云南省2017年新分离鼠疫菌表型与基因型研究

发布时间：2020-05-30 22:21

【摘要】：[目的]了解云南省新发鼠疫疫情所分离鼠疫菌的表型及基因型特征、并对其进行溯源分析,藉此查明新发鼠疫疫情的性质及来源,为制定针对该疫源地科学地防控策略提供科学依据。[方法]1.表型测定:进行阿拉伯糖、密二糖、鼠李糖、麦芽糖及甘油的发酵实验,脱氮实验,VW毒力因子检测,色素沉着因子检测及营养需求来测定鹤庆鼠疫菌的表型特征。2.基因型测定:通过差异区段(Different region,DFR)分型、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPRs)分型与可变数目串联重复序列(MLVA)分型(12+14策略)方法来判定新分离鼠疫菌的基因型别,同时以云南既往代表菌株信息为参照,利用BN6.6软件进行溯源分析。[结果]1.丽江菌株、剑川菌株与鹤庆菌株生化特性,均发酵阿拉伯糖、麦芽糖、甘油且脱氮阳性,生物型属于古典变种型;其他表型均为VW~+菌株、色素沉着因子阳性,营养需求类型为苯丙氨酸依赖、谷氨酸不依赖型。2.2017年云南省新分离15株鼠疫菌DFR型别一致均为DFR 01、02、13、23四个位点上缺失,其余位点不缺失,与丽江菌株有相同的DFR型别,为Genomovar05型。3.2017年云南省新分离15株鼠疫菌CRISPR分型中,YPa排序为“a1-a2-a3-a4-a5-a6-a7”,YPb为“b1-b2-b3-b4”,YPc为“c1-c2-c3”,与丽江菌株有着相同的型别为基因簇Ca7。4.鹤庆菌株位于丽江野鼠鼠疫簇内,为同一种MLVA基因型,与HQ1只在位点M22有差异,与位于整个丽江野鼠鼠疫簇的核心位置的丽江菌株2006-7号同源。[结论]鹤庆菌株、玉龙菌株与剑川菌株属于同一种生物型,均为古典变种型鼠疫耶尔森菌,毒力因子与营养需求等表型均一致。2017年云南省新分离15株鼠疫菌鼠疫菌株在CRISPRs分型与DFR分型上与丽江野鼠疫源地菌株一致,而MLVA(14+12)溯源分析表明,鹤庆菌株来源于丽江菌株的进一步分化,是丽江疫源地进一步向南扩散的结果,鉴于此种类型鼠疫菌的高致病性,应加强对该疫源地持续监测,并做好鼠间疫情的处置,降低其传播到人的风险。
【图文】：

疫情,地理图,云南省,鼠疫菌

县鹿子村、古城区木梳村和鹤庆县大马厂村监测到鼠疫疫情，其中，剑川县大庆村与原疫区（石龙）相距较远，而与鹤庆县的大马厂村相隔无几，鹤庆县自新中国成立后首次分离到鼠疫菌，并且均分离自活鼠，此次疫情的大马厂与大庆村与玉龙县鹿子村同处于同一山脉，此次疫情是丽江野鼠鼠疫疫源地的南迁还是剑川石龙野鼠鼠疫疫源地的北移，还有待研究。本次疫情从鹤庆县鼠及其寄生蚤中分离到 10 株鼠疫菌，剑川县大庆村鼠及其寄生蚤中分离到 3 株鼠疫菌，玉龙县分离到 1 株鼠疫菌，丽江古城区分离到 1 株鼠疫菌，新分离的鼠疫菌是什么生物型？毒力因子等表型如何，为何在活鼠中分离得到？其疫源地是家鼠型还是野鼠型？与剑川野鼠鼠疫疫源地性质相同还是与丽江玉龙野鼠鼠疫疫源地性质相同？为此，本研究针对这些新分离菌株进行表型与基因型研究，，以确定其疫源地性质及其致病性强弱，为以后更好的预防控制鼠疫疫情提供科学依据。

电泳图,位点,鼠疫菌,云南省

云南省2017年新分离鼠疫菌DFR电泳结果
【学位授予单位】：大理大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R516.8

【参考文献】