日本鳗鲡干扰素调节因子11（IRF11）的转录调控及功能的初步研究

发布时间：2021-06-12 01:07

　　干扰素调节因子（Interferon regulatory factors,IRFs）是一类重要的转录因子,可结合干扰素（Interferon,IFN）和干扰素诱导基因（Interferon-stimulated gene,ISG）的启动子区调控其表达,在抗病毒、抗肿瘤,细胞增殖和凋亡等过程中发挥着重要的作用。至今,在鱼类中已报道了11个IRF家族成员,即IRF1-11,其中IRF11为硬骨鱼类中所特有的。本论文以日本鳗鲡为研究对象,对其IRF11的功能特征进行了初步探讨,主要结果如下:克隆获得了日本鳗鲡IRF11基因（AjIRF11）,其cDNA全长1321 bp,编码281个氨基酸,蛋白分子量理论值为31.97 kDa。序列分析结果显示,AjIRF11属于IRF1亚家族成员,其DBD结构域包含6个保守的色氨酸残基。基因共线性分析结果显示,AjIRF11的上游基因和下游基因分别为CHS1和KIF1BP,其下游基因链与腔棘鱼和斑点雀鳝IRF11下游基因链一致,在棘鳍类中,IRF11基因均位于IL4R.1和NIP7基因之间,推测IRF11基因可能在硬骨鱼类进化过程中经历了谱系特异性的基因... 

【文章来源】：集美大学福建省

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2-1日本鳗鲡IRF11基因的cDNA序列及推导的氨基酸序列

集美大学硕士学位论文日本鳗鲡干扰素调节因子11（IRF11）的转录调控及功能的初步研究19图2-2日本鳗鲡IRF11与其它脊椎动物IRFs的系统进化分析利用ClustalX2对IRFs进行多重序列比对，利用MEGA7软件，采用NJ（Neighbor-Joining）法绘制系统进化树。节点上的数字为bootstrap的置信度。Fig.2-2PhylogeneticanalysisofIRF11inJapaneseeelandothervertebrateIRFsThemultiplesequencealignmentofIRFsiscarriedoutbyClustalX2,andthephylogenetictreeisdrawnbyNJ(Neighbor-Joining)methodusingMEGA7software.Bootstrapvaluesareindicatedatnodes.

集美大学硕士学位论文日本鳗鲡干扰素调节因子11（IRF11）的转录调控及功能的初步研究20图2-3脊椎动物IRFsDBD结构域多重比对序列上方的实心框、箭头和线分别表示α螺旋，β折叠和环的相对位置。DBD中的保守的色氨酸残基（W）用灰色阴影表示。“*”表示相同残基，“.和:”表示相似残基。Fig.2-3MultiplealignmentoftheDBDdomainsofvertebrateIRFsSolidboxes,arrows,andlinesabovethesequenceindicatetherelativepositionsofthealphahelix,thebetafold,andtheloop,respectively.Conservedtryptophanresidues(W)inDBDareindicatedingreyshading.Similarresiduesareindicatedwithdotsandcolons.2.3.3基因共线性分析本研究克隆获得的日本鳗鲡IRF11基因位于日本鳗鲡基因组数据库ANJA000034，对其上下游基因预测发现，IRF11的上游和下游基因分别为CHS1（Chitinsynthase1）和KIF1BP（Kif1bindingprotein），其下游基因链为KIF1BP-VPSA26A-SUPV3L1-HKDC1-HK1-TACR2-TSPAN15-RUFY2，与腔棘鱼和斑点雀鳝IRF11下游基因链一致，而在斑马鱼基因组中这个基因链则在IRF11下游约22Mbp左右（如图2-4A所示）。在棘鳍类中，IRF11基因都位于IL4R.1（Interleukin4receptor,tandemduplicate1）和NIP7（Nucleolar


本文编号：3225639