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我国丁型肝炎病毒感染情况调查和病毒分子特性研究

发布时间:2020-09-11 08:40
   研究背景丁型肝炎病毒(Hepatitis Delta Virus,HDV)是乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)的卫星病毒,必须在HBV或其他嗜肝DNA病毒的辅助下才能包装成完整的病毒颗粒。HDV的感染能够引起非常严重的肝脏损伤,加速肝脏的疾病进展,提高肝硬化、肝脏失代偿、肝癌甚至死亡的风险。乙肝疫苗的实施能够有效降低HBV的感染率,减少HBV感染者,从而降低HDV的感染流行,但近几年国际研究显示,HDV的感染率呈现上升趋势,并且在人类免疫缺陷病毒(Human Immunodeficiency Virus,HIV)阳性的HBV感染人群中显著高于单独乙肝表面抗原(Hepatitis B Surface Antigen,HBsAg)阳性的人群。目前,我国HBV处于中度流行,有超过9000万人为HBV慢性感染者,并且部分地区HIV疫情严重,截止2017年11月30日,已报告我国存活的HIV感染者和获得性免疫缺乏综合症(Acquired Immune Deficiency Syndrome,AIDS)患者约 75 万人,调查显示有 6.3%-10.9%的HIV感染者合并HBV感染,HDV感染会加重肝脏损伤。因此,有必要对该部分人群进行HDV的感染情况调查,及时制定合理有效的预防措施控制HDV.的流行。本研究将对我国慢性HBV感染和HIV/HBV合并感染者进行HDV感染情况调查,评估感染相关风险因素,分析HDV、HBV和HIV-1主要流行基因型及其之间可能存在的关系,为我国HDV流行的预防和控制提供数据支持。研究方法基于Taqman探针和实时定量PCR的技术,建立双靶向HDV核酸检测的方法。采用世界卫生组织(World Health Organization,WHO)HDV国际标准品对该方法进行评价。从全国七个省市自治区(北京、内蒙古自治区、新疆维吾尔自治区、广西壮族自治区、云南省、四川省和广东省)的部分医院采集慢性乙肝肝炎患者样本3000人份,其中HIV/HBV合并感染者样本759人份,对感染者的临床信息和人口学信息进行收集。采用HDV抗体和核酸的检测方法,对收集的样本进行HDV筛查,调查我国不同地区和人群中HDV的感染情况。通过卡方检验和Logistic回归分析HDV感染的相关因素,及其对肝脏疾病进展的影响。对HDV核酸检测呈阳性的血清/血浆样品进行HDV全基因组序列的扩增和测序,获得HDV全基因组序列;对采集的样本HBV S区基因片段和HIV pol基因片段进行扩增和测序,分析三种病毒的感染模式以及分子病毒学特征。研究结果一、HDV核酸检测方法的建立本研究建立了双靶向HDV核酸检测的方法,经WHO HDV国际标准品评测,最低检出线为575 IU/ml。本研究建立的HDV核酸检测方法能够用于中国地区HDV流行毒株的检测,与HDV抗体检测方法相结合,可用于中国临床中HDV的筛查和HDV感染者中HDV病毒活动性监测。二、我国七个省市自治区HDV的感染情况调查本研究中七个省市自治区均存在HDV的感染,总体的感染率为2.63%(79/3000)。多因素Logistic回归分析发现,与HDV感染相关的因素为HIV的合并感染和研究地区,HDV的感染率在HIV/HBV合并感染人群中显著高于HIV阴性人群(aOR=9.61,95%CI:5.06-18.27),相对于北京市研究现场,四川省研究现场的HDV的感染率显著增加(aOR=11.10,95%CI:3.73-33.08)。本研究中,我国不同地区慢性乙型肝炎患者中HDV感染率存在很大的差异,四川研究现场HDV的感染率最高,为13.88%,并且显著高于其他六个研究现场:其次是广西壮族自治区研究现场,HDV的感染率为5.32%,广东省研究现场HDV感染率为2.45%,新疆维吾尔自治区、内蒙古自治区、北京市和云南省四个研究现场HDV感染率较低分别为0.88%,0.50%,0.48%和 0.45%。本研究发现HDV感染者与非HDV感染者之间,肝脏疾病临床指标具有显著差异,在HDV感染人群中,天门冬氨酸氨基转移酶(Aspartate aminotransferase,AST)、丙氨酸氨基转移酶(Alanine aminotransferase,ALT)和总胆红素水平升高的人群比例以及乙型肝炎病毒e抗体(Hepatitis Be antibody,HBeAb)阳性的人群比例显著高于非HDV感染人群。说明HDV的感染对肝脏细胞造成了损伤,同时对乙肝病毒的复制产生了负性影响。经Logistic回归模型分析,发现四川省研究现场HDV感染的相关因素除HIV的感染外,还包括性别因素,HDV感染率在男性人群中高于女性。在广西壮族自治区研究现场,与非静脉吸毒者相比,HDV感染率在静脉吸毒者中显著增加(aOR=31.83,95%CI:4.71-215.09)。在HIV/HBV合并感染者人群中,相对于新疆研究现场,四川研究现场的HDV感染率显著增加(aOR=20.67,95%CI:2.56-166.70),且四川研究现场HDV感染率显著高于其他研究现场;在非HIV感染的慢性乙型肝炎患者中,相对于新疆研究现场,广西研究现场的HDV感染率显著增加(aOR=16.74,95%CI:2.50-112.01)。但与广东省和四川省研究现场差异不显著。三、我国七个省市自治区慢性乙型肝炎患者中,HDV、HBV和HIV-1分子病毒学特征本研究共获得HDV全基因组序列20条,经系统进化树分析,发现中国HDV流行毒株的基因型包括HDV-1型和HDV-2a型,其中,在HDV感染率最高的四川地区,HDV的主要流行基因型为HDV-2a型。本研究共获得HIV-1 pol基因序列236条,HIV-1的主要流行亚型为CRF07_BC,CRF01_AE 和 B',其次是 CRF08_BC,CRF67_01B,CRF57_BC,CRF65_cpx,CRF68-01B。另外,在北京和四川研究现场出现了新的重组型。北京研究现场HIV-1的主要流行亚型为CRFO1_AE(51.61%),CRF07_BC(31.18%)和 B'(10.75%);四川研究现场 HIV-1 的主要流行亚型为CRF07_BC(92.5%)和CRF01_AE(3.75%);广东省研究现场HIV-1的主要流行亚型为 CRF07_BC(46%),CRF01_AE(22%)和 CRF55_01B(16%)。本研究共获得790条HBVS区序列,构建系统进化树分析,HBV的基因型为HBV-C型(52.03%),HBV-B 型(28.86%),HBV-D 型(18.10%),和 HBV-I 型(0.25%)以及6例新的重组基因型。在各研究现场之间HBV基因型分布存在显著性差异。北京、云南省和内蒙古自治区研究现场的HBV基因型以C型为主,广东省和广西壮族自治区研究现场以HBV-B型为主,新疆维吾尔自治区研究现场以HBV-D型为主(约占84.11%),四川省研究现场HBV-B型和HBV-C型均为主要的流行基因型,另外还存在两例HBV-Ⅰ型。本研究中HDV感染者的HBV基因型以HBV-B型和HBV-C型为主,HDV/HBV/HIV合并感染者中,HIV的基因型为CRF07_BC,但HBV基因型和HIV基因型在HDV感染者中的分布与HDV阴性人群没有明显差异,均属于当地主要的流行基因型。结论本研究建立了 HDV核酸的检测方法,经WHO国际标准品评价后,最低检测线为575 IU/ml。近几年,首次对全国七个地区进行较大规模的慢性乙型肝炎患者以及HIV/HBV合并感染者中HDV感染情况调查,发现HDV在我国整体为低流行趋势,但是四川省研究现场的HIV感染者和广西壮族自治区的静脉吸毒者为HDV感染的高危人群。本研究也发现HDV的感染可能会对肝脏细胞产生损伤,加重疾病的进展。因此,有必要对我国慢性HBV感染者中的疑似HDV感染进行HDV的筛查,及时指导临床用药。对于我国四川研究现场(凉山彝族自治州)和广西壮族自治区研究现场需要提高HBV疫苗的覆盖率,特别是HIV阳性的人群和静脉吸毒人群,降低HBV的感染率,提高HDV的预防和控制。本研究为中国大陆地区对HDV流行的预防和控制提供了一定的数据支持。
【学位单位】:中国疾病预防控制中心
【学位级别】:博士
【学位年份】:2018
【中图分类】:R512.62
【部分图文】:

乙肝疫苗,乙肝,省市,酶联免疫吸附


Figure邋I邋Worldwide邋prevalence邋of邋HDV邋4逡逑5中国丁型肝炎病毒的流行逡逑HDV的流行需要在HBV流行的基础上建立,乙肝疫苗的推广实施,能够有效抑HBV和HDV的感染,中国于丨992年实施乙肝疫苗计划,2002年纳入计划免疫接种项目2005年中国实施针对新生儿完全免费乙肝疫苗接种的措施16,很大程度上降低了乙肝在国的感染率55,可能由于乙肝疫苗对乙肝感染情况的控制,使得我国科学家对于HDV研究多集中于2005年之前,在此之后对于HDV的感染率调查多集中于台湾地区,大陆区研究较少。逡逑丨992年,对全国30个省市自治区的5410份HBsAg阳性样本,采用酶联免疫吸附行HDV抗体的检测,发现HDV抗体整体的检出率为1.15%,在安徽和西藏HDV的出率最高分别为5.45%和5.38%。然而,在北京、天津、山东、湖北、云南等14个地区出HDV,整体处于HDV低流行趋势56。1998年,对全国25个省市16个民族乙肝感

进化树,参数设定,软件,分类变量


.4统计学方法逡逑采用SPSS邋17.0软件进行统计分折。分类变量分折采用Pearson’s卡方检验或Fisher,连续变量分析采用t检验,Logistic回归来分析相关因素。逡逑

标准品,检测线,线性关系,片段


采用本研究建立的双靶向荧光定量PCR方法进行检测。结果如图3-1,对于HD段可检测的范围为575,000邋1U/m丨至575邋IU/ml,以Ct值为纵坐标,以HDVRNA浓度的对数为横坐标,建立线性关系,线性相关系数为0.9923邋(>邋0.97即有效),斜宇.是-3.]5低的检测线为575丨U/mU然而,对于HDVRNA标准品中的Yama片段,该方法可检有效范围为575,00(HU/m丨至5,750丨U/ml,仅出现三个有效的Ct值,建立线性关系,相关系数为0."17邋(>0.97即有效),斜率是-5.70。因此,针对HDVRNA标准品中ama片段,最低的检测线为5,750邋IU/ml。逡逑?逦Oita邋Rn邋v?邋Cycle逡逑

【参考文献】

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本文编号:2816457

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