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甜瓜CmbHLH93和CmbHLH130基因在果实发育中的作用

发布时间:2020-12-17 05:51
  甜瓜是一种在全世界范围内被广泛栽培的经济价值极高的园艺作物。同时也是研究植物性别分化和果实成熟过程的葫芦科模式植物之一。本研究选用种植于内蒙古自治区巴彦淖尔市河套地区的甜瓜品种河套蜜瓜(Cucumis melo L.cv Hetao melon)作为研究材料。对甜瓜转录因子bHLH家族进行系统分析,并通过实验室已获得的甜瓜果实转录组数据挑选了两个在果实不同发育时期高效表达的基因CmbHLH93和CmbHLH130进行研究。主要结果如下:(1)通过生物信息学方法,在甜瓜全基因组中共鉴定到bHLH基因家族成员160个,编码213个蛋白质。根据甜瓜bHLH基因结构将内含子分布模式分为13种。染色体定位表明CmbHLH93和CmbHLH130基因分别位于甜瓜3号和1号染色体。利用氨基酸序列构建系统发育进化树将bHLH家族分为18个亚族,其中CmbHLH93和CmbHLH130蛋白分别属于第18和8亚族;序列分析表明7-18亚族保守性较高。甜瓜bHLH蛋白具有HLH或bHLH-MYC-N结构域,10个成员还具有ACT结构域。氨基酸保守基序分析表明,甜瓜bHLH蛋白具有motif1或motif2基... 

【文章来源】:内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校

【文章页数】:116 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

甜瓜CmbHLH93和CmbHLH130基因在果实发育中的作用


植物转录因子家族[4]

DNA序列,蛋白,二聚体


?槌桑?庥兄?赽HLH蛋白形成同二聚体或异二聚体复合物[42,43]。在bHLH蛋白结构域中,有19个(其中5个位于碱性区,5个位于第一螺旋,1个位于环区,8个位于第二螺旋)氨基酸是保守的,这对DNA结合或二聚体形成起重要作用。一个高度保守的HER基序(His5-Glu9-Arg13)被认为对结合特定的DNA序列很重要,但是一些非典型的bHLH缺乏N-端结合区[44]。bHLH蛋白二聚化和对不同E-box的识别为其调节不同的转录程序提供了多样性,HLH蛋白还可以通过与DNA结合的bHLH蛋白形成非DNA结合的异源二聚体而发挥bHLH蛋白的负调控作用(图1.2)[39,45]。图1.2bHLH蛋白的结构模型[39,45]Figure1.2ThestructuralmodelofbHLHproteins[39,45]1.2.3bHLH蛋白的功能在过去的几十年里,在几个物种上对bHLH蛋白的特性和功能进行了深刻而广泛的研究。作为最大的TF家族之一,bHLH基因参与调控植物的生长发育、非生物/生物胁迫、激素信号转导、铁的动态平衡、次生代谢等[46-50]。酵母bHLH蛋白在增强转录和调控细胞周期中的

模型图,蛋白,模型,二聚体


?槌桑?庥兄?赽HLH蛋白形成同二聚体或异二聚体复合物[42,43]。在bHLH蛋白结构域中,有19个(其中5个位于碱性区,5个位于第一螺旋,1个位于环区,8个位于第二螺旋)氨基酸是保守的,这对DNA结合或二聚体形成起重要作用。一个高度保守的HER基序(His5-Glu9-Arg13)被认为对结合特定的DNA序列很重要,但是一些非典型的bHLH缺乏N-端结合区[44]。bHLH蛋白二聚化和对不同E-box的识别为其调节不同的转录程序提供了多样性,HLH蛋白还可以通过与DNA结合的bHLH蛋白形成非DNA结合的异源二聚体而发挥bHLH蛋白的负调控作用(图1.2)[39,45]。图1.2bHLH蛋白的结构模型[39,45]Figure1.2ThestructuralmodelofbHLHproteins[39,45]1.2.3bHLH蛋白的功能在过去的几十年里,在几个物种上对bHLH蛋白的特性和功能进行了深刻而广泛的研究。作为最大的TF家族之一,bHLH基因参与调控植物的生长发育、非生物/生物胁迫、激素信号转导、铁的动态平衡、次生代谢等[46-50]。酵母bHLH蛋白在增强转录和调控细胞周期中的


本文编号:2921515

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