related genes in crucian carp Carassius auratus gibelio chal

  本文关键词：IBRV XA株的分离鉴定及其gD蛋白的原核表达，，由笔耕文化传播整理发布。

《中国水产学会鱼病专业委员会2013年学术研讨会论文摘要汇编》2013年

Suppression subtractive hybridization and real time RT-PCR reveal differentially expressed immune-related genes in crucian carp Carassius auratus gibelio challenged with Cyprinid herpesvirus 2

Lijuan Xu  Xiaobao Shen  Jun Xie  Dan Xu  Liqun Lu  

【摘要】：Since 2011,Cyprinid herpesvirus 2(CyHV-2)has been associated with the mortality ofcultured crucian carp Carassius auratus gibelio in east China,which was never reported beforedespite the fact that experimental infection of crucian carp by CyHV-2 had been successful inlaboratories outside of China.In this study,virus-free crucian carps were infected with 108CyHV-2 per fish by injection method,which resulted in a death rate of 95%with typical symptom.To study the role of innate immunity in response to viral infection,virus-induced genes wereidentified using suppression subtractive hybridisation(SSH)from moribund crucian carpchallenged with CyHV-2.A total of 500 clones from SSH forward library were sequenced,50genes were characterized to play a possible role in antiviral process.Among them,16 genes wereCyHV-2-encoded viral genes and 8 genes were immune-related host genes according to theirGene Ontology annotations of biological processes and molecular functions.The comparison ofinfected to uninfected crucian carps were performed using a quantitative real time RT-PCRapproach,which showed corresponding expression profiles for 7 of the 8 identifiedimmune-related genes including nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cellsinhibitor(nfkbiab),MHC class I(MHC I),intelectin,interleukin-11(IL-11),interleukin-10receptor(IL-10R),complement component C7-1(C7-1),purine nucleoside phosphorylase 5a(PNP5a)and serum amyloid A protein(SAA).Systematic tissue distribution of the identifiedimmune-related genes correlated with their potential involvement in immune response to CyHV-2,which displayed wide tissue tropism.These findings thus provide a basis for characterizing theantiviral immune-response of crucian carps and might be employed to select marker genes ofinterest in breeding crucian carps with CyHV-2 resistance.

【作者单位】：Key Laboratory of Aquatic Genetic Resources of Ministry of Agriculture,Shanghai Ocean University Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy of Fishery Sciences
【分类号】：S943
【正文快照】：

Suppression subtractive hybridization and real time RT-PCR reveal differentially expressed immune-related genes in crucian carp Carassius auratus gibelio challenged with Cyprinid herpesvirus 2@Lijuan Xu$Key Laboratory of Aquatic Genetic Resources of Mini

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