cAMP-PKA调控玉米大斑病菌极性生长的分子机制
发布时间:2020-11-09 14:42
在我国,玉米种植一直是农业发展的基石,在农业生产中占据很大的比例,玉米作为粮食界的三巨头之一,一直是农业经济的主导,所以其病害对国民经济的影响较大。常见的病害叶部病害包括玉米圆斑病、小斑病和大斑病,本文主要针对玉米大斑病,探索其致病菌——玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)的致病原理及信号通路。玉米大斑病菌是引发玉米大斑病的病原真菌,属典型的丝状真菌,其致病性受cAMP信号转导途径的调控。PKA是cAMP该信号通路的第二信使的主要效应物,它是一个四具体,包含2个调节亚基R和2个催化亚基C。本研究主要目的是明确在玉米大斑病菌的致病过程中,PKA及其下游转录因子StEFG1调控病菌发育及致病性的分子机制。本研究首先验证了 StpkaC2与转录因子StEFG1的互作关系,并鉴定了 StEFG1的下游靶基因StRab1;在△SpkaC1、△SpkaC2菌株中,检测了StRab1基因的表达水平,并利用Rab特异性抑制剂,通过分析抑制剂对病菌表型的影响,明确了 Rab对病菌极性生长的调控作用。此外,根据文献克隆了 PKA下游转录调控因子 Flo8的编码基因StFlo8,明确了StFlo8与2个PKA催化亚基及StEFG1的关系,同时,通过创制△Stflo8菌株,分析该基因的功能,并对其下游互作蛋白进行了筛选。所得主要结果如下:1.通过双分子荧光技术(BiFC)验证了 StEFG1与StpkaC2的互作关系。构建 pSPYCE(M)-StpkaC2、pSPYCE(M)-StEFG1、pSPYNE(R)-StpkaC2、pSPYNE(R)-StEFG14个重组载体,两两组合后导入农杆菌感受态细胞,使重组质粒表达,随后注射入烟草叶片中,观察烟草叶片中的荧光。在注射组合为pSPYCE(M)-StpkaC2::pSPYNE(R)-StEFG1的烟草叶片中能够看到GFP的荧光信号,阴性对照中则未检测到荧光信号,表明,StpkaC2与StEFG1之间存在互作关系。2.通过qPCR检测△SpkaC1、△SpkaC2菌株中与WT菌株差异表达且与菌丝生长有关的基因,获得protein ID为162018的基因。序列分析发现,该基因编码产物与小G蛋白Rab1同源性最高,我们将其命名为StRob1,在△SpkaC2菌株中其表达量达到WT菌株的13倍,且高于△SpkaC1菌株,与前期所得转录组数据相吻合。3.通过凝胶阻滞(EMSA)验证StEFG1与StRob1启动子的互作关系。生信分析发现,StRab1启动子区含有StEFG1的识别序列。将StEFG1进行原核诱导表达,提取并纯化活性蛋白,将活性蛋白与探针(含有StEFG1识别序列的StRab1启动子片段)温育使之结合,使用非变性凝胶分离探针,分析二者的互作关系。探针的长度为30 bp,将探针与StEFG1蛋白进行温育后,在非变性凝胶的80 bp-200 bp之间出现三条主带,表明蛋白与探针结合使探针的迁移速率发生改变,而作为阴性对照的BSA并没有改变探针的迁移速率,表明StEFG1蛋白与探针的结合是特异性的。4.通过qPCR试验检测StRab1基因在玉米大斑病菌侵染过程不同时期的表达量。以成熟菌丝为对照,β-tubulin基因为内参,孢子时期、芽管时期、附着胞时期以及侵入钉时期,该基因的相对表达量分别为:0.24、1.14、1.35、4.51。StRab1在侵入钉时期的表达水平最高,说明其可能在菌丝极性生长过程中发挥重要调控作用。5.通过抑制剂试验验证Rab与菌丝极性生长及几丁质合成的关系。用抑制剂处理后,△SpkaC2突变体的菌丝生长减缓,产孢能力得到一定的恢复;使用共聚焦显微镜观察经几丁质荧光染料着色的菌丝体,发现抑制剂处理的菌丝末端荧光信号减弱,说明几丁质的分布减少,菌丝的末端生长受限。6.通过酵母双杂交试验验证Stflo8与StpkaC1、Stflo8与StEFG1的互作关系。构建pGADT7-StpkaC1/StEFG1/Stflo8、pGBKT7-StpkaC1/StEFG1/Stflo8载体,pGADT7/pGBKT7-Stflo8 与 pGADT7/pGBKT7-StpkaC1、pGADT7/pGBKT7-StEFG1重组质粒进行组合,转入酵母感受态细胞后,在缺陷培养基上培养,结果显示,在SD/-Ade-His-Leu-Trp平板上只有pGADT7-StpkaC1与pGBKT7-Stflo8,pGADT7-Stflo8与 pGBKT7-StEFG1能生长,说明蛋白Stflo8与蛋白StpkaC1和StEFG1之间存在相互作用,而且这种相互作用是特异的。7.创制Stflo8缺失突变体,对该基因的功能进行分析。成功构建了Stflo8敲除载体,并将重组载体转化入病原真菌,创制了Stflo8基因敲除突变体。比较基因缺失突变体与野生型的表型,分析该基因的功能。结果表明,敲除该基因后,病菌的产孢量几乎为0,野生型在疏水介质培养36 h能够形成侵入钉,而突变体无法形成附着胞,同时敲除该基因后病菌的黑色素合成能力减弱。8.通过原核诱导表达Stflo8蛋白,利用Pull-down技术钓取该基因下游与之互作的蛋白。结果获得240多个蛋白在ncbi中进行比对分析,明确其功能及基因家族,统计发现其中6.67%为糖苷水解酶(glycoside hydrolase),4.44%为糖基水解酶(glycosyltransferase),2.22%为碳水化介物酯酶(carbohydrate esterase),其余蛋白质尚未标记其功能。综上所述,SpkaC2通过StEFG1调控StRab1的转录,影响病菌的极性生长;而SpkaC1通过StFlo8间接作用于StEFG1,调控StRab1的转录,对病菌极性生长的影响小于SpkaC2。研究丰富了对病菌cAMP信号途径作用机制的认识,为寻找病害防控新策略奠定了理论基础。
【学位单位】:河北农业大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2020
【中图分类】:S435.131
【部分图文】:
tem?of?A?StpkaC2\?C.?Conidium?stem?of?A?SlpkaC2 ̄C:?D.??Conidium?sieni?of?A?StpkaC2?which?disposed?hv?inhibitor.??1〇l??rrrr^?\vx??M〇?8"?FT?!?m?s^tpkaCl??、6-議發?^3?^tpkaC:?C??T3?:::::¥%??S?4?II::??;?議::??03?鐵???I?2-?II?鬥??0]^^ ̄ ̄.????图11不同菌株孢子产量量化图??I'ii!?11?QuaiHiUcd?spore?yield?ordiffcrcnl?strains??14.3?Uab抑制齐ij对病菌/L丁质含量及分布的影响??儿T质的是菌丝极性生长过程中细胞壁的重要组成成分,力菌丝的屮长发育??及侵染过程密切相关,几丁质的含量及分布在病菌侵染的过程中是泠关爪要的,??w此’购调介成儿r质的能力成为病菌侵染能力的.个_c要指标。比较分析野-十^??型1J突变体相关能力从而间接鉴定缺失基因对病菌致病性的调控作Hj。??八个几I)贞A成W浓wt和A?,S7/如r2中-_UW个M的表达松式,提収七凇??人斑病保丨野z小.型蘭株WT、A?57/^£/C'2以及A冲?知C’2-C等菌株菌丝屮的儿厂??质,迎过检测530nm?K的提収物溶液的波长来测记提取物中几丁质的含m。??提収液屮儿厂质的含祕越高,则溶液的颜色越深,迎过对提取液进彳Tl'l:观观??察发现,及缺尖突变体几T质提収液的颜&比野A型更深,而其欠??变体几M'质捉収液的颜色则较浅,测定各蘭株儿T质提取液在波长为6
?河北农业大学硕士学位(毕业)论文???3.6?敲除突变体创制??3.6.1聊沾敲除载体构建??对扩增的同源臂进行凝胶电泳监测,得到两个大小分别为520?bp、480?bp??的片段, ̄其基闪序列相符,对两个[nj源臂片段进行测序,通过DNAMAN进行??比较分析,朱见突变,利用该目的片段进行f续载体构建工作。??識二:??图19敲除载体同源臂1、2菌液l>CR检测凝胶电泳检样??Fig.IS)?Knockout?vector?homologous?arm?1.?2?bacteria?liquiil?PCR?detection?gel?electrophoresis?sample.??3.6.2?A?Slfh)H^}\%\\??将新逑的敲除载体通过PEG介导的方式转化到玉米大斑病菌中,在具有抗??中素的培奍姑屮进行初步筛选,通过抗性筛选,得到部分转化子,进—步在抗性??培养站中纯化转化了,待转化子能够稳定屮长后,进一步进行DNA水平的检测,??提取转化丫?及野屯型的基因纟丨1?DNA,以构让的敲除载体的质粒为模板作为阳性??对照,以玉米人斑病调野中型轴W组DNA为模板作为阴性对照,对同源臂 ̄筛??选标记的连接部位进行扩增,结见V小,把/H?佘株转化子中,釕…株能够扩增??,lll,人小为926bp的条带,lR^a式验M,^到扣M的试验结见,获得?株阳性转??化子,将该转化子进-步纯化f进行炎型观察以分析基因功能。??图20?l)NA水平验证转化子电泳检样图??l?ii!?20?DNA?level?\cnlicalion?imcrlcr?electrophoresis?diagram??从左到右依次为MmkT
部分转化子,进—步在抗性??培养站中纯化转化了,待转化子能够稳定屮长后,进一步进行DNA水平的检测,??提取转化丫?及野屯型的基因纟丨1?DNA,以构让的敲除载体的质粒为模板作为阳性??对照,以玉米人斑病调野中型轴W组DNA为模板作为阴性对照,对同源臂 ̄筛??选标记的连接部位进行扩增,结见V小,把/H?佘株转化子中,釕…株能够扩增??,lll,人小为926bp的条带,lR^a式验M,^到扣M的试验结见,获得?株阳性转??化子,将该转化子进-步纯化f进行炎型观察以分析基因功能。??图20?l)NA水平验证转化子电泳检样图??l?ii!?20?DNA?level?\cnlicalion?imcrlcr?electrophoresis?diagram??从左到右依次为MmkT,阳性对照,阴性对照,转化子??34??
【参考文献】
本文编号:2876577
【学位单位】:河北农业大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2020
【中图分类】:S435.131
【部分图文】:
tem?of?A?StpkaC2\?C.?Conidium?stem?of?A?SlpkaC2 ̄C:?D.??Conidium?sieni?of?A?StpkaC2?which?disposed?hv?inhibitor.??1〇l??rrrr^?\vx??M〇?8"?FT?!?m?s^tpkaCl??、6-議發?^3?^tpkaC:?C??T3?:::::¥%??S?4?II::??;?議::??03?鐵???I?2-?II?鬥??0]^^ ̄ ̄.????图11不同菌株孢子产量量化图??I'ii!?11?QuaiHiUcd?spore?yield?ordiffcrcnl?strains??14.3?Uab抑制齐ij对病菌/L丁质含量及分布的影响??儿T质的是菌丝极性生长过程中细胞壁的重要组成成分,力菌丝的屮长发育??及侵染过程密切相关,几丁质的含量及分布在病菌侵染的过程中是泠关爪要的,??w此’购调介成儿r质的能力成为病菌侵染能力的.个_c要指标。比较分析野-十^??型1J突变体相关能力从而间接鉴定缺失基因对病菌致病性的调控作Hj。??八个几I)贞A成W浓wt和A?,S7/如r2中-_UW个M的表达松式,提収七凇??人斑病保丨野z小.型蘭株WT、A?57/^£/C'2以及A冲?知C’2-C等菌株菌丝屮的儿厂??质,迎过检测530nm?K的提収物溶液的波长来测记提取物中几丁质的含m。??提収液屮儿厂质的含祕越高,则溶液的颜色越深,迎过对提取液进彳Tl'l:观观??察发现,及缺尖突变体几T质提収液的颜&比野A型更深,而其欠??变体几M'质捉収液的颜色则较浅,测定各蘭株儿T质提取液在波长为6
?河北农业大学硕士学位(毕业)论文???3.6?敲除突变体创制??3.6.1聊沾敲除载体构建??对扩增的同源臂进行凝胶电泳监测,得到两个大小分别为520?bp、480?bp??的片段, ̄其基闪序列相符,对两个[nj源臂片段进行测序,通过DNAMAN进行??比较分析,朱见突变,利用该目的片段进行f续载体构建工作。??識二:??图19敲除载体同源臂1、2菌液l>CR检测凝胶电泳检样??Fig.IS)?Knockout?vector?homologous?arm?1.?2?bacteria?liquiil?PCR?detection?gel?electrophoresis?sample.??3.6.2?A?Slfh)H^}\%\\??将新逑的敲除载体通过PEG介导的方式转化到玉米大斑病菌中,在具有抗??中素的培奍姑屮进行初步筛选,通过抗性筛选,得到部分转化子,进—步在抗性??培养站中纯化转化了,待转化子能够稳定屮长后,进一步进行DNA水平的检测,??提取转化丫?及野屯型的基因纟丨1?DNA,以构让的敲除载体的质粒为模板作为阳性??对照,以玉米人斑病调野中型轴W组DNA为模板作为阴性对照,对同源臂 ̄筛??选标记的连接部位进行扩增,结见V小,把/H?佘株转化子中,釕…株能够扩增??,lll,人小为926bp的条带,lR^a式验M,^到扣M的试验结见,获得?株阳性转??化子,将该转化子进-步纯化f进行炎型观察以分析基因功能。??图20?l)NA水平验证转化子电泳检样图??l?ii!?20?DNA?level?\cnlicalion?imcrlcr?electrophoresis?diagram??从左到右依次为MmkT
部分转化子,进—步在抗性??培养站中纯化转化了,待转化子能够稳定屮长后,进一步进行DNA水平的检测,??提取转化丫?及野屯型的基因纟丨1?DNA,以构让的敲除载体的质粒为模板作为阳性??对照,以玉米人斑病调野中型轴W组DNA为模板作为阴性对照,对同源臂 ̄筛??选标记的连接部位进行扩增,结见V小,把/H?佘株转化子中,釕…株能够扩增??,lll,人小为926bp的条带,lR^a式验M,^到扣M的试验结见,获得?株阳性转??化子,将该转化子进-步纯化f进行炎型观察以分析基因功能。??图20?l)NA水平验证转化子电泳检样图??l?ii!?20?DNA?level?\cnlicalion?imcrlcr?electrophoresis?diagram??从左到右依次为MmkT,阳性对照,阴性对照,转化子??34??
【参考文献】
相关期刊论文 前5条
1 齐尧尧;张冬梅;周洁;鲁国东;;真菌Rab蛋白功能的研究进展[J];武夷科学;2011年00期
2 周秀芝;赵巍;王斌;喻娜娜;闫志勇;钱冬萌;宋旭霞;丁守怡;;烟曲霉蛋白激酶A催化亚基对孢子萌发和抗氧化损伤的调节作用[J];医学研究生学报;2010年10期
3 罗璇;石慧;郭城;王金华;;产类胡萝卜素红酵母细胞壁成分分离及含量检测方法的研究[J];农产品加工(学刊);2010年03期
4 赵缜;樊绮诗;;Rab蛋白在囊泡运输和信号传导中的作用[J];生命的化学;2009年05期
5 代养勇,曹健,李浪,曾实,赵阳,张延华;真菌几丁质和壳聚糖研究进展[J];郑州工程学院学报;2004年03期
相关博士学位论文 前3条
1 叶文雨;稻瘟病菌中小GTP酶激活蛋白(RhoGAPs)的功能分析[D];福建农林大学;2013年
2 张冬梅;稻瘟病菌Rab蛋白功能研究[D];福建农林大学;2009年
3 沈玉保;酵母cAMP信号转导及时序衰老机制研究[D];天津大学;2012年
相关硕士学位论文 前1条
1 林颢丞;小麦条锈菌几丁质酶基因Pst_23943的功能分析[D];西北农林科技大学;2019年
本文编号:2876577
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/2876577.html
教材专著