水稻剑叶维管束性状的全基因组关联分析

发布时间：2021-05-18 19:31

　　水稻的光合作用受到叶片维管束系统的影响,在此过程中,细胞分化模式对于维持叶片光合作用起着重要的作用。叶片维管束和叶肉面积与水稻产量密切相关。但目前对水稻叶片维管束相关性状的遗传分析仍知之甚少。本研究利用386份水稻种质资源为试材,在总群体、籼稻亚群和粳稻亚群对水稻叶片大、小维管束数和面积,维管束间的距离,以及维管束间叶肉面积进行两年的全基因组关联分析。检测影响水稻叶片维管束相关性状的主效QTL,将重要QTL区间内的所有基因的SNP进行单倍型分析,结合生物信息学分析,预测可能的候选基因。研究结果具体如下:1.水稻386份种质资源在剑叶维管束数量和面积,维管束间的距离,以及维管束间叶肉面积上表现广泛的遗传变异。这13个叶片维管束相关性状在水稻籼粳亚种间均存在显著的差异。大、小维管束面积与维管束间叶肉面积呈极显著的正相关。2.本研究利用3K RGP水稻重测序数据库中的4.8M SNP基因型数据,在总群体、籼稻亚群和粳稻亚群分别检测到71、50和44个影响水稻叶片维管束性状的QTL。其中70个QTL在两年同时检测到,5个QTL在总群体和籼稻亚群同时检测到,26个QTL在总群体和粳稻亚群同时检测... 

【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省

【文章页数】：70 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略词表
1 前言
    1.1 水稻叶片维管束相关性状的构造和功能
    1.2 水稻叶片维管束相关性状的发育调控机制
        1.2.1 细胞机制
        1.2.2 分子机制
        1.2.3 植物激素的影响
    1.3 全基因组关联分析研究进展
        1.3.1 全基因组关联分析概述
        1.3.2 全基因组关联分析在水稻中的应用
    1.4 试验的目的与意义
2 材料与方法
    2.1 试验材料
    2.2 试验设计
    2.3 表型鉴定
    2.4 表型数据分析
    2.5 基因型数据分析
    2.6 全基因组关联分析
    2.7 候选基因的单倍型分析
3 结果分析
    3.1 叶片维管束性状的表型观察
        3.1.1 表型变异
        3.1.2 相关性分析
    3.2 SNP的基因型与群体结构分析
        3.2.1 基因型分析
        3.2.2 群体结构分析
    3.3 全基因组关联分析
    3.4 候选基因分析
    3.5 QTL表达的一因多效性
4 讨论
    4.1 候选基因分析
    4.2 水稻产量性状的育种应用
5 结论
参考文献
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]油菜素内酯调控植物生长发育及产量品质研究进展[J]. 肖瑞雪,郭丽丽,贾琦石,郭大龙,侯小改.  江苏农业科学. 2019(10)
[2]植物B3转录因子的结构和功能[J]. 刘颖慧,董志平.  分子植物育种. 2017(05)
[3]水稻复杂性状研究的新途径:水稻重要农艺性状全基因组关联分析[J]. 侯青青,司丽珍,黄学辉,韩斌.  生命科学. 2016(10)
[4]水稻ABC1基因家族的鉴定及在非生物胁迫下的表达分析[J]. 高清松,张丹,徐亮,徐辰武.  中国水稻科学. 2011(01)
[5]一个水稻大叶角度突变体lla的遗传分析及基因克隆[J]. 汪得凯,张红心,胡国成,付亚萍,斯华敏,孙宗修.  科学通报. 2005(04)
[6]水稻理想株形育种的理论和方法初论[J]. 杨守仁,张龙步,王进民.  中国农业科学. 1984(03)

博士论文
[1]水稻苗期稻瘟病抗性的全基因组关联分析[D]. 王彩红.中国农业科学院 2014
[2]水稻卷叶突变体的细胞形成机制以及OUL1基因的克隆和功能研究[D]. 邹良平.中国农业科学院 2012

硕士论文
[1]水稻窄卷叶突变体nrl4的遗传分析与基因定位[D]. 梁容.浙江大学 2017
[2]水稻矮化宽叶突变体dw1的鉴定与功能分析[D]. 廖红香.西南大学 2016



本文编号：3194360