诺如病毒新重组株GII.P16/GII.2引起福建省2016年冬季病毒性胃肠炎暴发

发布时间：2020-12-11 02:26

　　目的本文旨在鉴定福建省2016年冬季导致病毒性胃肠炎暴发的病原体,并对病原体进行分子特征研究。方法对疫情暴发地上送的福建省2016年胃肠炎暴发急性病例标本,采用荧光PCR初步判定病原体,常规RT-PCR检测诺如病毒RNA聚合酶和衣壳蛋白基因片段,并进行序列测定和分子特征分析。结果在3起暴发疫情中18份标本经荧光PCR检测均为诺如病毒核酸阳性,其中15份标本RT-PCR检测判为GII型诺如病毒,9份标本成功测序。分析测序结果,证实引起本轮疫情为诺如病毒新重组株,该重组株有别于本地散发流行及全球暴发流行的优势基因型GII.4。毒株RNA聚合酶核苷酸序列与2016年日本的GII.4悉尼变异株Kawasaki194毒株的同源性最高,达98%,为GII.P16亚型;衣壳蛋白核苷酸序列与2008年比利时的IPH2161-08VG06毒株同源性最高（97.7%⁹8.8%）,为GII.2亚型。结论这是福建省首次报道诺如病毒重组株GII.P16/GII.2的检出,并引起病毒性胃肠炎暴发。 

【文章来源】：中国人兽共患病学报. 2017年09期 第805-808+813页 北大核心

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【部分图文】：

图１诺如病毒衣壳蛋白核苷酸片段进化分析（２５０ｂｐ）Ｆｉｇ．１ＰｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃａｎａｌｙｓｅｓｂａｓｅｄｏｎｐａｒｔｉａｌＶＰ１ｇｅｎｅｓｏｆｎｏｒｏｖｉｒｕｓ（２５０ｂｐ）●Ｏｕｔｂｒｅａｋｓｔｒａｉｎｓｏｆｎｏｒｏｖｉｒｕｓｉｎ２０１６；▼Ｓｐｏｒａｄｉｃｓｔｒａｉｎｓｏｆｎｏｒｏｖｉｒｕｓｉｎ２０１６

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本文编号：2909734