旱黄瓜子房培养及复雌花和果瘤位置QTL定位
发布时间:2021-11-16 05:03
黄瓜(Cucumis sativus L.)是我国重要的蔬菜作物。旱黄瓜是河北省优势特色产业,但旱黄瓜育种起步较晚,育种技术滞后,制约着旱黄瓜育种效率。研究建立旱黄瓜未授粉子房培养技术体系,定位重要农艺性状QTLs,挖掘候选基因,对旱黄瓜高效育种具有重要意义。本文以旱黄瓜为试材,对旱黄瓜未授粉子房培养技术体系进行了研究,并基于BSA-seq技术对黄瓜复雌花、果瘤位置性状进行了遗传分析和QTL定位,主要结果如下:1.以4种不同基因型旱黄瓜的未授粉子房为试材,研究了基因型、子房不同发育时期及采样时间、不同浓度TDZ、不同温度对雌核诱导的影响。结果表明:不同基因型对雌核发育的影响差异显著,‘1503’的雌核发育启动率最高,为77.22%;开花前1 d的样品最优,此时‘1503’雌核发育启动率为95.56%;随TDZ(噻苯隆)质量浓度上升,雌核发育启动率呈先上升后下降趋势,其中0.08mg·L-1TDZ处理的‘1503’雌核发育启动率最高,达91.6%;35℃暗培养4 d的处理,雌核发育启动率最优,达78.33%。本研究得出的旱黄瓜未授粉子房培养最优雌核诱导技术体系为:以...
【文章来源】:河北科技师范学院河北省
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
黄瓜未授粉子房雌核的发生
第三章黄瓜复雌花性状QTL定位203.2.1DNA提取及建库测序对筛选的20个极端株系及亲本分别利用打孔器剪取4片大小一致的叶片,用锡纸包好后迅速放入液氮中保存,用于DNA提取,每株系重复三次取样。从DNA样品到最终数据获得主要经历样品检测、建库、测序这3个程序。亲本池平均测序深度为25.00-28.21X,子代池平均测序深度为42.82-44.81X。具体测序流程如下(图3-1):(1)DNA样品测定主要利用琼脂糖凝胶电泳分析、Nanodrop检测、Qubit检测。(2)文库构建及库检检验合格的DNA样品通过Covaris破碎机随机打断成长度为350bp的片段。采用TruSeqLibraryConstructionKit进行建库,DNA片段经末端修复、加ployA尾、加测序接头、纯化、PCR扩增等步骤完成整个文库制备。文库构建完成后,先使用Qubit2.0进行初步定量,用Agilent2100对文库的insertsize进行检测,insertsize符合预期后,使用Q-PCR方法对文库的有效浓度(>2nM)进行准确定量,以保证文库质量。(3)库检合格后进行IlluminaHiSeqTMPE150测序。图3-1测序流程图Figure3-1Sequencingflowchart3.2.2BSA-Seq分析
第三章黄瓜复雌花性状QTL定位25注:A):Mf混池SNP-index在染色体上的分布;B):Sf混池SNP-index在染色体上的分布;C):△SNP-index在染色体上的分布。Note:A:distributionofsnp-indexofDfpoolonchromosome;B):distributionofsnp-indexofSfpoolonchromosome;C):△snp-indexdistributiononchromosomes.图3-2黄瓜复雌花数SNP-index在染色体上的分布Figure3-2distributionofsnp-indexofmultiplepistillateflowerincucumberonchromosome
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄瓜单性结实性状遗传与QTL定位[J]. 牛志红,宋晓飞,李晓丽,郭晓雨,何书强,贺栾劲芝,冯志红,孙成振,闫立英. 中国农业科学. 2020(01)
[2]南瓜未授粉子房和胚珠离体培养影响因素[J]. 张蕾琛,孙楠,王迎儿,应泉盛,严蕾艳,黄芸萍,王毓洪,王洁. 浙江农业科学. 2019(09)
[3]辐射花粉授粉诱导黄瓜单倍体及染色体加倍[J]. 付文苑,唐兵,邓英,李芳,文林宏. 分子植物育种. 2019(21)
[4]黄瓜未授粉子房离体培养的研究进展[J]. 马燕,马艺荞,滕巍,姜奇峰,谭克,张倩. 北方园艺. 2019(09)
[5]黄瓜响应低温胁迫的生理及分子机制研究进展[J]. 李彩霞,董邵云,薄凯亮,苗晗,张圣平,顾兴芳. 中国蔬菜. 2019(05)
[6]黄瓜嫩果皮色基因QTL定位分析[J]. 窦文文,沈镝,麦尔旦·努尔阿伍提,董洪霞,邱杨,李锡香. 植物遗传资源学报. 2018(06)
[7]榛属ycf1基因生物信息学分析[J]. 卫永乐,温志芳,刘芳,张杰伟,黄武刚,兰彦平,程丽莉,曹庆昌,胡广隆. 山西农业科学. 2018(08)
[8]玉米MYB转录因子靶基因的全基因组预测及验证[J]. 张晓芳,于好强,罗羲,张于福,李晚忱,付凤玲. 干旱地区农业研究. 2018(03)
[9]植物AP2/ERF转录因子家族的研究进展[J]. 张麒,陈静,李俐,赵明珠,张美萍,王义. 生物技术通报. 2018(08)
[10]辐射花粉授粉诱导西瓜单倍体[J]. 杨红,顾妍,张朝阳,孙玉东,罗德旭. 江苏农业科学. 2017(22)
博士论文
[1]黄瓜果瘤和果实无光泽性状基因的定位与功能分析[D]. 杨绪勤.上海交通大学 2014
[2]黄瓜果刺形成相关基因的定位与克隆[D]. 关媛.上海交通大学 2008
硕士论文
[1]利用QTL定位和BSA-seq分析鉴定碱胁迫下水稻产量相关性状的候选基因[D]. 郭微.东北农业大学 2019
[2]油桐MYB转录因子家族的鉴定与功能特征研究[D]. 冉舵.中南林业科技大学 2019
[3]拟南芥MYB6调控茎顶端生长点大小的机制研究[D]. 刘祥政.山东大学 2019
[4]调控细胞壁阿魏酸合成代谢的二穗短柄草(Brachypodium distachyon)乙醛脱氢酶基因克隆及功能初步鉴定[D]. 齐旭莉.湖南农业大学 2017
[5]南瓜未受精胚珠离体培养影响因子研究[D]. 李禹琪.西北农林科技大学 2017
[6]黄瓜果肉厚度QTL的精细定位及候选基因功能验证[D]. 陆璐.扬州大学 2016
[7]黄瓜商品瓜果实生长速率QTL定位[D]. 崔金莹.中国农业科学院 2016
[8]利用BSA-seq定位主基因的方法研究[D]. 陈学群.福建农林大学 2016
[9]拟南芥跨膜转运蛋白相关基因T-DNA插入突变体的筛选及表型鉴定[D]. 常秋霜.南京大学 2015
[10]南瓜未受精子房离体诱导植株方法研究[D]. 何娅.西北农林科技大学 2015
本文编号:3498198
【文章来源】:河北科技师范学院河北省
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
黄瓜未授粉子房雌核的发生
第三章黄瓜复雌花性状QTL定位203.2.1DNA提取及建库测序对筛选的20个极端株系及亲本分别利用打孔器剪取4片大小一致的叶片,用锡纸包好后迅速放入液氮中保存,用于DNA提取,每株系重复三次取样。从DNA样品到最终数据获得主要经历样品检测、建库、测序这3个程序。亲本池平均测序深度为25.00-28.21X,子代池平均测序深度为42.82-44.81X。具体测序流程如下(图3-1):(1)DNA样品测定主要利用琼脂糖凝胶电泳分析、Nanodrop检测、Qubit检测。(2)文库构建及库检检验合格的DNA样品通过Covaris破碎机随机打断成长度为350bp的片段。采用TruSeqLibraryConstructionKit进行建库,DNA片段经末端修复、加ployA尾、加测序接头、纯化、PCR扩增等步骤完成整个文库制备。文库构建完成后,先使用Qubit2.0进行初步定量,用Agilent2100对文库的insertsize进行检测,insertsize符合预期后,使用Q-PCR方法对文库的有效浓度(>2nM)进行准确定量,以保证文库质量。(3)库检合格后进行IlluminaHiSeqTMPE150测序。图3-1测序流程图Figure3-1Sequencingflowchart3.2.2BSA-Seq分析
第三章黄瓜复雌花性状QTL定位25注:A):Mf混池SNP-index在染色体上的分布;B):Sf混池SNP-index在染色体上的分布;C):△SNP-index在染色体上的分布。Note:A:distributionofsnp-indexofDfpoolonchromosome;B):distributionofsnp-indexofSfpoolonchromosome;C):△snp-indexdistributiononchromosomes.图3-2黄瓜复雌花数SNP-index在染色体上的分布Figure3-2distributionofsnp-indexofmultiplepistillateflowerincucumberonchromosome
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄瓜单性结实性状遗传与QTL定位[J]. 牛志红,宋晓飞,李晓丽,郭晓雨,何书强,贺栾劲芝,冯志红,孙成振,闫立英. 中国农业科学. 2020(01)
[2]南瓜未授粉子房和胚珠离体培养影响因素[J]. 张蕾琛,孙楠,王迎儿,应泉盛,严蕾艳,黄芸萍,王毓洪,王洁. 浙江农业科学. 2019(09)
[3]辐射花粉授粉诱导黄瓜单倍体及染色体加倍[J]. 付文苑,唐兵,邓英,李芳,文林宏. 分子植物育种. 2019(21)
[4]黄瓜未授粉子房离体培养的研究进展[J]. 马燕,马艺荞,滕巍,姜奇峰,谭克,张倩. 北方园艺. 2019(09)
[5]黄瓜响应低温胁迫的生理及分子机制研究进展[J]. 李彩霞,董邵云,薄凯亮,苗晗,张圣平,顾兴芳. 中国蔬菜. 2019(05)
[6]黄瓜嫩果皮色基因QTL定位分析[J]. 窦文文,沈镝,麦尔旦·努尔阿伍提,董洪霞,邱杨,李锡香. 植物遗传资源学报. 2018(06)
[7]榛属ycf1基因生物信息学分析[J]. 卫永乐,温志芳,刘芳,张杰伟,黄武刚,兰彦平,程丽莉,曹庆昌,胡广隆. 山西农业科学. 2018(08)
[8]玉米MYB转录因子靶基因的全基因组预测及验证[J]. 张晓芳,于好强,罗羲,张于福,李晚忱,付凤玲. 干旱地区农业研究. 2018(03)
[9]植物AP2/ERF转录因子家族的研究进展[J]. 张麒,陈静,李俐,赵明珠,张美萍,王义. 生物技术通报. 2018(08)
[10]辐射花粉授粉诱导西瓜单倍体[J]. 杨红,顾妍,张朝阳,孙玉东,罗德旭. 江苏农业科学. 2017(22)
博士论文
[1]黄瓜果瘤和果实无光泽性状基因的定位与功能分析[D]. 杨绪勤.上海交通大学 2014
[2]黄瓜果刺形成相关基因的定位与克隆[D]. 关媛.上海交通大学 2008
硕士论文
[1]利用QTL定位和BSA-seq分析鉴定碱胁迫下水稻产量相关性状的候选基因[D]. 郭微.东北农业大学 2019
[2]油桐MYB转录因子家族的鉴定与功能特征研究[D]. 冉舵.中南林业科技大学 2019
[3]拟南芥MYB6调控茎顶端生长点大小的机制研究[D]. 刘祥政.山东大学 2019
[4]调控细胞壁阿魏酸合成代谢的二穗短柄草(Brachypodium distachyon)乙醛脱氢酶基因克隆及功能初步鉴定[D]. 齐旭莉.湖南农业大学 2017
[5]南瓜未受精胚珠离体培养影响因子研究[D]. 李禹琪.西北农林科技大学 2017
[6]黄瓜果肉厚度QTL的精细定位及候选基因功能验证[D]. 陆璐.扬州大学 2016
[7]黄瓜商品瓜果实生长速率QTL定位[D]. 崔金莹.中国农业科学院 2016
[8]利用BSA-seq定位主基因的方法研究[D]. 陈学群.福建农林大学 2016
[9]拟南芥跨膜转运蛋白相关基因T-DNA插入突变体的筛选及表型鉴定[D]. 常秋霜.南京大学 2015
[10]南瓜未受精子房离体诱导植株方法研究[D]. 何娅.西北农林科技大学 2015
本文编号:3498198
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