玉米灌浆期干旱胁迫转录组学研究
发布时间：2021-07-28 03:53
玉米作为一种多位一体,集粮食作物、能源与饲料作物于一身的重要农作物,在现代产业体系中拥有着无可比拟的作用。玉米受到多种自然灾害的威胁,干旱作为一种常见非生物胁迫,首当其冲。灌浆期的干旱对于玉米来说尤为致命。灌浆的不充分将直接导致减产。随着科技的进步,玉米的研究也从理化试验进一步深化为分子层面的研究。而过往的苗期盆栽试验并不能完全揭示玉米抗旱的分子机理。本研究以两个经过审定的、且具有不同抗旱性的玉米杂交品种为试验材料。在大田环境培养至灌浆期,分别进行干旱和水对照处理。在叶片方面,全部植株都出现了不同程度的萎蔫状态且株高有明显差异。与水对照相比,耐旱型品种农单476中有5769个基因特异性的上调表达,7352个基因特异性的下调表达;不耐旱型品种众信978中,7255个基因上调表达,5877个基因下调表达。抗旱材料特异性表达的上调基因中,氮代谢过程和生物合成相关基因被广泛富集到;下调部分中,蛋白质磷酸化和磷脂信号通路相关基因被广泛富集。韦恩图筛选获得具有生物学意义的3个重要基因集,其中品种间抗旱差异基因集包含1305个DEGs。占整个SDTD基因集的29.36%,这也可...
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２两品种在处理１２天后的表型（在四张小图中，左边是干旱处理，右边是水对照处理）??
?河北农业大学硕士学位（毕业）论文???ＧＯ?ａｎｎｏｔａｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｕｐ?ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｏｎｌｙ?ｉｎ?ＴＣ＿ＴＤ??２，５００－ｊ?｜??｜?２，０００－?議??ｍ???Ｉ，，．?Ｉ．??ｍｆｆｒｆｍ??ｌ｝?／Ａ??＆ｉ〇｛〇＜ｊｃａｉ＿ｌ＞ｒｏｃｅｓｓ?ｃｔｌｕｔｅｆ＿ｃｏｍ｝Ｈｍｅｎｔ?ｍ＾ｅａｉｌａｒｊｉ＾ｉｃｔｉｏｎ??ＧＯ?ａｎｎｏｔａｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｄｏｗｎ?ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｏｎｌｙ?ｉｎ?ＴＣ＿ＴＤ??３，０００??鳴‘ＩＩ…Ｌ—??腳??ＬＪ」」—」ｉ」??ｔＨ〇ｆ〇９ｆｃａＳ＿ｐｒｏｃｅｓｓ?ｃｅ：ｌｙｌａｒ＿ｃｏｍｐｏｎ＾ｌ?ｍ＾ｃｕｌａｒｊｕｎｃｔｊｏｎ??图５仅在ＴＣ－ＴＤ中表达的下调或上调基因的ＧＯ注释和分类。??区域一、区域二的ＧＯ分析??Ｆｉｇｕｒｅ?５?ＧＯ?ａｎｎｏｔａｔｉｏｎｓ?ａｎｄ?ｃａｔｅｇｏｎｅｓ?ｏｆ?ｃＩｏｗｔｉ?ｏｒ?ｕｐ?ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｏｎｌｙ?ｉｎ?ＴＣ＿ＴＤ．??ＧＯ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?Ａｒｅａ?Ｉ?ａｎｄ?Ａｒｅａ?ＩＩ??１４??
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【参考文献】：
期刊论文
[1]干旱胁迫和复水处理下玉米差异表达转录因子基因分析[J]. 张鹏钰,王国瑞,曹丽茹,袁珍,库丽霞,王同朝,卫丽. 农业生物技术学报. 2020(02)
[2]水分胁迫对不同耐旱性玉米土壤水分消耗、水分利用和产量的影响[J]. 蒿宝珍,马静丽,方保停,姜丽娜,赵凌霄,翁正鹏,朱娅林. 玉米科学. 2019(06)
[3]玉米耐旱性的遗传机理及分子育种研究进展[J]. 贾钰莹,孙成韬,于佳霖,刘晓丽. 园艺与种苗. 2019(12)
[4]中国植物应答环境变化研究的过去与未来[J]. 杨淑华,巩志忠,郭岩,龚继明,郑绍建,林荣呈,杨洪全,毛龙,秦峰,罗利军,张天真,储成才,赖锦盛,晁代印,关雪莹,彭佳师,黄朝峰,蒋才富,王瑜,杨永青,施怡婷,丁杨林,马亮,种康. 中国科学:生命科学. 2019(11)
[5]干旱胁迫下水稻转录因子表达变化[J]. 朱长保,徐辰峰,刘仁梅,林中正,成立瑞. 中国农学通报. 2019(06)
[6]生物测序技术发展综述[J]. 武思文. 科技经济导刊. 2018(34)
[7]单细胞基因组和转录组的共测定方法研究进展[J]. 万睿璇,周抒遥,徐欢笛,汪浩宇,娄云阁,姜净,邹秉杰,宋沁馨,周国华. 中国现代应用药学. 2018(09)
[8]Transcriptomic responses to aluminum（Al） stress in maize[J]. XU Li-ming,LIU Chan,CUI Bao-ming,WANG Ning,ZHAO Zhuo,ZHOU Li-na,HUANG Kai-feng,DING Jian-zhou,DU Han-mei,JIANG Wei,ZHANG Su-zhi. Journal of Integrative Agriculture. 2018(09)
[9]转录组测序技术研究进展[J]. 洪奇阳,毕行建,王大宁,李子真,俞海,夏宁邵,李少伟. 中国生化药物杂志. 2017(06)
[10]不同程度干旱对春玉米生物量和产量影响的模拟[J]. 武荣盛,吴瑞芬,孙小龙,田磊,侯琼,张超,孙琳丽. 生态学杂志. 2015(09)
博士论文
[1]基于转录组测序的玉米耐旱调控网络分析[D]. 刘旭洋.中国农业科学院 2019
[2]转录组测序数据分析在玉米籽粒功能基因挖掘中的应用[D]. 何骋.中国农业大学 2017
硕士论文
[1]基于Illumina平台RNA测序数据集的转录组拼接算法设计[D]. 武思文.天津师范大学 2019
[2]基于转录组测序的玉米耐旱基因挖掘[D]. 张晓静.中国农业科学院 2017
[3]苗期玉米叶片响应非生物胁迫的转录组分析[D]. 曹维.扬州大学 2017
本文编号：3307156
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２两品种在处理１２天后的表型（在四张小图中，左边是干旱处理，右边是水对照处理）??
?河北农业大学硕士学位（毕业）论文???ＧＯ?ａｎｎｏｔａｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｕｐ?ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｏｎｌｙ?ｉｎ?ＴＣ＿ＴＤ??２，５００－ｊ?｜??｜?２，０００－?議??ｍ???Ｉ，，．?Ｉ．??ｍｆｆｒｆｍ??ｌ｝?／Ａ??＆ｉ〇｛〇＜ｊｃａｉ＿ｌ＞ｒｏｃｅｓｓ?ｃｔｌｕｔｅｆ＿ｃｏｍ｝Ｈｍｅｎｔ?ｍ＾ｅａｉｌａｒｊｉ＾ｉｃｔｉｏｎ??ＧＯ?ａｎｎｏｔａｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｄｏｗｎ?ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｏｎｌｙ?ｉｎ?ＴＣ＿ＴＤ??３，０００??鳴‘ＩＩ…Ｌ—??腳??ＬＪ」」—」ｉ」??ｔＨ〇ｆ〇９ｆｃａＳ＿ｐｒｏｃｅｓｓ?ｃｅ：ｌｙｌａｒ＿ｃｏｍｐｏｎ＾ｌ?ｍ＾ｃｕｌａｒｊｕｎｃｔｊｏｎ??图５仅在ＴＣ－ＴＤ中表达的下调或上调基因的ＧＯ注释和分类。??区域一、区域二的ＧＯ分析??Ｆｉｇｕｒｅ?５?ＧＯ?ａｎｎｏｔａｔｉｏｎｓ?ａｎｄ?ｃａｔｅｇｏｎｅｓ?ｏｆ?ｃＩｏｗｔｉ?ｏｒ?ｕｐ?ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｏｎｌｙ?ｉｎ?ＴＣ＿ＴＤ．??ＧＯ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?Ａｒｅａ?Ｉ?ａｎｄ?Ａｒｅａ?ＩＩ??１４??
｜?－＾ｒ?Ｊ?Ｊ?５??：?Ｂ?！ｏｇ１０（ＳＤ＿ｍｅａｎ）?ＦＰＫＭ??｜ｌ轉：??：ｒ?－?￣?：：ｗ??￣ｉ?驾??ＳＣ?ＴＣ?ＳＤ＿ＴＤ?Ｔｆｌ??（ｊ?／??：?—一ｆ??Ｊ??ｐ?ｍ＼－?＾?，??＊?Ｉ?ｎｓ??－１５?％?０?Ｓｉｚｅ?ｏｆ?ｅａｃｈ?Ｓｓｔ??？?？??ｒ＞?＜４４５?懲??４４１５?４４４５??Ａ?广＇１＾￣￣￣??Ａ?ＺＸＤ１?ＺＸＤ２?ＺＸＤ３?ＮＤＤ３?ＮＤＤ２?ＮＤＤ１?．??图６众信９７８和农单４７６之间差异表达基因（ＤＥＧｓ）的分析。??（Ａ．）干旱胁迫处理后两品种间ＤＥＧｓ聚类分析的热图。（Ｂ．）散点图，展示ＳＤ＿ＳＴ中ＤＥＧｓ的表达（ｌｏｇｌＯＦＰＫＭ）。??（Ｃ．）显示ＳＣ＿ＴＣ和ＳＤ＿ＴＤ之间ＤＥＧ数的维恩图??Ｆｉｇｕｒｅ?６?Ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｇｅｎｅｓ?（ＤＥＧｓ）?ｂｅｔｗｅｅｎ?ＺＸ９７８?ａｎｄ?ＮＤ４７６．??（Ａ．）?Ｈｅａｔ?ｍａｐ?ｓｈｏｗｉｎｇ?ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ＤＥＧｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｔｈｅ?ｔｗｏ?ｃｕｌｔｉｖａｒｓ?ａｆｔｅｒ?ｄｒｏｕｇｈｔ?ｓｔｒｅｓｓ?ｔｒｅａｔｍｅｎｔ?（ＳＤ＿ＴＤ）＿??（Ｂ．）?Ｓｃａｔｔｅｒ?ｐｌｏｔ?ｓｈｏｗｉｎｇ?ｔｈｅ?（ｌｏｇｌ?０?ＦＰＫＭ）?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?ＤＥＧｓ?ｉｎ?ｔｈｅ?ＳＤ＿ＴＤ．?（Ｃ．）?Ｖｅｎｎ?ｄｉａｇｒａｍ?ｓｈｏｗｉｎｇ?ｔｈｅ??ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ＤＥＧｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ＳＣ＿ＴＣ?ａｎｄ?ＳＤ?
【参考文献】：
期刊论文
[1]干旱胁迫和复水处理下玉米差异表达转录因子基因分析[J]. 张鹏钰,王国瑞,曹丽茹,袁珍,库丽霞,王同朝,卫丽. 农业生物技术学报. 2020(02)
[2]水分胁迫对不同耐旱性玉米土壤水分消耗、水分利用和产量的影响[J]. 蒿宝珍,马静丽,方保停,姜丽娜,赵凌霄,翁正鹏,朱娅林. 玉米科学. 2019(06)
[3]玉米耐旱性的遗传机理及分子育种研究进展[J]. 贾钰莹,孙成韬,于佳霖,刘晓丽. 园艺与种苗. 2019(12)
[4]中国植物应答环境变化研究的过去与未来[J]. 杨淑华,巩志忠,郭岩,龚继明,郑绍建,林荣呈,杨洪全,毛龙,秦峰,罗利军,张天真,储成才,赖锦盛,晁代印,关雪莹,彭佳师,黄朝峰,蒋才富,王瑜,杨永青,施怡婷,丁杨林,马亮,种康. 中国科学:生命科学. 2019(11)
[5]干旱胁迫下水稻转录因子表达变化[J]. 朱长保,徐辰峰,刘仁梅,林中正,成立瑞. 中国农学通报. 2019(06)
[6]生物测序技术发展综述[J]. 武思文. 科技经济导刊. 2018(34)
[7]单细胞基因组和转录组的共测定方法研究进展[J]. 万睿璇,周抒遥,徐欢笛,汪浩宇,娄云阁,姜净,邹秉杰,宋沁馨,周国华. 中国现代应用药学. 2018(09)
[8]Transcriptomic responses to aluminum（Al） stress in maize[J]. XU Li-ming,LIU Chan,CUI Bao-ming,WANG Ning,ZHAO Zhuo,ZHOU Li-na,HUANG Kai-feng,DING Jian-zhou,DU Han-mei,JIANG Wei,ZHANG Su-zhi. Journal of Integrative Agriculture. 2018(09)
[9]转录组测序技术研究进展[J]. 洪奇阳,毕行建,王大宁,李子真,俞海,夏宁邵,李少伟. 中国生化药物杂志. 2017(06)
[10]不同程度干旱对春玉米生物量和产量影响的模拟[J]. 武荣盛,吴瑞芬,孙小龙,田磊,侯琼,张超,孙琳丽. 生态学杂志. 2015(09)
博士论文
[1]基于转录组测序的玉米耐旱调控网络分析[D]. 刘旭洋.中国农业科学院 2019
[2]转录组测序数据分析在玉米籽粒功能基因挖掘中的应用[D]. 何骋.中国农业大学 2017
硕士论文
[1]基于Illumina平台RNA测序数据集的转录组拼接算法设计[D]. 武思文.天津师范大学 2019
[2]基于转录组测序的玉米耐旱基因挖掘[D]. 张晓静.中国农业科学院 2017
[3]苗期玉米叶片响应非生物胁迫的转录组分析[D]. 曹维.扬州大学 2017
本文编号：3307156
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