干旱胁迫下马铃薯根系Aux/IAA转录因子的挖掘

发布时间：2021-11-20 19:19

　　受地球气候变化的影响,全球农业用地逐渐减少,且干旱土地面积日益增加,干旱已成为限制作物生长及产量提高的最严峻的非生物胁迫因子。马铃薯（Solanum tuberosum L.）作为我国的主要粮食作物,在解决未来粮食缺乏问题和提高食品安全方面具有非常大的潜力,但因其根系结构狭窄,具有较低的深入土壤的能力,被认为是干旱敏感作物。Aux/IAA转录因子可调控植物根系的向地性生长从而吸取更多水份提高耐旱性,但其调控马铃薯根系发育的研究未见报道。本研究以干旱胁迫下抗旱能力差异明显的“大西洋”和“青薯9号”两个马铃薯品种块茎膨大期的基础根尖、初生匍匐茎茎端和块茎为材料,采用Illumina高通量测序技术,构建6个转录组数据库并对其结果进行分析,筛选干旱胁迫下马铃薯根系不同组分间差异表达的Aux/IAA转录因子,并利用qRT-PCR技术解析不同马铃薯品种在正常灌水和干旱处理下的不同生长发育阶段的基础根尖、初生匍匐茎端和块茎中Aux/IAA转录因子表达模式,挖掘关键基因。已取得以下结果:1.通过RNA-Seq技术分析,在转录水平上共获得了59234个差异基因。以“青薯9号”为参照,在“大西洋”的基础根... 

【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

不同样品基因表达的相关性Figure2.Correlationofgeneexpressionindifferentsamples2.2.2基因表达量分析

干旱胁迫下马铃薯根系Aux/IAA转录因子的挖掘15图3.各样品FPKM箱线图Figure3.FPKMboxdiagramofeachsample注：图中横坐标代表不同的样品；纵坐标表示样品表达量FPKM的对数值。表3.差异表达基因数目统计表Table3.Statisticsofthenumberofdifferentiallyexpressedgenes差异基因组DEG_Set所有差异基因数All_DEG上调表达基因up-regulated下调表达基因down-regulatedAtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtPS2_AtPS3_AtPS122545021752AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtT1_AtT2_AtT31275643598397AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_QsBR1_QsBR2_QsBR3462020452575AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_AtT1_AtT2_AtT31011442595855AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS321861311875AtT1_AtT2_AtT3_vs_QsT1_QsT2_QsT3475931751584QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS323318201511QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsT1_QsT2_QsT3353212942238QsPS1_QsPS2_QsPS3_vs_QsT1_QsT2_QsT3315013571793

甘肃农业大学2020届硕士学位论文16ABCDEF图4.不同马铃薯品种根系不同组织的差异基因Figure4.Differentgenesindifferenttissuesofdifferentpotatoroots注：（A，C，E）分别为大西洋和青薯9号两个品种之间通过干旱处理鉴定的上调差异表达基因；（B，D，F）分别为大西洋和青薯9号两个品种之间通过干旱处理鉴定的下调差异表达基因。G0:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtPS2_AtPS3_AtPS1;G1:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtT1_AtT2_AtT3;G2:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_QsBR1_QsBR2_QsBR3;G3:AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_AtT1_AtT2_AtT3;G4:AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS3;G5:AtT1_AtT2_AtT3_vs_QsT1_QsT2_QsT3;G6:QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS3;G7:QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsT1_QsT2_QsT3;G8:QsPS1_QsPS2_QsPS3_vs_QsT1_QsT2_QsT3.

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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本文编号：3507959