2018-2019年宁夏甲型H1N1流感病毒血凝素基因组序列分析
发布时间：2021-03-04 15:59
目的了解宁夏2018-2019流感监测年度流感病毒病原学检测情况,分析甲型H1N1流感病毒血凝素（HA）基因特征。方法采用real time RT-PCR方法对流感监测哨点医院采集的流感样病例（ILI）标本进行核酸检测;对阳性标本进行毒株分离;提取甲型H1N1毒株的RNA,采用RT-PCR方法扩增HA片段并测序,利用生物信息软件对测序结果进行比对分析。结果宁夏流感网络实验室检测咽拭子标本共5 214份,核酸检测阳性数为760份,其中甲型H1N1阳性数为485份,占总阳性数的63.82%,分离出甲型H1N1毒株161株。宁夏分离毒株与疫苗株A/Califaoria/07/2009不在同一进化分支,同源性为92.6%～96.3%;与疫苗株A/Michigan/45/2015（H1N1）为同一进化分支,同源性为96.6%～98.1%。与疫苗株A/Califaoria/07/2009比较,抗原位点、受体结合位点及其他位点均有变异,除毒株A/NingxiaXixia/SWL1176/2019（H1N1）第222位氨基酸发生D222G变异外,其他甲型H1N1流感毒株均未发生D...
【文章来源】：现代预防医学. 2020,47(09)北大核心
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
宁夏2018-2019年甲型H1N1流感病毒病原学检测结果
对161株甲型H1N1毒株侧序结果与参考毒株及2017年宁夏分离株进行比对分析。根据分析结果,结合采集地区、采集时间及标本信息选取50株血凝素序列结果应用Mega6.0软件绘制基因种系发生树分析亲缘关系,进化树见图2(图中的进化树只包含部分毒株,剔除了部分位于进化树上相同终末分支的序列)。结果显示,整个进化树分为两个进化分支,疫苗株A/Califaoria/07/2009与国内代表株A/Sichuan/1/2009(H1N1)为同一进化分支,宁夏分离毒株与疫苗株A/Michigan/45/2015(H1N1)及2017年分离毒株高度同源为同一进化分支。宁夏分离毒株与参考毒株比较,发生了一定程度的变异,与国际疫苗株A/Califaoria/07/2009氨基酸的同源性为92.6%～96.3%、与国内代表A/Sichuan/1/2009(H1N1)氨基酸的同源性为91.3%～95.8%、与国际疫苗株A/Michigan/45/2015(H1N1)氨基酸的同源性相对较高为96.6%～98.1%。2.3 HA分子特征分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]河北省2011-2017年甲型H1N1流感流行及其基因特征分析[J]. 韩光跃,李岩,刘艳芳,刘兰芬,姜彩肖,齐顺祥. 中国病毒病杂志. 2017(04)
[2]湖北省大流行期和流行后期新甲型H1N1流感病毒基因特性分析[J]. 方斌,刘琳琳,李翔,叶国军,余晓,宋毅. 中华疾病控制杂志. 2017(01)
[3]2009-2015年中国甲型H1N1流感病毒血凝素基因进化分析[J]. 颜文娟,郭艳,李小杉,李伟,宣杨,宋玥,方坤,卫平民. 微生物学通报. 2017(02)
[4]2013-2014年宁夏甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因变异状况及序列分析[J]. 孙晓强,温秋芳,陈晓梅,袁芳,马学旻,马江涛,詹军. 宁夏医学杂志. 2016(01)
[5]2012年甲型H1N1流感病毒HA基因特征及抗原性分析[J]. 张晓春,黄韦唯,陈振华,陈恒. 现代预防医学. 2014(05)
[6]福建省甲型H1N1流感病毒分离及首例分离株全基因组序列分析[J]. 谢剑锋,沈晓娜,王美爱,张拥军,吴冰珊,陈炜,王金章,修文琼,朱莉莉,杨式芹,陈端,翁育伟,郑奎城,严延生. 中国人兽共患病学报. 2009(08)
[7]中国内地首例确诊甲型H1N1流感病例的实验室检测[J]. 王伟,潘明,常国辉,李晓丹,李天舒,秦成峰,贾娜,温乐英,高荣保,童文彬,何树森,王大燕,郭俊峰,蓝雨,杨磊,赵翔,李希研,李梓,邹淑梅,祝庆余,郭元吉,曹务春,李德新,舒跃龙. 病毒学报. 2009(S1)
[8]广东新型甲型H1N1病毒血凝素基因分子进化与变异[J]. 梁丽君,钟静,黄平,苏文哲,何剑峰,张欣,武婕,杨芬,邹丽容. 中华微生物学和免疫学杂志. 2013 (03)
本文编号：3063497
【文章来源】：现代预防医学. 2020,47(09)北大核心
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
宁夏2018-2019年甲型H1N1流感病毒病原学检测结果
对161株甲型H1N1毒株侧序结果与参考毒株及2017年宁夏分离株进行比对分析。根据分析结果,结合采集地区、采集时间及标本信息选取50株血凝素序列结果应用Mega6.0软件绘制基因种系发生树分析亲缘关系,进化树见图2(图中的进化树只包含部分毒株,剔除了部分位于进化树上相同终末分支的序列)。结果显示,整个进化树分为两个进化分支,疫苗株A/Califaoria/07/2009与国内代表株A/Sichuan/1/2009(H1N1)为同一进化分支,宁夏分离毒株与疫苗株A/Michigan/45/2015(H1N1)及2017年分离毒株高度同源为同一进化分支。宁夏分离毒株与参考毒株比较,发生了一定程度的变异,与国际疫苗株A/Califaoria/07/2009氨基酸的同源性为92.6%～96.3%、与国内代表A/Sichuan/1/2009(H1N1)氨基酸的同源性为91.3%～95.8%、与国际疫苗株A/Michigan/45/2015(H1N1)氨基酸的同源性相对较高为96.6%～98.1%。2.3 HA分子特征分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]河北省2011-2017年甲型H1N1流感流行及其基因特征分析[J]. 韩光跃,李岩,刘艳芳,刘兰芬,姜彩肖,齐顺祥. 中国病毒病杂志. 2017(04)
[2]湖北省大流行期和流行后期新甲型H1N1流感病毒基因特性分析[J]. 方斌,刘琳琳,李翔,叶国军,余晓,宋毅. 中华疾病控制杂志. 2017(01)
[3]2009-2015年中国甲型H1N1流感病毒血凝素基因进化分析[J]. 颜文娟,郭艳,李小杉,李伟,宣杨,宋玥,方坤,卫平民. 微生物学通报. 2017(02)
[4]2013-2014年宁夏甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因变异状况及序列分析[J]. 孙晓强,温秋芳,陈晓梅,袁芳,马学旻,马江涛,詹军. 宁夏医学杂志. 2016(01)
[5]2012年甲型H1N1流感病毒HA基因特征及抗原性分析[J]. 张晓春,黄韦唯,陈振华,陈恒. 现代预防医学. 2014(05)
[6]福建省甲型H1N1流感病毒分离及首例分离株全基因组序列分析[J]. 谢剑锋,沈晓娜,王美爱,张拥军,吴冰珊,陈炜,王金章,修文琼,朱莉莉,杨式芹,陈端,翁育伟,郑奎城,严延生. 中国人兽共患病学报. 2009(08)
[7]中国内地首例确诊甲型H1N1流感病例的实验室检测[J]. 王伟,潘明,常国辉,李晓丹,李天舒,秦成峰,贾娜,温乐英,高荣保,童文彬,何树森,王大燕,郭俊峰,蓝雨,杨磊,赵翔,李希研,李梓,邹淑梅,祝庆余,郭元吉,曹务春,李德新,舒跃龙. 病毒学报. 2009(S1)
[8]广东新型甲型H1N1病毒血凝素基因分子进化与变异[J]. 梁丽君,钟静,黄平,苏文哲,何剑峰,张欣,武婕,杨芬,邹丽容. 中华微生物学和免疫学杂志. 2013 (03)
本文编号：3063497
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