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烟草次生代谢物合成基因簇的鉴定与分析

发布时间:2021-03-15 22:08
  烟草属植物普通烟草(Nicotiana tabacum L.)是一种重要的经济作物。普通烟草叶片表面能分泌产生丰富的次生代谢产物,在植物的防御反应中扮演着重要角色,尤其是萜类植物抗毒素,因此烟草常被作为次生代谢物与生物胁迫响应关系的研究对象。植物萜类次生代谢物的合成通常由染色体某个区间内彼此功能相关的非同源基因进行调控,这种基因集合也被成为基因簇,区间内所有代谢基因构成一个完整的代谢途径,有利于植物高效、稳定地合成次生代谢物。植物全基因组基因簇预测是挖掘基因组重要信息的有效手段,而目前已开发的预测方法较为局限,未能充分利用转录组测序数据、代谢通路数据库等信息进行次生代谢基因簇鉴定,从基因簇的角度解析植物基因组的特征。为此,本研究在前人的基础上,以普通烟草栽培品种K326为研究对象,搭建了适用于复杂基因组作物的全基因组基因簇研究方案,并对普通烟草的次生代谢基因簇进行鉴定与分析,取得了以下结果:(1)搭建了一套适用于普通烟草基因组的次生代谢物合成基因簇分析流程,为今后应用于其他复杂基因组提供参考(2)在普通烟草基因组中预测到1,181个基因簇,包含参与次生代谢物合成的116个,其中34个参... 

【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:78 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

烟草次生代谢物合成基因簇的鉴定与分析


普通烟草中几种次生代谢物的化学结构

烟草次生代谢物合成基因簇的鉴定与分析


植物基因簇示意图(以玉米DIMBOA合成基因簇为例)

烟草次生代谢物合成基因簇的鉴定与分析


已报道的植物次生代谢基因簇(部分)[21,33]

【参考文献】:
期刊论文
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[3]植物次生代谢基因簇研究进展[J]. 吕海舟,刘琬菁,何柳,徐志超,罗红梅.  植物科学学报. 2017(04)
[4]基因共表达网络的构建及分析方法研究综述[J]. 汪涛,蒋庆华,彭佳杰,王亚东.  智能计算机与应用. 2014(06)
[5]烟草重要基因篇:1.烟草抗病相关基因[J]. 龚达平.  中国烟草科学. 2014(01)
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[7]中国烤烟种植品种现状分析与展望[J]. 徐安传,胡巍耀,李佛琳,邓国宾,张晓龙,唐丽,胡小曼.  云南农业大学学报(自然科学). 2011(S2)



本文编号:3084894

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