鹅线粒体COⅠ条形码及上游tRNA序列测定分析

发布时间：2018-03-26 19:37

  本文选题：鹅　切入点：基因条形码　出处：《浙江农业学报》2017年01期

【摘要】：为探索有效识别家禽(鹅)品种的线粒体DNA条形码,以对家禽品种或禽源产品进行鉴别,文章以鸿雁、灰雁、6个地方鹅种(中国、欧洲各3个)为试验群体,利用直接测序技术对所有个体的线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)进行测序,并分析多态性以及分子系统进化关系,同时对该区域上游tRNA的序列进行分析。结果表明,COⅠ该段序列(1 551 bp)共存在17个突变位点,形成20种单倍型,其中18种为各群体特有,可以作为群体鉴定的依据;除卡洛斯鹅外,其余7个群体中均发现有特异变异位点。基于Kiumura双参数距离所构建的单倍型NJ树能够充分反映不同群体的进化的亲缘关系。进一步分析发现了鸿雁线粒体序列有22种tRNA基因,均为标准4个恒定臂三叶草结构,其中tRNA-Ser和tRNA-Leu各有2个,其余仅有1个。选取的COⅠ该段序列可以作为部分鹅品种鉴定的依据。
[Abstract]:In order to explore the mitochondrial DNA barcode for the identification of poultry (goose) breeds and to identify poultry breeds or poultry products, Hongyan, gray goose and 6 local goose breeds (3 in China and 3 in Europe) were used as experimental populations in this paper. The mitochondrial cytochrome C oxidase subunit 鈪，

本文编号：1669323