道路廊道和森林景观格局对紫茎泽兰种群及其遗传结构的影响

发布时间：2020-11-03 02:24

　　 紫茎泽兰(Ageratina adenophora)是危害严重的恶性杂草,自从上世纪由滇缅边境传入云南省,现己入侵多个省份,东至重庆,西至石棉,北至泸定,西南地区入侵较为严重。研究表明,紫茎泽兰易沿道路和河流进行快速传播和扩散。本文选取昆明海口林场的紫茎泽兰为研究对象,通过野外调查,并结合SSR、AFLP、RAD-seq测序3种分子标记技术,探究不同路域景观紫茎泽兰种群的遗传多样性和群基因组结构特征,解析道路密度、景观指数、景观阻力与紫茎泽兰种群遗传多样性的关系,并分析不同森林景观格局对紫茎泽兰分布、扩散、基因流的影响,为紫茎泽兰的控制和防除提供科学依据和参考。主要结果如下:1.紫茎泽兰入侵受森林群落乔木层的影响较为显著,乔木层的盖度、物种丰富度越大,紫茎泽兰入侵的程度越轻;森林类型对紫茎泽兰的分布无显著影响。距道路的距离是影响天然林下紫茎泽兰分布最重要的因子,但对人工林无显著影响;2.采用8对SSR多态性引物和4对AFLP引物对25个种群600个个体进行PCR扩增,结果全为单态性。挑选不同森林景观类型下的l10个紫茎泽兰种群共50个个体进行RAD-seq测序,SNPs多态性百分比(PPB)=63.854%-68.585%,期望杂合度(He)=0.25672-0.26227,主要等位基因的平均频率(P)=0.782-0.785,观察杂合度(Ho)=0.565-0.571,核苷酸多样性(Pi)=0.2908-0.3034,种群间遗传分化最大的是槲栎林和沿路种群(POP24),种群间遗传分化最小的是沿路种群(POP3)和干香柏林(POP5)。3.采用ADMIXTURE软件,对10个种群的SNPs多态进行模型聚类,10个种群分为2个景观类型,一类为常绿阔叶林和落叶栎林原生性较强的森林类型种群,另一类为针叶林、人工林、沿路种群干扰性较强的类型。4.不同道路密度等级下,紫茎泽兰种群的多态位点百分比、核苷酸多样性、主要等位基因的平均频率、期望杂合度均无显著性差异,紫茎泽兰种群的观察杂合度有显著性差异。景观格局指数与种群遗传多样性指数无显著性相关。不同景观阻力对紫茎泽兰种群的多态位点百分比、主要等位基因的平均频率、核苷酸多样性、期望杂合度、观察杂合度均无显著影响。局域尺度上,景观格局对紫茎泽兰的种群遗传多样性无显著影响。
【学位单位】：云南大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2019
【中图分类】：S451
【部分图文】：

采样示滋圈

八碱基酶在基因组中出现的频最低，其是六碱基酶，出现频率最??高的为四碱基酶。选择限制性内切酶需要对目标物种的参考基因组进行全面分析，根据??基因组的ＧＣ含量、重复序列等信息选择合适的酶（王洋坤，２０１３）。??对基因组ＤＮＡ样品进行限制性酶切这一步是整个实验最为重要的一步，酶切效果??对ＲＡＤ简化基因组测序的好坏起到关键性作用，并决定了后续实验的进行，因此，在??进行实验时，实验操作一定要规范，在加酶切体系时，酶不能放在外面，要一直将酶放??在冰盒里，防止酶失活，并且最后将酶加入酶切体系。??２．３．２测序文库的构建??首先，酶切检验合格的ＤＮＡ样品，把Ｐ１接头加在酶切后的基因组片段两端；然后，??将加好Ｐ１接头的序列用Ｃｏｖａｒｉｓ破碎机随机打断。通过琼脂糖凝胶电泳检测，选择符合??大小的目的条带，一般选择目标条带在３００？７００?ｂｐ。再在ＤＮＡ片段连接上Ｐ２接头。??对这样的混合ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增。然后使用Ｑ－ＰＣＲ方法对有效浓度进行精准定量，??以保证文库质量。??

图２－３研究区域及样地位置示意图??Ｆｉｇ．?２－３?Ｔｈｅ?ｓｔｕｄｙ?ａｒｅａ?ａｎｄ?ｓａｍｐｌｅ?ｓｋｅｔｃｈ?ｍａｐ??２２??
【参考文献】

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本文编号：2867957