云南省HIV-1跨境传播特性及亚型演化规律研究
本文关键词: HIV-1 跨境传播 基因亚型 同源关系 起源与进化 出处:《昆明理工大学》2016年博士论文 论文类型:学位论文
【摘要】:人类免疫缺陷病毒(HIV)是导致艾滋病即获得性免疫缺陷综合征(AIDS)的病原体,呈现全球流行态势。我国虽然感染率较低,但感染人数众多。云南省是我国HIV流行和危害最为严重的地区,同时也是HIV亚型分布最为复杂的地区。本地区多种基因亚型同时流行,亚型间重组的频繁发生并广泛传播。我国主要流行的B/C重组亚型(CRF07_BC、CRF08_BC)都认为在云南地区起源并传播至全国各地区。云南省特殊的地理位置,使得云南成为HIV从东南亚地区通过边境口岸传入我国,进而向其他省份传播的主要渠道。然而,在HIV的传入和传播过程中,出入境人群起着十分关键的“桥梁作用”。众多边境口岸和大量的往来人群极大促进了边境贸易与国际交流,也加大了对本地区传染性疾病防御与监控的难度。随着国家“一代一路”和我省“面向西南开放桥头堡”发展战略的实施,云南与东南亚国家之间的贸易与人员往来更为频繁,边境口岸疾病传入形式日趋严峻,亟待加强预防监控研究。本研究对2003-2012年间云南省边境出入境人群280,961例进行HIV筛查,确定感染人数2,487例,感染率为0.85%,出入境人群中HIV的感染率整体呈现降低的趋势;各地州间感染率分布呈现显著性差异,德宏州感染率在所有地州中最高,为5.12%(1163/22699),是文山州的72倍(0.07%,12/17,064),其余依次保山(0.88%)、临沧(0.83%)、红河(0.71%)、普洱(0.41%)、西双版纳(0.21%)。对其中809例阳性样本进行gag-pol基因序列的亚型分析表明:CRF01_AE和CRF08_BC为主要流行基因亚型,分别占46.23%和17.80%,其次依次为C基因亚型(8.41%)、CRF07_BC重组亚型(2.47%)、其他BC重组亚型以及未知重组亚型。各基因亚型年份统计分析显示CRF01_AE流行较为稳定而且一直维持高感染率的特征;CRF08_BC为仅次于CRFO1_AE亚型的重组亚型,其所占比例十年间维持在15%左右,近年来有所下降;作为中国及云南地区以往主要流行毒株B和C亚型,在近十年来的改人群中一直维持较低的感染率,并有逐年降低的趋势。进而,对主要流行基因亚型和重要出口岸的流行基因亚型与病毒簇进行同源关系和起源、进化特性分析,结果发现:四个主要口岸的流行毒株同源关系分析都表明本研究人群中HIV-1毒株显示与本地及周边地区流行株紧密的亲缘关系;该人群中HIV-1的各亚型毒株都广泛存在于不同地域分离簇中,显示出极为多元化的来源性。上述特征暗示着本人群中毒株并不存在单一来源以及某固定地域流行的特征,而是与云南本地流行株及周边地区流行株共同流行与进化。这也体现了该人群在HIV-1的跨境传播中的“桥梁”作用,在HIV-1的跨境传播中扮演着重要角色。本研究中所研究人群具有典型的地域代表性、样本采集时间跨度大,能够较为系统的反映HIV-1的跨境传播特性和主要亚型、重组型的演化规律。研究结果揭示了云南省出入境人群中的高感染和多基因亚型同时流行的分子流行病学特征,同时也证明了其在HIV跨境过程中所起到不可忽视的作用,为口岸地区特别是跨境人群中的HIV预防与传播扩散的监控提供直接详实的科学依据大。
[Abstract]:......
【学位授予单位】:昆明理工大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:R512.91
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,本文编号:1514141
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