来研究23个主栽桑树品种根际土壤微生物群落结构的多样性,以探讨土壤微生物与桑树品种之间的利弊关系,从而寻找到更有利于桑树品种的生长的土壤微环境。结果显示不同的桑树品种对土壤理化性质的要求不同,不同桑树品种的优势菌群及根际间土壤细菌群落多样性不同,不同品种桑树与根际间细菌的种间互助造成了不同桑树品种根际间土壤理化性质的差异。采用高通量测序技术对3个主栽果桑桑树品种根际微生物进行测序,主要研究了桑树根际土壤微生物在门、纲、目、科、属上的细菌群落类型。所有102529条原始序列,原始数据经过去接头和过滤低质量,获得高质量的序列,这些序列分属于细菌的10个门,其中主要的门主要包括Fusobacteria(梭杆菌门)、Gemmatimonadetes(芽单胞菌门)、Firmicutes(厚壁菌门)、Bacteroidetes(拟杆菌门)、Nitrosiprae(硝化螺旋菌门)、Acidobacteria(酸杆菌门)、Chloroflexi(绿弯菌门)、Proteobacteria(变形菌门)、Actinobacteria(放线菌门),其中变形菌门和拟杆菌门在这三个桑种根际微生物中所占的比例最高,表明这两个细菌类群是主要的优势类群。这表明,尽管取样地点不同,但是微生物的类群均有一定的相似性。然而,不同的桑树品种下土壤微生物各个细菌类群的含量之间却存在明显的不同,这可能与不同桑树根系的分泌物不同而吸引了不同的细菌类群,更好地实现了桑树-根际微生物互利共生。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：西华师范大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：S888

【参考文献】