苦荞种质资源产量性状和籽粒黄酮含量与SSR标记的关联分析
发布时间：2021-01-06 02:02
以230份苦荞种质资源为材料,在三个播种环境中调查了籽粒黄酮含量、初花期、盛花期、株高、主茎分枝数、单株粒数、单株粒重、百粒质量、籽粒长、籽粒宽、籽粒长宽比、籽粒面积、籽粒直径、籽粒周长和籽粒产量等15个性状,并分析了这15个性状的遗传变异,研究了农艺性状对籽粒黄酮含量和籽粒产量的影响,筛选了籽粒黄酮含量和籽粒产量表现优异的苦荞种质,为高产优质苦荞的选育推荐基础材料。利用59对SSR引物分析了苦荞种质的遗传多样性、群体结构和连锁不平衡（LD）状况等,并且对调查性状进了关联分析。所得结果如下:1.苦荞种质籽粒黄酮含量和产量性状的变异分析除百粒质量、籽粒周长和籽粒宽外,播种环境对其他12个性状都产生了极其显著影响。籽粒黄酮含量在2018S、2018A和2019A三个环境中的变异范围基本保持一致,分别是1.37%2.84%、1.12%2.81%和1.08%2.83%,变异系数分别为12.06%、13.27%和14.33%,为中等变异程度,说明苦荞种质的籽粒黄酮含量受环境变化的影响较小,比较稳定,有一定的改良空间。在三个环境中,...
【文章来源】：贵州师范大学贵州省
【文章页数】：137 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于候选基因的关联分析
贵州师范大学硕士学位论文18图1基于全基因组的关联分析Fig.1Associationanalysisbasedonwholegenome（2）候选基因关联分析基于候选基因的关联分析需要对目标性状可能的基因有一定的预测和筛选，并对候选基因进行测序分析或者SNP检测，利用统计学的方法挖掘基因与性状之间的关系，定位与性状紧密连锁的基因，并筛选功能等位变异（赵惠等，2018；王瑞果，2013；段继凤，2013）。候选基因关联分析需要对目标性状的背景知识有所了解，并有基因表达、突变体或者基因功能、代谢途径的相关证据确定的候选基因。此方法已成功应用于大豆（Tianetal.,2010）、水稻（Tianetal.,2009）和玉米（Yanetal.,2011）等作物的数量性状研究中。Wen等（2015）采用候选基因关联分析确定了2个与玉米籽粒代谢途径相关的基因。图2是进行候选基因关联分析的步骤。图2基于候选基因的关联分析Fig.2Associationanalysisbasedoncandidategenes
文献综述23含量与产量性状进行变异性、相关性、主成分及聚类分析，挖掘影响苦荞种质籽粒产量、籽粒黄酮含量的主要因素，筛选籽粒产量高、籽粒黄酮含量高且其他产量性状均表现良好的苦荞种质。同时对苦荞种质的SSR分子标记进行遗传多样性、连锁不平衡（LD）和群体结构的分析，基于群体结构分析对苦荞种质的籽粒黄酮含量、籽粒产量性状与SSR标记进行3个不同播种季节下的关联分析，检测与籽粒黄酮含量、产量性状相关联的SSR标记。主要内容有如下四个部分：一、苦荞种质籽粒黄酮含量和产量相关性状的变异分析二、高产、高籽粒黄酮含量的苦荞种质筛选三、苦荞种质籽粒SSR分子标记遗传多样性评价及群体结构的分析四、苦荞种质籽粒黄酮含量和产量相关性状的关联分析1.7.3本研究的技术路线注：虚线框的内容是由石桃雄老师完成的。图3本研究的技术路线Fig.3Thetechnicalrouteofthisstudy
【参考文献】：
期刊论文
[1]甜玉米种子营养品质主要性状全基因组关联分析[J]. 王长进,徐运林,程昕昕,周毅,余海兵. 浙江农业学报. 2020(03)
[2]切花菊耐寒性相关SNP位点挖掘与候选基因分析[J]. 范宏虹,徐婷婷,苏江硕,孙炜,种昕冉,管志勇,房伟民,陈发棣,张飞. 园艺学报. 2019(11)
[3]芫荽遗传多样性与性状的关联分析[J]. 李小梅,张景涛. 湖北农业科学. 2019(21)
[4]大麦抗条纹病与SSR标记的关联分析[J]. 司二静,孟亚雄,李葆春,马小乐,张宇,王化俊. 植物保护学报. 2019(05)
[5]甘蓝型油菜每角粒数的全基因组关联分析[J]. 孙程明,陈锋,陈松,彭琦,张维,易斌,张洁夫,傅廷栋. 作物学报. 2020(01)
[6]长江中下游麦区小麦地方种质千粒重全基因组关联分析[J]. 程宇坤,李健,姚方杰,蒋云峰,江千涛,李伟,蒲至恩,邓梅,魏育明,陈国跃. 四川农业大学学报. 2019(04)
[7]基于SSR的四川花生遗传多样性分析[J]. 侯睿,张小军,岳福良,张小红,李爽,刘行,张相琼,李文均. 中国农学通报. 2019(25)
[8]荞麦种质资源概况[J]. 范昱,丁梦琦,张凯旋,杨克理,唐宇,张宗文,方沩,严俊,周美亮. 植物遗传资源学报. 2019(04)
[9]普通小麦主要农艺性状的全基因组关联分析[J]. 翟俊鹏,李海霞,毕惠惠,周思远,罗肖艳,陈树林,程西永,许海霞. 作物学报. 2019(10)
[10]基于超滤技术的苦荞提取物抑制α-葡萄糖苷酶活性研究[J]. 李云龙,韩林,王敏. 中国粮油学报. 2019(05)
博士论文
[1]稻米品质性状的全基因组关联分析及品质相关基因的遗传解析[D]. 赵达.华中农业大学 2019
[2]基于自然群体及MAGIC群体关联分析解析陆地棉重要农艺性状的遗传基础[D]. 黄聪.华中农业大学 2018
[3]马铃薯种质资源遗传多样性研究及块茎性状的全基因组关联分析[D]. 王舰.中国农业大学 2017
[4]基于全基因组关联分析的水稻分蘖角度和剑叶夹角的遗传基础解析[D]. 董海娇.华中农业大学 2017
[5]水稻籽粒相关性状QTL鉴定与基因克隆研究[D]. 陈立凯.华南农业大学 2016
[6]亚麻分子标记的开发及产量相关性状的关联分析[D]. 邓欣.中国农业科学院 2013
硕士论文
[1]陆地棉优异种质资源遗传结构与重要农艺性状关联分析[D]. 张娜瑶.西北大学 2019
[2]小豆种质资源抗旱性筛选鉴定及相关基因关联分析[D]. 单云鹏.北京农学院 2019
[3]油菜种质资源耐寒性鉴定与全基因组关联分析[D]. 袁淑培.中国农业科学院 2019
[4]利用连锁不平衡发掘大豆灰斑病10号小种抗性位点[D]. 梁晓宇.黑龙江大学 2019
[5]甘蔗栽培品种的主要农艺性状与AFLP和SSR分子标记的关联分析[D]. 朱专为.福建农林大学 2018
[6]寒地水稻种质品质特性及其连锁不平衡分析[D]. 苗百更.佳木斯大学 2018
[7]中国小豆资源的遗传多样性及产量相关性状与SSR标记的关联分析[D]. 吉雯雯.山西农业大学 2018
[8]水稻糊化温度控制基因ALK的遗传多样性及对稻米理化品质的影响[D]. 李闯.扬州大学 2017
[9]大豆微核心种质群体产量相关性状的全基因组关联分析[D]. 张友谊.南京农业大学 2017
[10]甘蓝型油菜含油量和蛋白质含量相关基因的定位分析[D]. 袁姜莲.西南大学 2017
本文编号：2959711
【文章来源】：贵州师范大学贵州省
【文章页数】：137 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于候选基因的关联分析
贵州师范大学硕士学位论文18图1基于全基因组的关联分析Fig.1Associationanalysisbasedonwholegenome（2）候选基因关联分析基于候选基因的关联分析需要对目标性状可能的基因有一定的预测和筛选，并对候选基因进行测序分析或者SNP检测，利用统计学的方法挖掘基因与性状之间的关系，定位与性状紧密连锁的基因，并筛选功能等位变异（赵惠等，2018；王瑞果，2013；段继凤，2013）。候选基因关联分析需要对目标性状的背景知识有所了解，并有基因表达、突变体或者基因功能、代谢途径的相关证据确定的候选基因。此方法已成功应用于大豆（Tianetal.,2010）、水稻（Tianetal.,2009）和玉米（Yanetal.,2011）等作物的数量性状研究中。Wen等（2015）采用候选基因关联分析确定了2个与玉米籽粒代谢途径相关的基因。图2是进行候选基因关联分析的步骤。图2基于候选基因的关联分析Fig.2Associationanalysisbasedoncandidategenes
文献综述23含量与产量性状进行变异性、相关性、主成分及聚类分析，挖掘影响苦荞种质籽粒产量、籽粒黄酮含量的主要因素，筛选籽粒产量高、籽粒黄酮含量高且其他产量性状均表现良好的苦荞种质。同时对苦荞种质的SSR分子标记进行遗传多样性、连锁不平衡（LD）和群体结构的分析，基于群体结构分析对苦荞种质的籽粒黄酮含量、籽粒产量性状与SSR标记进行3个不同播种季节下的关联分析，检测与籽粒黄酮含量、产量性状相关联的SSR标记。主要内容有如下四个部分：一、苦荞种质籽粒黄酮含量和产量相关性状的变异分析二、高产、高籽粒黄酮含量的苦荞种质筛选三、苦荞种质籽粒SSR分子标记遗传多样性评价及群体结构的分析四、苦荞种质籽粒黄酮含量和产量相关性状的关联分析1.7.3本研究的技术路线注：虚线框的内容是由石桃雄老师完成的。图3本研究的技术路线Fig.3Thetechnicalrouteofthisstudy
【参考文献】：
期刊论文
[1]甜玉米种子营养品质主要性状全基因组关联分析[J]. 王长进,徐运林,程昕昕,周毅,余海兵. 浙江农业学报. 2020(03)
[2]切花菊耐寒性相关SNP位点挖掘与候选基因分析[J]. 范宏虹,徐婷婷,苏江硕,孙炜,种昕冉,管志勇,房伟民,陈发棣,张飞. 园艺学报. 2019(11)
[3]芫荽遗传多样性与性状的关联分析[J]. 李小梅,张景涛. 湖北农业科学. 2019(21)
[4]大麦抗条纹病与SSR标记的关联分析[J]. 司二静,孟亚雄,李葆春,马小乐,张宇,王化俊. 植物保护学报. 2019(05)
[5]甘蓝型油菜每角粒数的全基因组关联分析[J]. 孙程明,陈锋,陈松,彭琦,张维,易斌,张洁夫,傅廷栋. 作物学报. 2020(01)
[6]长江中下游麦区小麦地方种质千粒重全基因组关联分析[J]. 程宇坤,李健,姚方杰,蒋云峰,江千涛,李伟,蒲至恩,邓梅,魏育明,陈国跃. 四川农业大学学报. 2019(04)
[7]基于SSR的四川花生遗传多样性分析[J]. 侯睿,张小军,岳福良,张小红,李爽,刘行,张相琼,李文均. 中国农学通报. 2019(25)
[8]荞麦种质资源概况[J]. 范昱,丁梦琦,张凯旋,杨克理,唐宇,张宗文,方沩,严俊,周美亮. 植物遗传资源学报. 2019(04)
[9]普通小麦主要农艺性状的全基因组关联分析[J]. 翟俊鹏,李海霞,毕惠惠,周思远,罗肖艳,陈树林,程西永,许海霞. 作物学报. 2019(10)
[10]基于超滤技术的苦荞提取物抑制α-葡萄糖苷酶活性研究[J]. 李云龙,韩林,王敏. 中国粮油学报. 2019(05)
博士论文
[1]稻米品质性状的全基因组关联分析及品质相关基因的遗传解析[D]. 赵达.华中农业大学 2019
[2]基于自然群体及MAGIC群体关联分析解析陆地棉重要农艺性状的遗传基础[D]. 黄聪.华中农业大学 2018
[3]马铃薯种质资源遗传多样性研究及块茎性状的全基因组关联分析[D]. 王舰.中国农业大学 2017
[4]基于全基因组关联分析的水稻分蘖角度和剑叶夹角的遗传基础解析[D]. 董海娇.华中农业大学 2017
[5]水稻籽粒相关性状QTL鉴定与基因克隆研究[D]. 陈立凯.华南农业大学 2016
[6]亚麻分子标记的开发及产量相关性状的关联分析[D]. 邓欣.中国农业科学院 2013
硕士论文
[1]陆地棉优异种质资源遗传结构与重要农艺性状关联分析[D]. 张娜瑶.西北大学 2019
[2]小豆种质资源抗旱性筛选鉴定及相关基因关联分析[D]. 单云鹏.北京农学院 2019
[3]油菜种质资源耐寒性鉴定与全基因组关联分析[D]. 袁淑培.中国农业科学院 2019
[4]利用连锁不平衡发掘大豆灰斑病10号小种抗性位点[D]. 梁晓宇.黑龙江大学 2019
[5]甘蔗栽培品种的主要农艺性状与AFLP和SSR分子标记的关联分析[D]. 朱专为.福建农林大学 2018
[6]寒地水稻种质品质特性及其连锁不平衡分析[D]. 苗百更.佳木斯大学 2018
[7]中国小豆资源的遗传多样性及产量相关性状与SSR标记的关联分析[D]. 吉雯雯.山西农业大学 2018
[8]水稻糊化温度控制基因ALK的遗传多样性及对稻米理化品质的影响[D]. 李闯.扬州大学 2017
[9]大豆微核心种质群体产量相关性状的全基因组关联分析[D]. 张友谊.南京农业大学 2017
[10]甘蓝型油菜含油量和蛋白质含量相关基因的定位分析[D]. 袁姜莲.西南大学 2017
本文编号：2959711
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