利用Multi-color FISH建立羊草染色体辨认体系
发布时间：2020-12-27 19:48
羊草Leymus chinensis（Trin.）Tzvel是我国境内重要的牧草资源,被称作禾本科牧草之王。羊草不仅具有重要的经济价值和生态价值,而且作为普通小麦的三级基因库与天然进化的多倍体,也具有很高的学术价值。然而,对羊草的细胞遗传学研究和基因组层面的解析却相对落后,其基本基因组组成、基因组结构、物理图谱、系统进化等重要生物学信息非常有限,严重阻碍了生产中对羊草资源的评价、保护与利用。植物染色体辨认技术是植物细胞遗传学中重要的技术方法,特别是在未实现全基因组测序的物种中,可以促进物种基因组结构、系统发育以及染色体行为的研究,在植物基因组学研究中发挥着独特而重要的作用。本研究以羊草为材料,通过低覆盖率测序、生物信息学分析、多色多次FISH、单拷贝序列FISH等技术手段,建立了羊草染色体精确辨认体系,实现了羊草染色体辨认图与小麦遗传连锁图的关联,并对不同地域来源的羊草进行了核型比较。本研究增进了对羊草基因组结构的了解,统一了羊草染色体的命名,建立起的羊草现代细胞遗传学染色体精确辨认体系为进一步研究羊草及其近缘种的系统进化关系提供了研究工具。主要研究结果如下:（1）利用低覆盖率测序技术...
【文章来源】：内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
筛选出的以串联重复序列或rDNA序列为主的聚类及聚类分析结果
利用Multi-colorFISH建立羊草染色体辨认体系29图3.2羊草单个重复序列荧光原位杂交结果图Figure3.2FISHresultsofthetandemrepeatedsequencesofL.chinensis图3.2A~J分别为5SrDNA（红色）、18SrDNA（红色）、26SrDNA（白色）、CL6（红色）、CL95（绿色）、CL121（红色）、CL151（绿色）、CL162（绿色）、CL163（绿色）、CL239（红色）串联重复序列的荧光原位杂交结果。标尺：10μmFigure3.2AtoJaretheFISHresultsofthetandemrepeatsof5SrDNA(red),18SrDNA(red),26SrDNA(white),CL6(red),CL95(green),CL121(red),CL151(green),CL162(green),CL163(green),CL239(red),respectively.Allthebarare10μm.
内蒙古大学硕士学位论文32图3.3羊草根尖有丝分裂中期染色体一次杂交结果图Figure3.3Resultsofone-timechromosomehybridizationofL.chinensisroottipmitosis图3.3A表示重复序列CL162（绿色）、5SrDNA（红色）、26SrDNA（白色）在羊草根尖有丝分裂中期染色体（染色体DAPI染色后呈蓝色）上的信号分布；B表示图A中红色信号单通道图片，显示5SrDNA信号在染色体上的位置及数量；C表示图A中绿色信号单通道图片，显示CL162信号在染色体上的位置及数量；D表示图A中白色信号单通道图片，显示26SrDNA信号在染色体上的位置及数量。标尺：10μmFigure3.3ArepresentsthesignaldistributionoftherepeatsequencesCL162(green),5SrDNA(red),and26SrDNA(white)onthemitochondrialmetaphasechromosomes(chromosomeisblueafterDAPIstaining)oftheroottipofL.chinensis;Singlechannelpictureshowingthepositionandquantityof5SrDNAsignalonthechromosome;CrepresentsthesinglechannelpictureofthegreensignalinfigureA,whichshowsthepositionandquantityofCL162signalonthechromosome;DmeansthesinglechannelpictureofthewhitesignalinfigureA,showingThepositionandnumberof26SrDNAsignalsonchromosomes.Allthebarsare10μm.
【参考文献】：
期刊论文
[1]不同种源羊草表型差异性[J]. 李阳,魏继平,马红媛. 生态学报. 2020(04)
[2]羊草种质资源的评价与利用[J]. 刘公社,李晓霞,齐冬梅,陈双燕,程丽琴. 科学通报. 2016(02)
[3]基于形态和叶表皮微形态特征试论国产赖草属属下类群间的系统关系[J]. 李兆孟,周勇辉,刘玉萍,苏旭. 植物研究. 2016(01)
[4]赖草(Leymus secalinus(Georgi)Tzvel.)中一个染色体标记的克隆与鉴定[J]. 李媛,喻凤,赵闫闫,窦全文. 植物遗传资源学报. 2015(04)
[5]植物染色体标本的制备和染色体核型分析研究进展[J]. 丁鸿,邱东萍,陈少雄. 南方农业学报. 2012(12)
[6]赖草属植物的表型分支系统学分析[J]. 沙莉娜,凡星,杨瑞武,王晓丽,周永红. 四川农业大学学报. 2009(01)
[7]国产赖草属的分类修订[J]. 蔡联炳,苏旭. 植物研究. 2007(06)
[8]对羊草细胞生物学研究的回顾[J]. 马鹤林,索培芬. 内蒙古草业. 2006(03)
[9]植物染色体核型分析常用方法概述[J]. 刘永安,冯海生,陈志国,畅喜云,刘瑞娟,窦全文,王海庆. 贵州农业科学. 2006(01)
[10]国产赖草属的叶表皮特征与组群划分[J]. 蔡联炳,张梅妞. 植物研究. 2005(04)
博士论文
[1]水稻基因组序列分析及比较基因组研究[D]. 张玉军.中国科学院研究生院（上海生命科学研究院） 2003
本文编号：2942376
【文章来源】：内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
筛选出的以串联重复序列或rDNA序列为主的聚类及聚类分析结果
利用Multi-colorFISH建立羊草染色体辨认体系29图3.2羊草单个重复序列荧光原位杂交结果图Figure3.2FISHresultsofthetandemrepeatedsequencesofL.chinensis图3.2A~J分别为5SrDNA（红色）、18SrDNA（红色）、26SrDNA（白色）、CL6（红色）、CL95（绿色）、CL121（红色）、CL151（绿色）、CL162（绿色）、CL163（绿色）、CL239（红色）串联重复序列的荧光原位杂交结果。标尺：10μmFigure3.2AtoJaretheFISHresultsofthetandemrepeatsof5SrDNA(red),18SrDNA(red),26SrDNA(white),CL6(red),CL95(green),CL121(red),CL151(green),CL162(green),CL163(green),CL239(red),respectively.Allthebarare10μm.
内蒙古大学硕士学位论文32图3.3羊草根尖有丝分裂中期染色体一次杂交结果图Figure3.3Resultsofone-timechromosomehybridizationofL.chinensisroottipmitosis图3.3A表示重复序列CL162（绿色）、5SrDNA（红色）、26SrDNA（白色）在羊草根尖有丝分裂中期染色体（染色体DAPI染色后呈蓝色）上的信号分布；B表示图A中红色信号单通道图片，显示5SrDNA信号在染色体上的位置及数量；C表示图A中绿色信号单通道图片，显示CL162信号在染色体上的位置及数量；D表示图A中白色信号单通道图片，显示26SrDNA信号在染色体上的位置及数量。标尺：10μmFigure3.3ArepresentsthesignaldistributionoftherepeatsequencesCL162(green),5SrDNA(red),and26SrDNA(white)onthemitochondrialmetaphasechromosomes(chromosomeisblueafterDAPIstaining)oftheroottipofL.chinensis;Singlechannelpictureshowingthepositionandquantityof5SrDNAsignalonthechromosome;CrepresentsthesinglechannelpictureofthegreensignalinfigureA,whichshowsthepositionandquantityofCL162signalonthechromosome;DmeansthesinglechannelpictureofthewhitesignalinfigureA,showingThepositionandnumberof26SrDNAsignalsonchromosomes.Allthebarsare10μm.
【参考文献】：
期刊论文
[1]不同种源羊草表型差异性[J]. 李阳,魏继平,马红媛. 生态学报. 2020(04)
[2]羊草种质资源的评价与利用[J]. 刘公社,李晓霞,齐冬梅,陈双燕,程丽琴. 科学通报. 2016(02)
[3]基于形态和叶表皮微形态特征试论国产赖草属属下类群间的系统关系[J]. 李兆孟,周勇辉,刘玉萍,苏旭. 植物研究. 2016(01)
[4]赖草(Leymus secalinus(Georgi)Tzvel.)中一个染色体标记的克隆与鉴定[J]. 李媛,喻凤,赵闫闫,窦全文. 植物遗传资源学报. 2015(04)
[5]植物染色体标本的制备和染色体核型分析研究进展[J]. 丁鸿,邱东萍,陈少雄. 南方农业学报. 2012(12)
[6]赖草属植物的表型分支系统学分析[J]. 沙莉娜,凡星,杨瑞武,王晓丽,周永红. 四川农业大学学报. 2009(01)
[7]国产赖草属的分类修订[J]. 蔡联炳,苏旭. 植物研究. 2007(06)
[8]对羊草细胞生物学研究的回顾[J]. 马鹤林,索培芬. 内蒙古草业. 2006(03)
[9]植物染色体核型分析常用方法概述[J]. 刘永安,冯海生,陈志国,畅喜云,刘瑞娟,窦全文,王海庆. 贵州农业科学. 2006(01)
[10]国产赖草属的叶表皮特征与组群划分[J]. 蔡联炳,张梅妞. 植物研究. 2005(04)
博士论文
[1]水稻基因组序列分析及比较基因组研究[D]. 张玉军.中国科学院研究生院（上海生命科学研究院） 2003
本文编号：2942376
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/2942376.html
教材专著
