莆田黑猪DNA甲基化差异研究

发布时间：2018-03-13 09:40

  本文选题：DNA甲基化　切入点：莆田黑猪　出处：《福建农林大学》2016年硕士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：本研究采用MSAP技术检测莆田黑猪不同生长发育阶段不同组织基因组甲基化模式,并应用BSP技术分析莆田黑猪、杜洛克猪及其与莆田黑猪杂种杜莆猪的不同组织H-FABP基因启动子甲基化状态,旨在为地方猪选育和猪脂肪沉积的分子育种研究提供科学理论依据。1、采用MSAP技术,选择16对引物组合对莆田黑猪不同生长发育阶段基因组甲基化模式检测,主要结果如下：(1)1日龄甲基化水平,一共扩增条带12324个,其中半甲基化条带2510个,全甲基化条带3557个,非甲基化条带6257个。半甲基化水平中,肝脏的半甲基化水平分别显著高于心脏、肌肉、尾(P0.05)。全甲基化水平中,心脏的全甲基化水平显著高于肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾(P0.05)。总甲基水平化中,心脏的总甲基化水平显著高于肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾(P0.05)；尾的总甲基化水平分别显著高于肌肉、脂肪和耳(P0.05),分别显著低于心脏和肝脏(P0.05)。(2)25日龄甲基化水平,一共扩增条带11505个,其中半甲基化条带1997个,全甲基化条带3740个,非甲基化条带5768个。半甲基化水平中,心脏的半甲基化水平显著高于肌肉(P0.05)；肝脏的半甲基化水平显著低于脂肪(P0.05)；肌肉的半甲基化水平分别显著低于心脏、脂肪和耳(P0.05)。全甲基化水平中,心脏、肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾之间无显著差异性。总甲基化水平中,心脏的总甲基化水平显著高于肌肉(P0.05),显著低于脂肪和耳(P0.05)：肌肉的总甲基化水平分别显著低于心脏、脂肪、耳和尾(P0.05)。(3)210日龄甲基化水平,一共扩增条带11850个,其中半甲基化条带2294个,全甲基化条带2867个,非甲基化条带6689个。半甲基化水平中,心脏的半甲基化水平显著低于脂肪、耳和尾(P0.05)；肝脏的半甲基化水平显著低于脂肪、耳和尾(P0.05)：肌肉的半甲基化水平显著低于脂肪和耳(P0.05)。全甲基化水平中,心脏、肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾之间无显著差异性。总甲基化水平中,心脏的总甲基化水平显著低于尾(P0.05)；肝脏的总甲基化水平显著低于脂肪、耳和尾(P0.05)；肌肉的总甲基化水平显著低于脂肪和尾。2、莆田黑猪不同生长发育阶段心脏、肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾的全甲基化水平都高于半甲基化水平。3、莆田黑猪1日龄、25日龄和210日龄阶段平均总甲基化水平分别为50.67%、49.89%、43.55%,其随着年龄增长而降低。4、莆田黑猪相同生长发育阶段不同性别间半甲基化、全甲基化和总甲基化水平无明显的差异性,相同性别内半甲基化水平都要低于全甲基化,不同生长发育阶段公猪的总甲基化水平都略高于母猪。5、通过BSP法分析得出,莆田黑猪、杜洛克猪和杜莆猪心脏、肌肉和耳的H-FABP基因启动子甲基化在210日龄阶段均展现出较低甲基化水平。6、不同猪种中,心脏、肌肉和耳的H-FABP基因启动子甲基化水平均无显著差异性,相同组织在不同猪种中H-FABP基因启动子甲基化水平差异也不显著。7、莆田黑猪、杜洛克猪和杜莆猪心脏、肌肉和耳H-FABP基因启动子区的CpG位点甲基化状态分析得出,每种组织都检测出35个CpG位点,3种猪3种组织均有3个高度甲基化水平的CpG位点,且它们有相同的序列位置。
[Abstract]:This study uses MSAP technique to detect Putian black pigs at different growth stages of different DNA methylation patterns, and analysis of the application of BSP technology in Putian black pigs, Duroc pig H-FABP gene in different tissues and Putian black pig pig hybrid Du Pu promoter methylation status of.1 in order to provide a basis for scientific theory for molecular breeding of pig breeding and the fat deposition of pigs, using MSAP technology, 16 primer combinations of Putian black pigs in different growth patterns of the genomic methylation detection stage, the main results are as follows: (1) 1 day old methylation level, a total of 12324 amplified bands, of which half methylation band 2510, full methylation bands 3557, non methylated bands 6257. Half methylation level, semi methylation level of liver were significantly higher than that of the heart, muscle, tail (P0.05). The methylation level, total methylation level was significantly higher in heart 浜庤倽鑴，

本文编号：1605823