小麦抗病分子标记的筛选及其关联基因功能预测

发布时间：2021-01-18 13:14

　　小麦（Triticum aestivum L.）是全世界上最重要的粮食作物之一,它的栽培历史可以追溯到8000多年前。人们对小麦产量与品质的需求随着人口数量的增长逐步上升。小麦生产受到各种病原菌侵染的影响。选择培育抗性品种是通过发掘新的抗病位点并克隆,经过设计杂交组合或分子标记辅助育种的方法,是最有效的手段。随着小麦及其祖先种基因组测序工作的完成,产生了大量可分析数据。生物信息学是一门综合性交叉学科,旨在利用研究基因组学与蛋白质组学。农业生物信息学产生于生物信息学,在农作物的应用,识别重要基因的组织结构与分布规律,预测新基因,研究抗性基因的进化有着重要作用。本文筛选出41个与小麦抗病相关的特异性分子标记,进行电子克隆。并通过功能预测、GO注释获得抗病性相关基因,通过KEGG分析揭示小麦与致病菌互作过程中相关功能基因的生物学信息和分子机制。本文试验研究内容如下:（1）在Linux平台上对小麦抗病标记在中国春及其祖先种乌拉尔图小麦（Triticum urartu）,粗山羊草（Aogilops tauschii）中进行电子定位,来确定抗病基因在染色体的实际位置。定位结果使用MapChart ... 

【文章来源】：山西大学山西省

【文章页数】：66 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
ABSTRACT
第一章 前言
    1.1 分子标记研究进展
        1.1.1 基于非PCR技术的分子标记
        1.1.2 基于PCR技术的分子标记
    1.2 小麦抗病基因研究进展
        1.2.1 抗白粉病基因研究进展
        1.2.2 抗条锈病基因研究进展
        1.2.3 抗叶锈病基因研究进展
        1.2.4 抗秆锈病基因研究进展
    1.3 电子定位及电子克隆
    1.4 生物信息学
        1.4.1 基因预测
        1.4.2 基因注释（GO）
        1.4.3 KEGG分析
    1.5 试验设计
        1.5.1 目的和意义
        1.5.2 技术路线
第二章 小麦抗病基因的电子定位
    2.1 材料和方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 方法
    2.2 结果与分析
    2.3 讨论
第三章 小麦抗病分子标记筛选
    3.1 材料与方法
        3.1.1 试验材料
        3.1.2 试验方法
    3.2 结果与分析
        3.2.1 筛选结果
        3.2.2 聚类分析
    3.3 讨论
第四章 小麦抗病基因的生物信息学分析
    4.1 材料与方法
    4.2 结果与分析
        4.2.1 小麦基因功能预测
        4.2.2 小麦功能基因的GO注释
        4.2.3 基于KEGG的代谢通路分析
    4.3 讨论
第五章 SSR标记验证
    5.1 材料与方法
        5.1.1 材料
        5.1.2 方法
    5.2 结果与分析
    5.3 讨论
第六章 结论
参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简况及联系方式



本文编号：2985013